玉米NAC類轉(zhuǎn)錄因子ZmNAC19和ZmNAC31的克
發(fā)布時(shí)間:2021-10-23 04:42
NAC是高等植物所特有的一類轉(zhuǎn)錄因子,它在植物的生長(zhǎng)發(fā)育、花藥開裂及逆境脅迫中具有重要作用。玉米生育期內(nèi)由于高溫、高濕等環(huán)境因素造成花藥不能開裂從而嚴(yán)重影響玉米產(chǎn)量。擬南芥中的NAC類基因不僅參與葉片的發(fā)育,還調(diào)控花藥開裂。而玉米中的NAC類基因研究較少,為了研究玉米中調(diào)控葉片和花藥開裂的NAC類基因,本文對(duì)玉米中的NAC類基因進(jìn)行篩選,篩選出ZmNAC19基因主要在葉里面表達(dá),ZmNAC31基因主要在雄穗和葉里面表達(dá)。將篩選出的基因進(jìn)行生物信息學(xué)分析、構(gòu)建GFP融合蛋白載體和過(guò)表達(dá)載體、獲取過(guò)表達(dá)轉(zhuǎn)基因擬南芥并進(jìn)行表型分析。主要成果如下:1.通過(guò)比對(duì)擬南芥中NST蛋白序列,從玉米中篩選出100個(gè)NAC基因,又結(jié)合轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),篩選出33個(gè)基因,最后通過(guò)RT-PCR篩選出在葉里表達(dá)的ZmNAC19基因和在雄穗里表達(dá)的ZmNAC31基因。通過(guò)生物信息學(xué)分析ZmNAC19和ZmnAC31基因的啟動(dòng)子序列,這兩個(gè)基因的啟動(dòng)子區(qū)均有NAC轉(zhuǎn)錄的順式作用元件,尤其存在與次生壁增厚的調(diào)控元件,說(shuō)明這兩個(gè)基因可能參與了植物的次生壁增厚;對(duì)ZmNAC19和ZmNAC31蛋白的信號(hào)肽和跨膜結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè),預(yù)測(cè)出...
【文章來(lái)源】:沈陽(yáng)農(nóng)業(yè)大學(xué)遼寧省
【文章頁(yè)數(shù)】:78 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
玉米花藥發(fā)育14個(gè)時(shí)期的細(xì)胞學(xué)觀察(引自田有輝和萬(wàn)向元,2018)
第一章文獻(xiàn)綜述12圖1-2擬南芥花藥的隔膜和裂縫區(qū)(引自Wilsonetal.,2011)Fig.1-2SeptumandstomiumregionofanArabidopsisanther注:A:小孢子釋放后的裂縫區(qū);箭頭表示內(nèi)層細(xì)胞次生增厚帶。B:隔膜和裂縫溶解時(shí)的結(jié)構(gòu)圖。En:內(nèi)皮層St:裂縫S:隔膜Note:A:Thestomiumregionaftermicrosporerelease;bandsofsecondarythckening(arrows)canbeobservedintheendothecium.B:Thestomiumregionatantherdehiscence,afterseptumandstomiumlysis.En,endothecium;St,stomium,S,septum.BonnerandDickinson(1989)通過(guò)番茄的顯微鏡觀察發(fā)現(xiàn),孢子囊間隔的發(fā)育和表皮細(xì)胞的分化是由孢子細(xì)胞和絨氈層的分化引起的,之后是內(nèi)皮層的分化。內(nèi)皮層細(xì)胞進(jìn)行選擇性的次生增厚,而小室之間的隔膜和裂縫區(qū)域不增厚(Koltunowetal.,1990)。這說(shuō)明內(nèi)皮層的選擇性次生增厚對(duì)于花藥的開裂至關(guān)重要;ㄋ庨_裂之前,隔膜經(jīng)歷細(xì)胞分裂和細(xì)胞編程性死亡(Marianaetal.,1990)。裂縫對(duì)花藥開裂的重要性已經(jīng)在番茄的細(xì)胞消融中得以證實(shí)(BealsandGoldberg,1997)。他們指出,裂縫特異性消融后會(huì)使花藥開裂失敗。雙子葉模式植物擬南芥(Sandersetal.,1999)與茄科植物(BonnerandDickinson,1989;Sandersetal.,2005),單子葉植物水稻(Matsuietal.,1999)和玉米(Keijzeretal.,1996)的花藥開裂過(guò)程相似,這說(shuō)明控制花藥開裂的相關(guān)基因在不同的物種中具有高度保守性。但是,不同物種之間的花藥結(jié)構(gòu)也存在著細(xì)小的差異,從而影響最終開裂的位置。由于不同物種花藥結(jié)構(gòu)存在細(xì)小差異,從形態(tài)和組織學(xué)特征方面,研究人員分析了30種茄科植物的花藥開裂和裂縫結(jié)構(gòu),觀察到三種主要的開裂機(jī)制:(a)孔裂,通過(guò)一個(gè)小的頂端孔開裂;(b)頂端口縱向開裂,有一個(gè)頂端孔,但開口繼續(xù)向下縱向分
