鎘脅迫下河南華溪蟹肝胰腺microRNA表達(dá)譜的研究
發(fā)布時(shí)間:2023-10-28 16:19
近年來,食品安全作為一項(xiàng)重要的民生問題,廣受社會民眾的關(guān)注。隨著經(jīng)濟(jì)快速增長,現(xiàn)代工業(yè)的不斷發(fā)展,水生生物重金屬鎘污染越加嚴(yán)重,對水產(chǎn)品的食品安全造成巨大影響,對人類產(chǎn)生多種健康危害。河南華溪蟹在我國分布廣泛,且對重金屬非常敏感,是監(jiān)測水生生物鎘污染的理想指示生物。通過研究鎘對河南華溪蟹的毒性效應(yīng)及其分子機(jī)制,有助于探究鎘污染對水生生物的生產(chǎn)繁殖和對水產(chǎn)品的食品安全的危害作用。肝胰腺是河南華溪蟹鎘積累的主要器官,也是鎘污染毒性危害的主要靶器官。本研究組前期通過生物化學(xué)、細(xì)胞生物學(xué)等方法揭示了鎘對河南華溪蟹肝胰腺的毒性效應(yīng),然而對其分子機(jī)制了解較少,特別是有關(guān)鎘污染對河南華溪蟹轉(zhuǎn)錄后調(diào)控機(jī)制的研究。此外,為了更好的模擬水生生物生長環(huán)境,本研究采用亞慢性鎘暴露方法,并選擇低濃度(0.5mg/L)作為鎘處理濃度。將河南華溪蟹隨機(jī)分為兩組:對照組和實(shí)驗(yàn)組(0.5mg/L),處理30天后取其肝胰腺進(jìn)行如下實(shí)驗(yàn)。(1)河南華溪蟹肝胰腺microRNA(miRNA)序列測定:對其進(jìn)行RNA的提取、cDNA文庫的構(gòu)建、原始序列的獲取、序列數(shù)據(jù)的篩選以及miRNA的分析。結(jié)果表明:在實(shí)驗(yàn)組和對照組的兩個(gè)...
【文章頁數(shù)】:62 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
中文摘要
ABSTRACT
第一章 綜述
1.1 重金屬鎘及其危害
1.1.1 重金屬鎘
1.1.2 鎘對食品安全性的影響
1.1.3 鎘對人的影響
1.1.3.1 鎘對人體器官的影響
1.1.3.2 鎘對神經(jīng)發(fā)育的影響
1.1.3.3 鎘對兒童智力和行為方面的影響
1.2 膳食鎘污染
1.2.1 水環(huán)境污染現(xiàn)狀
1.2.2 人類膳食結(jié)構(gòu)調(diào)整及水產(chǎn)品鎘污染情況
1.3 鎘對河南華溪蟹的影響研究進(jìn)展
1.3.1 鎘暴露后河南華溪蟹肝胰腺氧化損傷
1.3.2 鎘暴露后河南華溪蟹肝胰腺形態(tài)學(xué)變化
1.3.3 河南華溪蟹肝胰腺轉(zhuǎn)錄組測序和基因表達(dá)分析
1.4 本學(xué)位論文的研究內(nèi)容與意義
第二章 河南華溪蟹肝胰腺microRNA序列測定
2.1 材料和方法
2.1.1 實(shí)驗(yàn)動物
2.1.2 主要試劑及儀器
2.1.3 實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)
2.1.4 實(shí)驗(yàn)方法
2.1.4.1 河南華溪蟹肝胰腺樣本RNA的抽提和純化
2.1.4.2 河南華溪蟹肝胰腺樣本c DNA文庫的構(gòu)建
2.1.4.3 數(shù)據(jù)處理
2.2 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
2.2.1 河南華溪蟹肝胰腺實(shí)驗(yàn)組與對照組RNA序列分析
2.2.2 河南華溪蟹肝胰腺實(shí)驗(yàn)組和對照組miRNA的驗(yàn)證
2.2.3 樣本高質(zhì)量序列與已知數(shù)據(jù)庫比對分析結(jié)果
2.2.4 河南華溪蟹肝胰腺實(shí)驗(yàn)組和對照組miRNA基本信息的分析
2.2.5 河南華溪蟹miRNA信息與其他蟹種比對分析結(jié)果
2.3 討論
