小菜蛾氣味結(jié)合蛋白基因的鑒定及其表達(dá)模式分析
發(fā)布時(shí)間:2025-03-20 05:51
靈敏的嗅覺系統(tǒng)在昆蟲感知環(huán)境、定位寄主植物、躲避天敵和維持種群數(shù)量中起著重要的作用,對其生存繁衍具有重要的意義。氣味結(jié)合蛋白(odorant binding proteins, OBPs)作為轉(zhuǎn)運(yùn)脂溶性氣味化合物至嗅覺神經(jīng)樹突末端的載體,在昆蟲與外界環(huán)境信息交流過程中起到了重要作用。小菜蛾是十字花科作物上極難防治的重要害蟲,研究其氣味結(jié)合蛋白可為闡明小菜蛾的嗅覺機(jī)制,從而制定科學(xué)的管理和有效的防治措施奠定基礎(chǔ);谛〔硕昊蚪M與表達(dá)譜數(shù)據(jù),本研究采用生物信息學(xué)方法與實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù),對預(yù)測的小菜蛾氣味結(jié)合蛋白基因進(jìn)行了鑒定,并分析了該基因家族的基因結(jié)構(gòu)和基因表達(dá)模式,具體研究及結(jié)果如下:1.基于小菜蛾基因組數(shù)據(jù)共預(yù)測出39個(gè)OBPs基因,分布在20條不同的Scaffold上。其中11個(gè)OBPs基因位于Scaffold174,4個(gè)OBPs基因位于Scaffold44;5條Scaffold分別含有2個(gè)OBPs基因;13條Scaffold分別只有1個(gè)OBPs基因。2.對小菜蛾OBPs基因序列進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)OBPs主要由120-180個(gè)氨基酸組成...
【文章頁數(shù)】:58 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
1 前言
1.1 昆蟲的嗅覺感受機(jī)制
1.2 昆蟲氣味結(jié)合蛋白
1.2.1 氣味結(jié)合蛋白的種類
1.2.1.1 性信息素結(jié)合蛋白
1.2.1.2 普通氣味結(jié)合蛋白
1.2.1.3 觸角結(jié)合蛋白
1.2.2 氣味結(jié)合蛋白的結(jié)構(gòu)及其特性
1.2.3 氣味結(jié)合蛋白的組織表達(dá)及其功能
1.3 小菜蛾氣味結(jié)合蛋白的研究進(jìn)展
1.3.1 小菜蛾概述
1.3.2 小菜蛾氣味結(jié)合蛋白
1.4 本研究的意義
2 材料與方法
2.1 主要數(shù)據(jù)
2.1.1 小菜蛾基因組數(shù)據(jù)與表達(dá)譜數(shù)據(jù)
2.1.2 已知的氣味結(jié)合蛋白基因
2.1.3 分析軟件及工具
2.2 小菜蛾氣味結(jié)合蛋白基因的預(yù)測
2.2.1 本地比對
2.2.2 OBPs基因全長的獲得
2.3 小菜蛾氣味結(jié)合蛋白的進(jìn)化分析及基因結(jié)構(gòu)
2.4 小菜蛾氣味結(jié)合蛋白的表達(dá)模式分析
2.5 驗(yàn)證小菜蛾氣味結(jié)合蛋白的表達(dá)模式
2.5.1 供試?yán)ハx
2.5.2 試劑和儀器
2.5.3 小菜蛾組織的解剖
2.5.4 RNA的提取
2.5.5 RNA質(zhì)量檢測
2.5.6 cDNA的合成
2.5.7 實(shí)時(shí)熒光定量PCR
2.5.8 數(shù)據(jù)處理
3 結(jié)果與分析
3.1 小菜蛾氣味結(jié)合蛋白基因的預(yù)測
3.2 小菜蛾氣味結(jié)合蛋白的進(jìn)化分析
