人體腸道內(nèi)的各種微生物對宿主的健康和疾病起著重要的作用。許多研究表明,微生物組中某些細(xì)菌數(shù)量的增加或減少可以緩解疾病。雖然關(guān)于微生物的變化是如何改善人類疾病的機(jī)制研究并不多,但這些內(nèi)在機(jī)制的深入研究卻非常重要。對這些已知信息的整理收集能夠幫助我們更加全面了解腸道微生物的作用機(jī)制,有效推動微生物治療的發(fā)展�；诖�,我們構(gòu)建了一個叫作GMAHD（the database of how Gut Microbes Affect Human Diseases）的數(shù)據(jù)庫,收集歸納這些已知的機(jī)制信息。目前數(shù)據(jù)庫共有121條記錄涉及83種腸道微生物和34種疾病,該在線數(shù)據(jù)庫可以通過http://cefg.uestc.cn/gmahd訪問,所有的數(shù)據(jù)都可以免費(fèi)下載且無需注冊。腸道微生物能合成不同的代謝物,這些代謝物是潛在的候選藥物,因此在GMAHD中,我們還增加了腸道微生物的代謝物信息。我們結(jié)合了HMDAD（http://www.cuilab.cn/hmdad）數(shù)據(jù)庫的疾病與微生物關(guān)聯(lián)信息,最終共有39種疾病被納入我們的基于腸道微生物代謝物的疾病關(guān)聯(lián)分析,這些信息均源自于已有的研究文獻(xiàn)。在我們收集的文獻(xiàn)... 

【文章頁數(shù)】：48 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
abstract
第一章 緒論
    1.1 腸道微生物與疾病關(guān)系的研究現(xiàn)狀
        1.1.1 腸道微生物概述
        1.1.2 腸道微生物與癌癥
        1.1.3 腸道微生物與糖尿病
    1.2 腸道微生物數(shù)據(jù)庫介紹
    1.3 腸道微生物代謝物作為潛在藥物的研究現(xiàn)狀
    1.4 本論文結(jié)構(gòu)安排
第二章 腸道微生物機(jī)制數(shù)據(jù)庫的構(gòu)建
    2.1 引言
    2.2 數(shù)據(jù)來源與處理
        2.2.1 主要流程
        2.2.2 數(shù)據(jù)類型
        2.2.3 數(shù)據(jù)總結(jié)
    2.3 GMAHD的網(wǎng)頁
    2.4 本章小結(jié)
第三章 基于微生物代謝物的疾病關(guān)聯(lián)分析
    3.1 引言
    3.2 基于腸道微生物代謝物的疾病網(wǎng)絡(luò)分析
        3.2.1 微生物代謝物與疾病數(shù)據(jù)收集
        3.2.2 微生物代謝物與疾病關(guān)系量化
        3.2.3 利用余弦值去冗余
        3.2.4 網(wǎng)絡(luò)分析結(jié)果
        3.2.5 疾病聚類分析
    3.3 與其他疾病網(wǎng)絡(luò)比較
        3.3.1 與基于微生物的疾病網(wǎng)絡(luò)比較
        3.3.2 與疾病癥狀和基因/PPI網(wǎng)絡(luò)比較
        3.3.3 疾病網(wǎng)絡(luò)的敏感性分析
    3.4 挖掘有益代謝物的交并補(bǔ)法
        3.4.1 交并補(bǔ)法介紹
        3.4.2 結(jié)果的文獻(xiàn)論證
        3.4.3 比較疾病關(guān)聯(lián)分析法(矩陣法)的結(jié)果
    3.5 本章小結(jié)
第四章 全文總結(jié)及展望
致謝
參考文獻(xiàn)
攻讀碩士學(xué)位期間取得的研究成果


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]探索維生素命名的奧秘[J]. 趙云茜.  中國科技術(shù)語. 2017(04)
[2]腸道菌群與疾病關(guān)系的研究進(jìn)展[J]. 郭慧玲,邵玉宇,孟和畢力格,張和平.  微生物學(xué)通報. 2015(02)
[3]Fecal microbiota transplantation for severe enterocolonic fistulizing Crohn’s disease[J]. Fa-Ming Zhang,Hong-Gang Wang,Min Wang,Bo-Ta Cui,Zhi-Ning Fan,Guo-Zhong Ji.  World Journal of Gastroenterology. 2013(41)



本文編號：3697932