2.3.1 物種多樣性和組織特異性可能導(dǎo)致miRNA峰值的不同
2.3.2 河南華溪蟹肝胰腺中存在的miRNA具有特異性
2.3.3 許多miRNA在多種生物中存在并發(fā)揮重要作用
2.4 結(jié)論
第三章 河南華溪蟹肝胰腺對照組與實(shí)驗(yàn)組差異表達(dá)miRNA的鑒定以及qRT-PCR驗(yàn)證
3.1 材料與方法
3.1.1 實(shí)驗(yàn)動物
3.1.2 主要試劑及儀器
3.1.3 實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)
3.1.4 實(shí)驗(yàn)方法
3.1.4.1 實(shí)驗(yàn)組和對照組中發(fā)生差異化表達(dá)的miRNA的比較研究
3.1.4.2 qRT-PCR驗(yàn)證
3.1.4.3 數(shù)據(jù)處理
3.2 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
3.2.1 兩組之間發(fā)生差異表達(dá)的miRNA
3.2.2 通過qRT-PCR驗(yàn)證差異表達(dá)的miRNA
3.3 討論
3.4 結(jié)論
第四章 河南華溪蟹鎘暴露組肝胰腺組織中差異表達(dá)的miRNA生物信息學(xué)功能預(yù)測
4.1 材料與方法
4.1.1 實(shí)驗(yàn)動物
4.1.2 主要試劑與儀器
4.1.3 實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)
4.1.4 實(shí)驗(yàn)方法
4.1.4.1 目的基因預(yù)測與分析
4.1.4.2 差異表達(dá)基因的GO基因功能分析和KEGG途徑富集分析
4.2 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
4.2.1 河南華溪蟹鎘暴露組肝胰腺差異表達(dá)miRNA的靶基因預(yù)測
4.2.2 河南華溪蟹鎘暴露組肝胰腺miRNA生物信息學(xué)功能預(yù)測-GO基因功能分析
4.2.3 河南華溪蟹鎘暴露組肝胰腺miRNA生物信息學(xué)功能預(yù)測-KEGG代謝通路分析
4.3 討論
4.3.1 GO基因功能分類顯示,大多數(shù)靶基因與氧化還原酶的調(diào)控有關(guān)
4.3.2 KEGG代謝途徑結(jié)果表明,許多途徑與蛋白的生物合成、降解以及修飾等的調(diào)控有關(guān)
4.4 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
攻讀學(xué)位期間取得的研究成果
致謝
個(gè)人簡況及聯(lián)系方式
本文編號:3857342
【文章頁數(shù)】:62 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
中文摘要
ABSTRACT
第一章 綜述
1.1 重金屬鎘及其危害
1.1.1 重金屬鎘
1.1.2 鎘對食品安全性的影響
1.1.3 鎘對人的影響
1.1.3.1 鎘對人體器官的影響
1.1.3.2 鎘對神經(jīng)發(fā)育的影響
1.1.3.3 鎘對兒童智力和行為方面的影響
1.2 膳食鎘污染
1.2.1 水環(huán)境污染現(xiàn)狀
1.2.2 人類膳食結(jié)構(gòu)調(diào)整及水產(chǎn)品鎘污染情況
1.3 鎘對河南華溪蟹的影響研究進(jìn)展
1.3.1 鎘暴露后河南華溪蟹肝胰腺氧化損傷
1.3.2 鎘暴露后河南華溪蟹肝胰腺形態(tài)學(xué)變化
1.3.3 河南華溪蟹肝胰腺轉(zhuǎn)錄組測序和基因表達(dá)分析
1.4 本學(xué)位論文的研究內(nèi)容與意義
第二章 河南華溪蟹肝胰腺microRNA序列測定
2.1 材料和方法
2.1.1 實(shí)驗(yàn)動物
