兩個(gè)新型硫酸皮膚素裂解酶的鑒定和應(yīng)用
發(fā)布時(shí)間:2022-01-01 02:10
硫酸軟骨素/硫酸皮膚素(Chondroitin Sulfate/Dermatan Sulfate,CS/DS)是一類直鏈線性聚陰離子多糖,由重復(fù)二糖單位組成。CS二糖單位的結(jié)構(gòu)為由β-1,3糖苷鍵連接的葡萄糖醛酸(GlcUA)和N-乙酰半乳糖胺(GalNAc),二糖單位之間由β-1,4糖苷鍵連接而成CS的基本糖鏈骨架;當(dāng)CS二糖單位中的GlcUA在C-5差向異構(gòu)酶的作用下變?yōu)榘盘侨┧幔↖doUA)時(shí),形成了 DS二糖單位。其中,GlcUA或IdoUA的C-2、C-3位和GalNAc的C-4、C-6位在硫酸基轉(zhuǎn)移酶的作用下會(huì)發(fā)生不同程度的硫酸化而形成不同硫酸化模式的二糖單位,從而產(chǎn)生結(jié)構(gòu)高度復(fù)雜的CS/DS糖鏈結(jié)構(gòu)。CS/DS是一類重要的糖胺聚糖(Glycosaminoglycan,GAG),作為蛋白聚糖(Proteoglycans,PGs)的側(cè)鏈而存在。CS/DS鏈的結(jié)構(gòu)高度復(fù)雜性賦予了其不同的生物活性,如參與細(xì)胞生長,細(xì)胞粘附,病毒的侵染,神經(jīng)系統(tǒng)的發(fā)育等等。序列的不均一性,二糖排列的多變,糖醛酸的異構(gòu)化尤其是硫酸化模式的不同使得CS/DS的結(jié)構(gòu)與功能的研究面臨巨大的挑戰(zhàn)。CD/D...
【文章來源】:山東大學(xué)山東省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:78 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
圖1-2部分GAGs裂解酶的降解模式[23]??1.3.1?CSaseABC??
山東大碩被第一次鑒定[36],是一種外切型裂解酶,可以將CS糖鏈中的GalNAc和GIcA??之間的(3-1,4糖苷鍵斷裂,產(chǎn)生一系列的寡糖,主要為不飽和二糖結(jié)構(gòu),如圖1-??3所示。CSase?ACII也對(duì)透明質(zhì)酸有降解活性,可以降解HA中的GlcNAc和??GlcA之間的p-l,4糖苷鍵,但是它卻不可以降解DS。CSaseAClI表現(xiàn)出一種外??切酶的作用模式,它可以從多糖鏈的非還原端一次切下一個(gè)二糖單位。CSaseAC??I發(fā)現(xiàn)于肝素黃桿菌?/r/〇fvoAocto"/MW?Aepar/www,是一種內(nèi)切酶,可以隨機(jī)切割HA??和CS糖鏈中己糖胺GlcNAc和GalNAc與己糖醛酸GlcA之間的p-1,4糖苷鍵,??但同樣不能降解DS糖鏈中GalNAc和IdoUA之間的P-1,4糖苷鍵137,38】。??
