Cupriavidus pinatubonensis JMP134中潛在的多硫化物轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白YedE1E2及其轉(zhuǎn)錄調(diào)控研究
發(fā)布時(shí)間:2021-11-28 22:08
硫及其化合物在生物地球化學(xué)循環(huán)和生物個(gè)體的正常生理活動(dòng)中都扮演了重要角色。硫在自然界存在多種化合價(jià),從-2~+6價(jià)。-2價(jià)的硫化氫一直以來被認(rèn)為是繼NO和CO之后的第三類信號(hào)分子,在細(xì)胞的信號(hào)傳遞及氧化還原穩(wěn)態(tài)的維持等方面發(fā)揮了重要作用。過量的硫化氫同樣具有毒性,如它可以抑制細(xì)胞色素c氧化酶活性從而破壞呼吸鏈。因此,硫化氫的代謝對于生物體至關(guān)重要。多硫化物正是硫化氫的氧化代謝產(chǎn)物的一種,它是地球化學(xué)以及微生物過程中的一類重要硫化物,參與了有機(jī)物的硫化,黃鐵礦的還原以及金屬螯合等諸多重要的環(huán)境過程。同時(shí),多硫化物也是細(xì)胞內(nèi)部的重要硫化物組分。隨著研究的深入,發(fā)現(xiàn)其參與了包括信號(hào)傳遞,維持氧化還原狀態(tài),代謝調(diào)節(jié),生物合成以及細(xì)胞內(nèi)的抗氧化等許多重要的胞內(nèi)生理過程,并且越來越多的證據(jù)表明胞內(nèi)實(shí)際發(fā)揮信號(hào)分子作用的是多硫化物一類的硫烷硫。因此,不管是在環(huán)境中還是細(xì)胞內(nèi),多硫化物的穩(wěn)態(tài)維持至關(guān)重要。我們實(shí)驗(yàn)室已經(jīng)解析了環(huán)境異養(yǎng)菌Cupriavidus pinatubonensis JMP134中一條完整的硫化氫氧化途徑,主要由硫醌氧化還原酶SQR(sulfide:quinone oxidored...
【文章來源】:山東大學(xué)山東省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:115 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
圖1.1不同價(jià)態(tài)的硫化物??
山東大學(xué)碩士學(xué)位論文???統(tǒng)主要由SQR,PDO以及RHOD三個(gè)關(guān)鍵蛋白酶組成。外源進(jìn)入和細(xì)胞內(nèi)源??產(chǎn)生的硫化氫經(jīng)由該途徑最終氧化成硫代硫酸鹽,完成硫氧化代謝過程[26,?29,??30]。??CISH?GSH??CpSQR?^^Spontaneous?C'dPI)02?J??Suiride?■■■■■■■■???PolvsulTides?"^GSSll?1?^?>?Suintc??\?cpDu,?442?\f??Remain??I?hiosultate??圖1.2?Ctw/7/7VmWw5'/?//ia^//wi^i57s?JMP134中典型的硫氧化途徑示意圖??CpSQR:?C.?pinatubonensis?JMP134?Stl?SQR??CpPD02:?C.?pinatubonensis?JMP134?PD02??CpDUF442:?C?尸—膽訪JMP134中的RHOD功能結(jié)構(gòu)域??SQR?(EC?1.8.5.4)是一種膜蛋白,廣泛分布在動(dòng)物線粒體和微生物中。SQR??作為DSR家族即二硫化物氧化還原酶蛋白家族的一員[31,32],作用的主要機(jī)??理是通過表面的FAD催化硫化氫生成硫烷硫,給出電子并轉(zhuǎn)移至細(xì)胞膜上的輔??酶Q或甲基奈醌,隨后借助呼吸鏈進(jìn)一步傳遞給氧。該過程生成的硫烷硫會(huì)在??胞內(nèi)自發(fā)與GSH反應(yīng)生成有機(jī)硫烷谷胱甘肽過硫化物GSSH,成為下一步PDO??催化反應(yīng)的底物[26,?29,?33]。??PDCKEC?1.13.11.18),過硫化物雙加氧酶,屬于?MBL(metallo-p-lactamase)??家族中的一員,廣泛分布于動(dòng)物、植物和微生物中。PDO能將GSSH作為