沈陽(yáng)農(nóng)業(yè)大學(xué)碩士學(xué)位論文21利用在線工具TMHMMServer分析ZmNAC19和ZmNAC31蛋白的跨膜結(jié)構(gòu);利用在線工具SignalPServer分析ZmNAC19和ZmNAC31蛋白質(zhì)N端的信號(hào)肽。2.1.2.8玉米ZmNAC19和ZmNAC31蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)利用在線工具ProtParam、SOPMA和SWISSMODEL對(duì)ZmNAC19和ZmNAC31進(jìn)行蛋白質(zhì)一級(jí)、二級(jí)和三級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)。2.2結(jié)果與分析2.2.1玉米各組織總RNA的提取及花藥、葉片高表達(dá)NAC基因的鑒定根據(jù)RNA提取試劑盒的說(shuō)明書提取玉米拔節(jié)期的根、莖、葉,花絲,授粉前的雌穗,抽穗后的雄穗和形成期的種子的總RNA。結(jié)果如圖2-1所示,可以清晰地看見28S和18S兩條帶,說(shuō)明RNA提取成功。測(cè)定A260/A280后,發(fā)現(xiàn)所有樣品RNA純度都較好,可以用于下一步的反轉(zhuǎn)錄以及RT-PCR試驗(yàn)。圖2-1玉米不同組織的總RNAFig.2-1TotalRNApreparationfromdifferenttissueofmaize注:Root:根;Stem:莖;Leaf:葉;Pistil:雌穗;Silk:花絲;Tassel:雄穗;Seed:種子因?yàn)镸itsuda等人(2007)在研究NST1和NST2基因時(shí)發(fā)現(xiàn),這兩個(gè)基因在調(diào)節(jié)葉片和花藥的次生壁增厚過(guò)程中發(fā)揮重要功能,以及在水稻、小麥中也有研究表明NAC類基因調(diào)節(jié)植物葉片的衰老和花藥開裂,因此,通過(guò)比對(duì)擬南芥長(zhǎng)角果開裂相關(guān)基因NST的蛋白質(zhì)序列,在玉米數(shù)據(jù)庫(kù)中篩選出100個(gè)NAC類基因,結(jié)合相似性大小與轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)中葉和花藥中的表達(dá)量多少,從初次篩選的100個(gè)基因中篩選出33個(gè)基因可能與花藥的開裂、葉片的發(fā)育有關(guān)。為了檢測(cè)該33個(gè)基因在玉米各個(gè)組織中的表達(dá)量,將RNA反轉(zhuǎn)錄成cDNA,再將篩選出的33個(gè)基因進(jìn)行RT-PCR水平檢測(cè),33個(gè)基因在不同組織中的表達(dá)水平如表2-2所示。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]玉米花藥發(fā)育的細(xì)胞生物學(xué)與分子遺傳學(xué)的研究方法[J]. 田有輝,萬(wàn)向元. 中國(guó)生物工程雜志. 2018(01)
[2]‘粉紅亞都蜜’葡萄NAC轉(zhuǎn)錄因子基因VvDRL1的功能初步分析[J]. 閆朝輝,李桂榮,穆金燕,婁航通,朱自果. 園藝學(xué)報(bào). 2016(04)
[3]Cotton GhMYB7 is predominantly expressed in developing fibers and regulates secondary cell wall biosynthesis in transgenic Arabidopsis[J]. Junfeng Huang,Feng Chen,Siyu Wu,Juan Li,Wenliang Xu. Science China(Life Sciences). 2016(02)
[4]非生物逆境相關(guān)基因在棉花抗逆研究中的進(jìn)展[J]. 雷志,周美亮,吳燕民. 中國(guó)農(nóng)業(yè)科技導(dǎo)報(bào). 2014(02)
[5]植物NAC轉(zhuǎn)錄因子的研究進(jìn)展[J]. 康桂娟,曾日中,聶智毅,黎瑜,代龍軍,段翠芳. 生物技術(shù)通報(bào). 2012(11)
[6]棉花葉片纖維素和木質(zhì)素含量與綠盲蝽抗性的關(guān)系[J]. 雒珺瑜,崔金杰,辛惠江. 西北農(nóng)林科技大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2012(04)
[7]Cytological analysis and genetic control of rice anther development[J]. Dabing Zhang~(a,b,*),Xue Luo~a,Lu Zhu~a a Institute of Plant Science,State Key Laboratory of Hybrid Rice,School of Life Sciences and Biotechnology, Shanghai Jiao Tong University,Shanghai 200240,China b Bio-X Research Center,Shanghai Jiao Tong University,Shanghai 200240,China. 遺傳學(xué)報(bào). 2011(09)