3.2.1 小菜蛾氣味結(jié)合蛋白的進(jìn)化分析
3.2.2 比較小菜蛾與其他物種氣味結(jié)合蛋白的進(jìn)化
3.3 小菜蛾氣味結(jié)合蛋白的表達(dá)模式分析
3.4 實(shí)時(shí)熒光定量PCR驗(yàn)證小菜蛾氣味結(jié)合蛋白的表達(dá)模式
3.4.1 RNA提取質(zhì)量
3.4.2 小菜蛾氣味結(jié)合蛋白在不同發(fā)育階段的表達(dá)情況
3.4.3 小菜蛾氣味結(jié)合蛋白在不同組織的表達(dá)情況
3.5 寄主植物氣味對小菜蛾氣味結(jié)合蛋白基因表達(dá)的影響
4 結(jié)論與討論
參考文獻(xiàn)
致謝
本文編號(hào):4037481
【文章頁數(shù)】:58 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
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Abstract
1 前言
1.1 昆蟲的嗅覺感受機(jī)制
1.2 昆蟲氣味結(jié)合蛋白
1.2.1 氣味結(jié)合蛋白的種類
1.2.1.1 性信息素結(jié)合蛋白
1.2.1.2 普通氣味結(jié)合蛋白
1.2.1.3 觸角結(jié)合蛋白
1.2.2 氣味結(jié)合蛋白的結(jié)構(gòu)及其特性
1.2.3 氣味結(jié)合蛋白的組織表達(dá)及其功能
1.3 小菜蛾氣味結(jié)合蛋白的研究進(jìn)展
1.3.1 小菜蛾概述
1.3.2 小菜蛾氣味結(jié)合蛋白
1.4 本研究的意義
2 材料與方法
2.1 主要數(shù)據(jù)
2.1.1 小菜蛾基因組數(shù)據(jù)與表達(dá)譜數(shù)據(jù)
2.1.2 已知的氣味結(jié)合蛋白基因
2.1.3 分析軟件及工具
2.2 小菜蛾氣味結(jié)合蛋白基因的預(yù)測
2.2.1 本地比對
2.2.2 OBPs基因全長的獲得
2.3 小菜蛾氣味結(jié)合蛋白的進(jìn)化分析及基因結(jié)構(gòu)
2.4 小菜蛾氣味結(jié)合蛋白的表達(dá)模式分析
2.5 驗(yàn)證小菜蛾氣味結(jié)合蛋白的表達(dá)模式
2.5.1 供試?yán)ハx
2.5.2 試劑和儀器
2.5.3 小菜蛾組織的解剖
2.5.4 RNA的提取
2.5.5 RNA質(zhì)量檢測
2.5.6 cDNA的合成
2.5.7 實(shí)時(shí)熒光定量PCR
2.5.8 數(shù)據(jù)處理
3 結(jié)果與分析
3.1 小菜蛾氣味結(jié)合蛋白基因的預(yù)測
3.2 小菜蛾氣味結(jié)合蛋白的進(jìn)化分析
3.2.1 小菜蛾氣味結(jié)合蛋白的進(jìn)化分析
3.2.2 比較小菜蛾與其他物種氣味結(jié)合蛋白的進(jìn)化
3.3 小菜蛾氣味結(jié)合蛋白的表達(dá)模式分析
3.4 實(shí)時(shí)熒光定量PCR驗(yàn)證小菜蛾氣味結(jié)合蛋白的表達(dá)模式
3.4.1 RNA提取質(zhì)量
3.4.2 小菜蛾氣味結(jié)合蛋白在不同發(fā)育階段的表達(dá)情況
3.4.3 小菜蛾氣味結(jié)合蛋白在不同組織的表達(dá)情況
3.5 寄主植物氣味對小菜蛾氣味結(jié)合蛋白基因表達(dá)的影響
4 結(jié)論與討論
參考文獻(xiàn)
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本文編號(hào):4037481
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