igR???? ̄^ArsR/SmlB)?????&???re?4?CadC.?CzrA??P.?aeruginosa?PyeR?^7—Synechococcus?PCC7942?SmtB??§/?B.?suhti/is?SdpR??C.glutumicurnGUR?C.?glulamicun,?CyeH??O.?—hR?P.Salicylatoxidans?So^R??S.?griseus?SlgR2??S.?meliloti?NitR??Serratia?PigS??圖1.3不同菌株中ArsR/SmtB家族蛋白的功能總結(jié)(SaiRen,2017)[65]??1.5.2?ArsR/SmtB家族蛋白轉(zhuǎn)錄調(diào)控機(jī)制??目前己有較多家族成員蛋白的晶體結(jié)構(gòu)得到了解析,這些結(jié)構(gòu)表明,ArsR/??SmtB家族調(diào)節(jié)子具有翼狀螺旋-轉(zhuǎn)角-螺旋(wHTH)?DNA結(jié)合結(jié)構(gòu)域,負(fù)??責(zé)響應(yīng)重金屬離子和生物學(xué)所需的金屬離子的濃度變化。如藍(lán)藻PCC7942?apo-??SmtB的高分辨率X射線晶體結(jié)構(gòu)顯示SmtB是具有雙重對稱軸的同型二聚體蛋??白,由五個(gè)a-螺旋和兩個(gè)反平行P-折疊組成,并且傾向于排列成al-a2-a3-a4-??Pl-P2_a5構(gòu)象[59]。其中螺旋-轉(zhuǎn)角-螺旋DNA結(jié)合域由a3和a4組成,與其??他家族的轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)因子具有結(jié)構(gòu)相似性[60,61]。這種DNA結(jié)合結(jié)構(gòu)域,尤其是??供DNA識(shí)別的a-螺旋(a4)序列區(qū)別于其他家族調(diào)控蛋白,在整個(gè)ArsR/SmtB??家族中高度保守。目前認(rèn)為,大多數(shù)ArsR/SmtB型金屬調(diào)節(jié)蛋白可以形成同源??二聚體,它們的5個(gè)螺旋和N-末端氨基酸殘基構(gòu)成二聚體界面[62]。??
本文編號(hào):3525238
【文章來源】:山東大學(xué)山東省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:115 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
圖1.1不同價(jià)態(tài)的硫化物??
山東大學(xué)碩士學(xué)位論文???統(tǒng)主要由SQR,PDO以及RHOD三個(gè)關(guān)鍵蛋白酶組成。外源進(jìn)入和細(xì)胞內(nèi)源??產(chǎn)生的硫化氫經(jīng)由該途徑最終氧化成硫代硫酸鹽,完成硫氧化代謝過程[26,?29,??30]。??CISH?GSH??CpSQR?^^Spontaneous?C'dPI)02?J??Suiride?■■■■■■■■???PolvsulTides?"^GSSll?1?^?>?Suintc??\?cpDu,?442?\f??Remain??I?hiosultate??圖1.2?Ctw/7/7VmWw5'/?//ia^//wi^i57s?JMP134中典型的硫氧化途徑示意圖??CpSQR:?C.?pinatubonensis?JMP134?Stl?SQR??CpPD02:?C.?pinatubonensis?JMP134?PD02??CpDUF442:?C?尸—膽訪JMP134中的RHOD功能結(jié)構(gòu)域??SQR?(EC?1.8.5.4)是一種膜蛋白,廣泛分布在動(dòng)物線粒體和微生物中。SQR??作為DSR家族即二硫化物氧化還原酶蛋白家族的一員[31,32],作用的主要機(jī)??理是通過表面的FAD催化硫化氫生成硫烷硫,給出電子并轉(zhuǎn)移至細(xì)胞膜上的輔??酶Q或甲基奈醌,隨后借助呼吸鏈進(jìn)一步傳遞給氧。該過程生成的硫烷硫會(huì)在??胞內(nèi)自發(fā)與GSH反應(yīng)生成有機(jī)硫烷谷胱甘肽過硫化物GSSH,成為下一步PDO??催化反應(yīng)的底物[26,?29,?33]。??PDCKEC?1.13.11.18),過硫化物雙加氧酶,屬于?MBL(metallo-p-lactamase)??家族中的一員,廣泛分布于動(dòng)物、植物和微生物中。PDO能將GSSH作為
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本文編號(hào):3525238
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