新月柄桿菌多糖脫乙酰化酶基因克隆表達(dá)及活性評(píng)價(jià)
發(fā)布時(shí)間:2022-12-04 01:32
生物粘合劑具有良好的生物相容性和可降解性,可以替代傳統(tǒng)的縫合技術(shù),在生物醫(yī)藥領(lǐng)域已被受到廣泛關(guān)注。新月柄桿菌(Caulobacter crescentus CB15)能分泌迄今為止粘附能力最強(qiáng)的水下天然粘性物質(zhì)-holdfast,其合成和分泌途徑是一個(gè)復(fù)雜的過程,其中hfsH基因編碼的多糖脫乙;甘怯绊懻承缘年P(guān)鍵因素。因此,本論文以新月柄桿菌hfsH基因?yàn)檠芯繉?duì)象,對(duì)其密碼子進(jìn)行優(yōu)化及生物信息學(xué)分析,并進(jìn)行了克隆和可溶性表達(dá),在利用鎳柱親和層析分析純化重組酶的基礎(chǔ)上,對(duì)其生物學(xué)活性進(jìn)行了初步評(píng)價(jià)。主要研究?jī)?nèi)容有以下幾部分:第一部分:新月柄桿菌hfsH基因分析及載體構(gòu)建。對(duì)hfsH基因的原始序列進(jìn)行密碼子優(yōu)化,并利用RNAfold在線軟件對(duì)優(yōu)化前后hfsH基因序列的5′和3′端mRNA二級(jí)結(jié)構(gòu)的自由能及GC含量進(jìn)行分析。結(jié)果發(fā)現(xiàn),優(yōu)化后的序列自由能降低,GC含量從71%降至67%,更利于后期表達(dá)。生物信息學(xué)分析表明,有5個(gè)相對(duì)保守的氨基酸功能域分別是Motif 1(T(F/Y)DD)、Motif 2(H(S/T)xxH)、Motif 3(RxPY)、Motif 4(DxxD(W/Y)及...
【文章頁(yè)數(shù)】:82 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
abstract
術(shù)語(yǔ)與縮略語(yǔ)表
第一章 緒論
1.1 生物粘合劑
1.2 源于新月柄桿菌的超高粘附物質(zhì)holdfast概述
1.2.1 新月柄桿菌
1.2.2 新月柄桿菌分泌物-holdfast
1.2.3 Holdfast的化學(xué)結(jié)構(gòu)
1.2.4 Holdfast的生物合成
1.3 多糖脫乙酰化酶的研究現(xiàn)狀
1.3.1 多糖脫乙;父攀
1.3.2 來源與分類
1.3.3 多糖脫乙;傅慕Y(jié)構(gòu)特點(diǎn)
1.3.4 多糖脫乙;傅牡孜镱愋图疤卣
1.3.5 多糖脫乙酰化酶的催化機(jī)制
1.3.6 多糖脫乙;傅膽(yīng)用前景
1.4 研究目的及意義
第二章 新月柄桿菌多糖脫乙;富虻纳镄畔W(xué)分析及載體構(gòu)建
2.1 實(shí)驗(yàn)材料
2.1.1 菌種與載體
2.1.2 實(shí)驗(yàn)試劑
2.1.3 實(shí)驗(yàn)儀器
2.1.4 培養(yǎng)基的配制
2.1.5 標(biāo)準(zhǔn)溶液的配制
2.2 實(shí)驗(yàn)方法
2.2.1 新月柄桿菌hfsH基因功能的生物信息學(xué)分析
2.2.2 新柄桿菌hfsH基因的序列優(yōu)化
2.2.3 新月柄桿菌hfsH基因克隆
2.2.4 PCR產(chǎn)物的回收
2.2.5 pET-28a(+)-hfsH重組表達(dá)載體構(gòu)建流程
2.2.6 PCR回收產(chǎn)物和pET-28a(+)載體的雙酶切
2.2.7 連接
2.2.8 轉(zhuǎn)化
2.2.9 pET-28a(+)-hfsH重組質(zhì)粒提取
2.2.10 pET-28a(+)-hfsH重組質(zhì)粒酶切鑒定
2.2.11 pET-28a(+)-hfsH重組質(zhì)粒測(cè)序及菌種保藏
2.3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果與分析
2.3.1 生物信息學(xué)分析
2.3.2 hfsH基因序列的優(yōu)化及分析
2.3.3 PCR擴(kuò)增產(chǎn)物及分析