山東大學(xué)碩士學(xué)位論文??■"…=:“.|??—5S??圖2-3?DLase?1?(左)和DLase?2?(右)的表達(dá)和純化后的SDS-PAGE電泳圖??泳道1:標(biāo)準(zhǔn)蛋白Marker,?SM0431?(Thermo),其每條條帶代表的分子量己在旁邊標(biāo)出;泳??道2:未經(jīng)誘導(dǎo)的DLase?1細(xì)胞裂解液;泳道3:誘導(dǎo)過的DLase?1細(xì)胞裂解液;泳道4:誘??導(dǎo)過的DLase?1細(xì)胞裂解液上清;泳道5:純化后的DLase?1蛋白;泳道6:標(biāo)準(zhǔn)蛋白Marker,??SM0431?(Thermo);泳道7:未經(jīng)誘導(dǎo)的DLase2細(xì)胞裂解液;泳道8:誘導(dǎo)過的DLase2細(xì)??胞裂解液;泳道9:誘導(dǎo)過的DLase?2細(xì)胞裂解液上清;泳道10:純化后的DLase?2蛋白。??2.4本章小結(jié)??本章利用生物信息學(xué)分析,從基因數(shù)據(jù)庫中發(fā)現(xiàn)了兩個(gè)疑似DS專一性裂解??酶基因說似ei?(GenBank?編號(hào):WP?013634816.1?)和也觀?2?(GenBank?編??號(hào):SCH丨3530.1),這兩個(gè)候選基因與已鑒定的5的相似度分別為57%和??43%。對(duì)兩個(gè)疑似基因及其編碼蛋白序列的分析表明:說似e?7基因全長為1473??bp,?GC含量為49.08%,編碼的蛋白包含491個(gè)氨基酸,理論分子量為55.35?kDa,??pi為8.60,其N端信號(hào)肽包含21個(gè)氨基酸;基因全長為1401bp,GC含??量為48.61%,編碼的蛋白含有467個(gè)氨基酸,理論分子量為52.00?kDa,?pi為??6.18,其N端信號(hào)肽包含19個(gè)氨基酸。進(jìn)一步,通過全基因合成,基因重組和??蛋白質(zhì)親和純化等技術(shù),對(duì)這兩個(gè)潛在的新型DS專一性降解酶DLas
【參考文獻(xiàn)】:
博士論文
[1]一種硫酸軟骨素E降解抗性的糖胺聚糖裂解酶的鑒定與應(yīng)用[D]. 彭春娥.山東大學(xué) 2018
碩士論文
[1]美洲大赤魷來源新型硫酸軟骨素的制備及抗腫瘤轉(zhuǎn)移活性研究[D]. 王慶彬.山東大學(xué) 2016
[2]鵝魚皮膠原蛋白與硫酸皮膚素的同時(shí)提取及其結(jié)構(gòu)、活性研究[D]. 楊陽.浙江工商大學(xué) 2015
本文編號(hào):3561444
【文章來源】:山東大學(xué)山東省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:78 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
圖1-2部分GAGs裂解酶的降解模式[23]??1.3.1?CSaseABC??
山東大碩被第一次鑒定[36],是一種外切型裂解酶,可以將CS糖鏈中的GalNAc和GIcA??之間的(3-1,4糖苷鍵斷裂,產(chǎn)生一系列的寡糖,主要為不飽和二糖結(jié)構(gòu),如圖1-??3所示。CSase?ACII也對(duì)透明質(zhì)酸有降解活性,可以降解HA中的GlcNAc和??GlcA之間的p-l,4糖苷鍵,但是它卻不可以降解DS。CSaseAClI表現(xiàn)出一種外??切酶的作用模式,它可以從多糖鏈的非還原端一次切下一個(gè)二糖單位。CSaseAC??I發(fā)現(xiàn)于肝素黃桿菌?/r/〇fvoAocto"/MW?Aepar/www,是一種內(nèi)切酶,可以隨機(jī)切割HA??和CS糖鏈中己糖胺GlcNAc和GalNAc與己糖醛酸GlcA之間的p-1,4糖苷鍵,??但同樣不能降解DS糖鏈中GalNAc和IdoUA之間的P-1,4糖苷鍵137,38】。??
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【參考文獻(xiàn)】:
博士論文
[1]一種硫酸軟骨素E降解抗性的糖胺聚糖裂解酶的鑒定與應(yīng)用[D]. 彭春娥.山東大學(xué) 2018
碩士論文
[1]美洲大赤魷來源新型硫酸軟骨素的制備及抗腫瘤轉(zhuǎn)移活性研究[D]. 王慶彬.山東大學(xué) 2016
[2]鵝魚皮膠原蛋白與硫酸皮膚素的同時(shí)提取及其結(jié)構(gòu)、活性研究[D]. 楊陽.浙江工商大學(xué) 2015
本文編號(hào):3561444
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