2.1.2 主要試劑及儀器
2.1.3 實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)
2.1.4 實(shí)驗(yàn)方法
2.1.4.1 河南華溪蟹肝胰腺樣本RNA的抽提和純化
2.1.4.2 河南華溪蟹肝胰腺樣本c DNA文庫的構(gòu)建
2.1.4.3 數(shù)據(jù)處理
2.2 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
2.2.1 河南華溪蟹肝胰腺實(shí)驗(yàn)組與對照組RNA序列分析
2.2.2 河南華溪蟹肝胰腺實(shí)驗(yàn)組和對照組miRNA的驗(yàn)證
2.2.3 樣本高質(zhì)量序列與已知數(shù)據(jù)庫比對分析結(jié)果
2.2.4 河南華溪蟹肝胰腺實(shí)驗(yàn)組和對照組miRNA基本信息的分析
2.2.5 河南華溪蟹miRNA信息與其他蟹種比對分析結(jié)果
2.3 討論
2.3.1 物種多樣性和組織特異性可能導(dǎo)致miRNA峰值的不同
2.3.2 河南華溪蟹肝胰腺中存在的miRNA具有特異性
2.3.3 許多miRNA在多種生物中存在并發(fā)揮重要作用
2.4 結(jié)論
第三章 河南華溪蟹肝胰腺對照組與實(shí)驗(yàn)組差異表達(dá)miRNA的鑒定以及qRT-PCR驗(yàn)證
3.1 材料與方法
3.1.1 實(shí)驗(yàn)動物
3.1.2 主要試劑及儀器
3.1.3 實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)
3.1.4 實(shí)驗(yàn)方法
3.1.4.1 實(shí)驗(yàn)組和對照組中發(fā)生差異化表達(dá)的miRNA的比較研究
3.1.4.2 qRT-PCR驗(yàn)證
3.1.4.3 數(shù)據(jù)處理
3.2 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
3.2.1 兩組之間發(fā)生差異表達(dá)的miRNA
3.2.2 通過qRT-PCR驗(yàn)證差異表達(dá)的miRNA
3.3 討論
3.4 結(jié)論
第四章 河南華溪蟹鎘暴露組肝胰腺組織中差異表達(dá)的miRNA生物信息學(xué)功能預(yù)測
4.1 材料與方法
4.1.1 實(shí)驗(yàn)動物
4.1.2 主要試劑與儀器
4.1.3 實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)
4.1.4 實(shí)驗(yàn)方法
4.1.4.1 目的基因預(yù)測與分析
4.1.4.2 差異表達(dá)基因的GO基因功能分析和KEGG途徑富集分析
4.2 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
4.2.1 河南華溪蟹鎘暴露組肝胰腺差異表達(dá)miRNA的靶基因預(yù)測
4.2.2 河南華溪蟹鎘暴露組肝胰腺miRNA生物信息學(xué)功能預(yù)測-GO基因功能分析
4.2.3 河南華溪蟹鎘暴露組肝胰腺miRNA生物信息學(xué)功能預(yù)測-KEGG代謝通路分析
4.3 討論
4.3.1 GO基因功能分類顯示,大多數(shù)靶基因與氧化還原酶的調(diào)控有關(guān)
4.3.2 KEGG代謝途徑結(jié)果表明,許多途徑與蛋白的生物合成、降解以及修飾等的調(diào)控有關(guān)
4.4 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
攻讀學(xué)位期間取得的研究成果
致謝
個(gè)人簡況及聯(lián)系方式
本文編號:3857342
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