2.3.4 酶切電泳檢測(cè)結(jié)果及分析
2.3.5 pET-28a(+)-hfsH重組質(zhì)粒酶切鑒定結(jié)果及分析
2.3.6 pET-28a(+)-hfsH重組質(zhì)粒序列測(cè)定結(jié)果及分析
2.4 討論
第三章 新月柄桿菌多糖脫乙酰化酶基因的表達(dá)及重組蛋白純化
3.1 實(shí)驗(yàn)材料
3.1.1 菌種和質(zhì)粒
3.1.2 實(shí)驗(yàn)試劑
3.1.3 實(shí)驗(yàn)儀器
3.1.4 標(biāo)準(zhǔn)溶液的配制
3.2 實(shí)驗(yàn)方法
3.2.1 新月柄桿菌hfsH基因誘導(dǎo)表達(dá)
3.2.2 SDS-PAGE凝膠電泳檢測(cè)
3.2.3 誘導(dǎo)表達(dá)條件的優(yōu)化
3.2.4 重組HfsH蛋白純化
3.2.5 蛋白濃度的測(cè)定
3.2.6 N端測(cè)序鑒定
3.3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果與分析
3.3.1 大腸桿菌生長(zhǎng)曲線
3.3.2 hfsH基因表達(dá)及條件優(yōu)化結(jié)果
3.3.3 重組HfsH蛋白的純化結(jié)果
3.3.4 重組HfsH蛋白N端測(cè)序鑒定
3.3.5 重組HfsH蛋白濃度的測(cè)定
3.4 討論
第四章 新月柄桿菌多糖脫乙;傅幕钚苑治
4.1 實(shí)驗(yàn)材料
4.1.1 實(shí)驗(yàn)試劑
4.1.2 實(shí)驗(yàn)儀器
4.1.3 標(biāo)準(zhǔn)溶液的配制
4.2 實(shí)驗(yàn)方法
4.2.1 酶活方法的建立
4.2.2 重組HfsH最適溫度的測(cè)定
4.2.3 重組HfsH最適pH的測(cè)定
4.3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果及分析
4.3.1 標(biāo)準(zhǔn)曲線繪制
4.3.2 活性測(cè)定結(jié)果
4.3.3 酶濃度對(duì)酶活性的影響
4.3.4 最適反應(yīng)溫度及分析
4.3.5 最適反應(yīng)pH及分析
4.4 討論
第五章 全文結(jié)論
參考文獻(xiàn)
致謝
攻讀碩士期間取得的科研成果
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]重組Trail蛋白在大腸桿菌中的表達(dá)及純化條件的優(yōu)化[J]. 蔡媛媛,李雪燕,吳玉,杜晶春,徐霞. 細(xì)胞與分子免疫學(xué)雜志. 2012(06)
[2]塞內(nèi)昔布抑制兔脈絡(luò)膜新生血管的形成[J]. 喬崗,周希瑗,鄧鑫,李琳. 眼視光學(xué)雜志. 2005(04)
本文編號(hào):3707354
【文章頁(yè)數(shù)】:82 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
abstract
術(shù)語(yǔ)與縮略語(yǔ)表
第一章 緒論
1.1 生物粘合劑
1.2 源于新月柄桿菌的超高粘附物質(zhì)holdfast概述
1.2.1 新月柄桿菌
1.2.2 新月柄桿菌分泌物-holdfast
1.2.3 Holdfast的化學(xué)結(jié)構(gòu)
1.2.4 Holdfast的生物合成
1.3 多糖脫乙酰化酶的研究現(xiàn)狀
1.3.1 多糖脫乙;父攀
1.3.2 來源與分類
1.3.3 多糖脫乙;傅慕Y(jié)構(gòu)特點(diǎn)
1.3.4 多糖脫乙;傅牡孜镱愋图疤卣
1.3.5 多糖脫乙酰化酶的催化機(jī)制
1.3.6 多糖脫乙;傅膽(yīng)用前景
1.4 研究目的及意義
第二章 新月柄桿菌多糖脫乙;富虻纳镄畔W(xué)分析及載體構(gòu)建
2.1 實(shí)驗(yàn)材料
2.1.1 菌種與載體
2.1.2 實(shí)驗(yàn)試劑
2.1.3 實(shí)驗(yàn)儀器
2.1.4 培養(yǎng)基的配制
