稻殼素(momilactone)是一種具有生物活性的二萜類化合物,在植物病原體防御和化感中發(fā)揮重要作用,最早在稻殼中發(fā)現(xiàn)。絕大部分植物暫未有稻殼素研究報(bào)道,只有部分禾本科植物與非維管束苔蘚植物大灰蘚(Insomniella plumaeforme原拉丁名Hypnum plumaeforme)能分泌稻殼素,其中栽培水稻、野生稻和稗草基因組中都含有稻殼素生物合成基因簇。大灰蘚與禾本科植物屬于完全不同的植物學(xué)分類,便在進(jìn)化上引出了稻殼素起源的問(wèn)題。為進(jìn)一步探究大灰蘚基因組中稻殼素生物合成基因的分子結(jié)構(gòu)及不同物種中稻殼素生物合成基因的進(jìn)化關(guān)系,我們對(duì)基部植物大灰蘚基因組進(jìn)行測(cè)序、組裝和注釋,同時(shí)測(cè)定了稗草合成稻殼素的能力,并進(jìn)行植物基因組稻殼素基因簇的大規(guī)模分析。獲得如下主要結(jié)果:(1)大灰蘚基因組中存在一個(gè)150 Kb大小的區(qū)域,該區(qū)域內(nèi)包含串聯(lián)排列的兩個(gè)細(xì)胞色素P450基因,Ip DTC1/Hp DTC1基因和稻殼素A合酶(MAS)基因。酶功能預(yù)測(cè)和應(yīng)激性誘導(dǎo)實(shí)驗(yàn)證明了這些成簇基因是負(fù)責(zé)大灰蘚稻殼素生物合成的功能性基因簇;(2)稻田稗草可在稻瘟病菌誘導(dǎo)下合成稻殼素;(3)對(duì)已測(cè)序植物大范圍...

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【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【文章目錄】：
致謝
摘要
Abstract
1.緒論
    1.1 水稻化感
        1.1.1 化感作用
        1.1.2 水稻的化感作用
        1.1.3 化感物質(zhì)稻殼素的發(fā)現(xiàn)
        1.1.4 稻殼素的作用
        1.1.5 稻殼素的合成機(jī)制
    1.2 基因簇
        1.2.1 基因簇起源模型
        1.2.2 基因簇的鑒定
        1.2.3 稻殼素基因簇相關(guān)基因
    1.3 其他植物與稻殼素
        1.3.1 稗草與稻殼素
        1.3.2 大灰蘚與稻殼素
    1.4 研究?jī)?nèi)容和目的意義
2.材料與方法
    2.1 實(shí)驗(yàn)材料與測(cè)序
    2.2 生物信息學(xué)分析和實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證
        2.2.1 基因組拼接、組裝和注釋
        2.2.2 系統(tǒng)發(fā)生樹和分化時(shí)間估計(jì)
        2.2.3 植物基因組中稻殼素基因簇的鑒定
        2.2.4 RNA提取和定量RT-PCR
        2.2.5 IpMAS基因功能鑒定
        2.2.6 裂殖酵母中3OH-syn-pimaradienolide的生物轉(zhuǎn)化
        2.2.7 IpCYP1和IpCYP2 基因功能鑒定
3.結(jié)果
    3.1 大灰蘚基因組拼接、組裝和注釋
    3.2 大灰蘚基因組的進(jìn)化
    3.3 大灰蘚基因組中稻殼素基因簇的鑒定
    3.4 稻殼素成簇基因的酶功能
    3.5 稗草中稻殼素的測(cè)定
    3.6 植物中稻殼素基因簇的進(jìn)化
4.小結(jié)與討論
參考文獻(xiàn)
附錄
碩士期間發(fā)表的論文



本文編號(hào)：3784793