EDAG/THAP11相互作用調(diào)控HSC功能的分子機制研究
發(fā)布時間:2022-02-21 16:48
造血干細胞(HSC,Hematopoietic stem cell)是血液系統(tǒng)各種成熟細胞的最初來源,其通過自我更新來維持HSC群體的穩(wěn)定,通過定向分化產(chǎn)生各種造血祖細胞進而分化成各種成熟血細胞。自我更新與分化的平衡是長期維持造血功能所必須的,其調(diào)控是個復雜的過程。轉(zhuǎn)錄因子是調(diào)控造血干細胞功能的驅(qū)動力,轉(zhuǎn)錄因子往往通過蛋白質(zhì)相互作用的方式發(fā)揮精確的轉(zhuǎn)錄調(diào)控作用。EDAG(Erythroid differentiation-associated gene)是一種造血組織特異表達并可調(diào)節(jié)造血干細胞增殖與分化的重要轉(zhuǎn)錄輔助因子,具有雙重轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)活性。對EDAG結(jié)構(gòu)分析發(fā)現(xiàn)該蛋白雖然可調(diào)節(jié)多種基因的表達,但并不具備任何已知的DNA結(jié)合結(jié)構(gòu)域,我們推測很可能是通過與其他轉(zhuǎn)錄因子相互作用,發(fā)揮轉(zhuǎn)錄調(diào)控作用。THAP11(Thanatos-associated protein11)是THAP家族中的一員,其是一種含有C2-CH鋅指DNA結(jié)合結(jié)構(gòu)域,能夠識別一段15bp(ACTACNNT CCCAG)左右雙鏈DNA序列的轉(zhuǎn)錄因子。已知THAP11在胚胎干細胞的存活及多能性維持中發(fā)揮重要作用,但在造血干...
【文章來源】:安徽醫(yī)科大學安徽省
【文章頁數(shù)】:118 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
前言
1.轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控網(wǎng)絡對HSC的影響
2.線粒體與HSC命運
3.ChIP/ChIP-Seq技術(shù)
4.EDAG(Erythroid differentiation-associated gene)基因
5.THAP11(Thanatos-associated protein 11)基因
第一部分 利用表達譜芯片篩選EDAG與THAP11敲低后表達變化基因
1.引言
2.材料與方法
2.1 實驗材料
2.2 實驗方法
3.結(jié)果
3.1 敲低THAP11 K562細胞株的建立
3.2 敲低EDAG K562細胞株的建立
3.3 基因表達譜芯片確定表達差異基因
3.4 表達差異基因驗證及整合分析
4.討論
第二部分 利用ChIP-Seq技術(shù)篩選EDAG與THAP1在染色體上的結(jié)合譜
1.引言
2.材料與方法
2.1 實驗材料
2.2 實驗方法
3.結(jié)果
3.1 ChIP條件的確定
3.2 ChIP-seq確定靶基因
3.3 EDAG/THAP11靶基因整合分析
4.討論
第三部分 數(shù)據(jù)的整合、分析與驗證
1.引言
2.材料與方法
2.1 實驗材料
2.2 實驗方法
3.結(jié)果
3.1 數(shù)據(jù)的整合分析
3.2 報告基因驗證EDAG/THAP11的調(diào)控作用
3.3 EDAG/THAP11對線粒體的影響
4.討論
第四部分THAP11條敲小鼠的制備與初步表型分析
1.引言
2 材料與方法
2.1 實驗材料
2.2 實驗方法
3.結(jié)果
3.1 Ronin條件性敲除小鼠鑒定
3.2 Ronin~(loxp/+)Vav-Cre~(Tg)小鼠表型初步鑒定
4.討論
結(jié)論
參考文獻
附錄
個人簡歷
致謝
綜述
參考文獻
【參考文獻】:
期刊論文
[1]EDAG-1在白血病和淋巴瘤細胞株中的表達[J]. 周穎,許望翔,詹軼群,李長燕,徐誠望,鄭紅,李菲菲,楊曉明,汪思應. 癌癥. 2004(11)
[2]在NIH3T3細胞中高表達EDAG-1基因?qū)е录毎麗盒赞D(zhuǎn)化[J]. 閭軍,許望翔,汪思應,江巖,李長燕,蔡衛(wèi)民,楊曉明. 生物化學與生物物理學報. 2002(01)
[3]EDAG-1,一種與造血調(diào)控密切相關新基因的分離和確認[J]. 閭軍,許望翔,汪思應,詹軼群,江巖,蔡衛(wèi)民,楊曉明. 生物化學與生物物理學報. 2001(06)
本文編號:3637662
【文章來源】:安徽醫(yī)科大學安徽省
【文章頁數(shù)】:118 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
前言
1.轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控網(wǎng)絡對HSC的影響
2.線粒體與HSC命運
3.ChIP/ChIP-Seq技術(shù)
4.EDAG(Erythroid differentiation-associated gene)基因
5.THAP11(Thanatos-associated protein 11)基因
第一部分 利用表達譜芯片篩選EDAG與THAP11敲低后表達變化基因
1.引言
2.材料與方法
2.1 實驗材料
2.2 實驗方法
3.結(jié)果
3.1 敲低THAP11 K562細胞株的建立
3.2 敲低EDAG K562細胞株的建立
3.3 基因表達譜芯片確定表達差異基因
3.4 表達差異基因驗證及整合分析
4.討論
第二部分 利用ChIP-Seq技術(shù)篩選EDAG與THAP1在染色體上的結(jié)合譜
1.引言
2.材料與方法
2.1 實驗材料
2.2 實驗方法
3.結(jié)果
3.1 ChIP條件的確定
3.2 ChIP-seq確定靶基因
3.3 EDAG/THAP11靶基因整合分析
4.討論
第三部分 數(shù)據(jù)的整合、分析與驗證
1.引言
2.材料與方法
2.1 實驗材料
2.2 實驗方法
3.結(jié)果
3.1 數(shù)據(jù)的整合分析
3.2 報告基因驗證EDAG/THAP11的調(diào)控作用
3.3 EDAG/THAP11對線粒體的影響
4.討論
第四部分THAP11條敲小鼠的制備與初步表型分析
1.引言
2 材料與方法
2.1 實驗材料
2.2 實驗方法
3.結(jié)果
3.1 Ronin條件性敲除小鼠鑒定
3.2 Ronin~(loxp/+)Vav-Cre~(Tg)小鼠表型初步鑒定
4.討論
結(jié)論
參考文獻
附錄
個人簡歷
致謝
綜述
參考文獻
【參考文獻】:
期刊論文
[1]EDAG-1在白血病和淋巴瘤細胞株中的表達[J]. 周穎,許望翔,詹軼群,李長燕,徐誠望,鄭紅,李菲菲,楊曉明,汪思應. 癌癥. 2004(11)
[2]在NIH3T3細胞中高表達EDAG-1基因?qū)е录毎麗盒赞D(zhuǎn)化[J]. 閭軍,許望翔,汪思應,江巖,李長燕,蔡衛(wèi)民,楊曉明. 生物化學與生物物理學報. 2002(01)
[3]EDAG-1,一種與造血調(diào)控密切相關新基因的分離和確認[J]. 閭軍,許望翔,汪思應,詹軼群,江巖,蔡衛(wèi)民,楊曉明. 生物化學與生物物理學報. 2001(06)
本文編號:3637662
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