2.1.5 標(biāo)準(zhǔn)溶液的配制
2.2 實(shí)驗(yàn)方法
2.2.1 新月柄桿菌hfsH基因功能的生物信息學(xué)分析
2.2.2 新柄桿菌hfsH基因的序列優(yōu)化
2.2.3 新月柄桿菌hfsH基因克隆
2.2.4 PCR產(chǎn)物的回收
2.2.5 pET-28a(+)-hfsH重組表達(dá)載體構(gòu)建流程
2.2.6 PCR回收產(chǎn)物和pET-28a(+)載體的雙酶切
2.2.7 連接
2.2.8 轉(zhuǎn)化
2.2.9 pET-28a(+)-hfsH重組質(zhì)粒提取
2.2.10 pET-28a(+)-hfsH重組質(zhì)粒酶切鑒定
2.2.11 pET-28a(+)-hfsH重組質(zhì)粒測(cè)序及菌種保藏
2.3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果與分析
2.3.1 生物信息學(xué)分析
2.3.2 hfsH基因序列的優(yōu)化及分析
2.3.3 PCR擴(kuò)增產(chǎn)物及分析
2.3.4 酶切電泳檢測(cè)結(jié)果及分析
2.3.5 pET-28a(+)-hfsH重組質(zhì)粒酶切鑒定結(jié)果及分析
2.3.6 pET-28a(+)-hfsH重組質(zhì)粒序列測(cè)定結(jié)果及分析
2.4 討論
第三章 新月柄桿菌多糖脫乙酰化酶基因的表達(dá)及重組蛋白純化
3.1 實(shí)驗(yàn)材料
3.1.1 菌種和質(zhì)粒
3.1.2 實(shí)驗(yàn)試劑
3.1.3 實(shí)驗(yàn)儀器
3.1.4 標(biāo)準(zhǔn)溶液的配制
3.2 實(shí)驗(yàn)方法
3.2.1 新月柄桿菌hfsH基因誘導(dǎo)表達(dá)
3.2.2 SDS-PAGE凝膠電泳檢測(cè)
3.2.3 誘導(dǎo)表達(dá)條件的優(yōu)化
3.2.4 重組HfsH蛋白純化
3.2.5 蛋白濃度的測(cè)定
3.2.6 N端測(cè)序鑒定
3.3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果與分析
3.3.1 大腸桿菌生長(zhǎng)曲線
3.3.2 hfsH基因表達(dá)及條件優(yōu)化結(jié)果
3.3.3 重組HfsH蛋白的純化結(jié)果
3.3.4 重組HfsH蛋白N端測(cè)序鑒定
3.3.5 重組HfsH蛋白濃度的測(cè)定
3.4 討論
第四章 新月柄桿菌多糖脫乙;傅幕钚苑治
4.1 實(shí)驗(yàn)材料
4.1.1 實(shí)驗(yàn)試劑
4.1.2 實(shí)驗(yàn)儀器
4.1.3 標(biāo)準(zhǔn)溶液的配制
4.2 實(shí)驗(yàn)方法
4.2.1 酶活方法的建立
4.2.2 重組HfsH最適溫度的測(cè)定
4.2.3 重組HfsH最適pH的測(cè)定
4.3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果及分析
4.3.1 標(biāo)準(zhǔn)曲線繪制
4.3.2 活性測(cè)定結(jié)果
4.3.3 酶濃度對(duì)酶活性的影響
4.3.4 最適反應(yīng)溫度及分析
4.3.5 最適反應(yīng)pH及分析
4.4 討論
第五章 全文結(jié)論
參考文獻(xiàn)
致謝
攻讀碩士期間取得的科研成果
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]重組Trail蛋白在大腸桿菌中的表達(dá)及純化條件的優(yōu)化[J]. 蔡媛媛,李雪燕,吳玉,杜晶春,徐霞. 細(xì)胞與分子免疫學(xué)雜志. 2012(06)
[2]塞內(nèi)昔布抑制兔脈絡(luò)膜新生血管的形成[J]. 喬崗,周希瑗,鄧鑫,李琳. 眼視光學(xué)雜志. 2005(04)
本文編號(hào):3707354
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