[8]植物NAC轉(zhuǎn)錄因子的研究進(jìn)展[J]. 冶曉芳,唐益苗,高世慶,楊穎,劉美英,王永波,趙昌平. 生物技術(shù)通報(bào). 2009(10)
博士論文
[1]兩個(gè)玉米近等基因系葉夾角差異的蛋白質(zhì)組學(xué)研究[D]. 王寧.河南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[2]鷹嘴豆NAC轉(zhuǎn)錄因子CarNAC4、CarNAC5和CarNAC2參與逆境脅迫響應(yīng)的功能分析[D]. 于興旺.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[3]水稻抗逆轉(zhuǎn)錄因子SNAC1靶基因的分離和功能分析[D]. 游均.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
碩士論文
[1]玉米花分生組織基因ZmMADS35的功能淺析[D]. 趙若冰.沈陽(yáng)農(nóng)業(yè)大學(xué) 2019
[2]華中五味子不同時(shí)期木質(zhì)素和木脂素含量變化及其合成關(guān)鍵酶CCR基因的研究[D]. 周勢(shì)超.陜西師范大學(xué) 2018
[3]玉米干旱脅迫應(yīng)答NAC基因的克隆及功能分析[D]. 張麗.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2017
[4]楊樹PtoMYB170轉(zhuǎn)錄因子在次生壁合成調(diào)控及抗旱中的功能研究[D]. 劉瑞.西南大學(xué) 2016
[5]毛白楊MYB055轉(zhuǎn)錄因子在次生壁合成中的調(diào)控機(jī)制研究[D]. 葉勝龍.西南大學(xué) 2015
本文編號(hào):3452489
【文章來(lái)源】:沈陽(yáng)農(nóng)業(yè)大學(xué)遼寧省
【文章頁(yè)數(shù)】:78 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
玉米花藥發(fā)育14個(gè)時(shí)期的細(xì)胞學(xué)觀察(引自田有輝和萬(wàn)向元,2018)
第一章文獻(xiàn)綜述12圖1-2擬南芥花藥的隔膜和裂縫區(qū)(引自Wilsonetal.,2011)Fig.1-2SeptumandstomiumregionofanArabidopsisanther注:A:小孢子釋放后的裂縫區(qū);箭頭表示內(nèi)層細(xì)胞次生增厚帶。B:隔膜和裂縫溶解時(shí)的結(jié)構(gòu)圖。En:內(nèi)皮層St:裂縫S:隔膜Note:A:Thestomiumregionaftermicrosporerelease;bandsofsecondarythckening(arrows)canbeobservedintheendothecium.B:Thestomiumregionatantherdehiscence,afterseptumandstomiumlysis.En,endothecium;St,stomium,S,septum.BonnerandDickinson(1989)通過(guò)番茄的顯微鏡觀察發(fā)現(xiàn),孢子囊間隔的發(fā)育和表皮細(xì)胞的分化是由孢子細(xì)胞和絨氈層的分化引起的,之后是內(nèi)皮層的分化。內(nèi)皮層細(xì)胞進(jìn)行選擇性的次生增厚,而小室之間的隔膜和裂縫區(qū)域不增厚(Koltunowetal.,1990)。這說(shuō)明內(nèi)皮層的選擇性次生增厚對(duì)于花藥的開裂至關(guān)重要;ㄋ庨_裂之前,隔膜經(jīng)歷細(xì)胞分裂和細(xì)胞編程性死亡(Marianaetal.,1990)。裂縫對(duì)花藥開裂的重要性已經(jīng)在番茄的細(xì)胞消融中得以證實(shí)(BealsandGoldberg,1997)。他們指出,裂縫特異性消融后會(huì)使花藥開裂失敗。雙子葉模式植物擬南芥(Sandersetal.,1999)與茄科植物(BonnerandDickinson,1989;Sandersetal.,2005),單子葉植物水稻(Matsuietal.,1999)和玉米(Keijzeretal.,1996)的花藥開裂過(guò)程相似,這說(shuō)明控制花藥開裂的相關(guān)基因在不同的物種中具有高度保守性。但是,不同物種之間的花藥結(jié)構(gòu)也存在著細(xì)小的差異,從而影響最終開裂的位置。由于不同物種花藥結(jié)構(gòu)存在細(xì)小差異,從形態(tài)和組織學(xué)特征方面,研究人員分析了30種茄科植物的花藥開裂和裂縫結(jié)構(gòu),觀察到三種主要的開裂機(jī)制:(a)孔裂,通過(guò)一個(gè)小的頂端孔開裂;(b)頂端口縱向開裂,有一個(gè)頂端孔,但開口繼續(xù)向下縱向分
沈陽(yáng)農(nóng)業(yè)大學(xué)碩士學(xué)位論文21利用在線工具TMHMMServer分析ZmNAC19和ZmNAC31蛋白的跨膜結(jié)構(gòu);利用在線工具SignalPServer分析ZmNAC19和ZmNAC31蛋白質(zhì)N端的信號(hào)肽。2.1.2.8玉米ZmNAC19和ZmNAC31蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)利用在線工具ProtParam、SOPMA和SWISSMODEL對(duì)ZmNAC19和ZmNAC31進(jìn)行蛋白質(zhì)一級(jí)、二級(jí)和三級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)。2.2結(jié)果與分析2.2.1玉米各組織總RNA的提取及花藥、葉片高表達(dá)NAC基因的鑒定根據(jù)RNA提取試劑盒的說(shuō)明書提取玉米拔節(jié)期的根、莖、葉,花絲,授粉前的雌穗,抽穗后的雄穗和形成期的種子的總RNA。結(jié)果如圖2-1所示,可以清晰地看見28S和18S兩條帶,說(shuō)明RNA提取成功。測(cè)定A260/A280后,發(fā)現(xiàn)所有樣品RNA純度都較好,可以用于下一步的反轉(zhuǎn)錄以及RT-PCR試驗(yàn)。圖2-1玉米不同組織的總RNAFig.2-1TotalRNApreparationfromdifferenttissueofmaize注:Root:根;Stem:莖;Leaf:葉;Pistil:雌穗;Silk:花絲;Tassel:雄穗;Seed:種子因?yàn)镸itsuda等人(2007)在研究NST1和NST2基因時(shí)發(fā)現(xiàn),這兩個(gè)基因在調(diào)節(jié)葉片和花藥的次生壁增厚過(guò)程中發(fā)揮重要功能,以及在水稻、小麥中也有研究表明NAC類基因調(diào)節(jié)植物葉片的衰老和花藥開裂,因此,通過(guò)比對(duì)擬南芥長(zhǎng)角果開裂相關(guān)基因NST的蛋白質(zhì)序列,在玉米數(shù)據(jù)庫(kù)中篩選出100個(gè)NAC類基因,結(jié)合相似性大小與轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)中葉和花藥中的表達(dá)量多少,從初次篩選的100個(gè)基因中篩選出33個(gè)基因可能與花藥的開裂、葉片的發(fā)育有關(guān)。為了檢測(cè)該33個(gè)基因在玉米各個(gè)組織中的表達(dá)量,將RNA反轉(zhuǎn)錄成cDNA,再將篩選出的33個(gè)基因進(jìn)行RT-PCR水平檢測(cè),33個(gè)基因在不同組織中的表達(dá)水平如表2-2所示。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]玉米花藥發(fā)育的細(xì)胞生物學(xué)與分子遺傳學(xué)的研究方法[J]. 田有輝,萬(wàn)向元. 中國(guó)生物工程雜志. 2018(01)
[2]‘粉紅亞都蜜’葡萄NAC轉(zhuǎn)錄因子基因VvDRL1的功能初步分析[J]. 閆朝輝,李桂榮,穆金燕,婁航通,朱自果. 園藝學(xué)報(bào). 2016(04)
[3]Cotton GhMYB7 is predominantly expressed in developing fibers and regulates secondary cell wall biosynthesis in transgenic Arabidopsis[J]. Junfeng Huang,Feng Chen,Siyu Wu,Juan Li,Wenliang Xu. Science China(Life Sciences). 2016(02)
[4]非生物逆境相關(guān)基因在棉花抗逆研究中的進(jìn)展[J]. 雷志,周美亮,吳燕民. 中國(guó)農(nóng)業(yè)科技導(dǎo)報(bào). 2014(02)
[5]植物NAC轉(zhuǎn)錄因子的研究進(jìn)展[J]. 康桂娟,曾日中,聶智毅,黎瑜,代龍軍,段翠芳. 生物技術(shù)通報(bào). 2012(11)
[6]棉花葉片纖維素和木質(zhì)素含量與綠盲蝽抗性的關(guān)系[J]. 雒珺瑜,崔金杰,辛惠江. 西北農(nóng)林科技大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2012(04)
[7]Cytological analysis and genetic control of rice anther development[J]. Dabing Zhang~(a,b,*),Xue Luo~a,Lu Zhu~a a Institute of Plant Science,State Key Laboratory of Hybrid Rice,School of Life Sciences and Biotechnology, Shanghai Jiao Tong University,Shanghai 200240,China b Bio-X Research Center,Shanghai Jiao Tong University,Shanghai 200240,China. 遺傳學(xué)報(bào). 2011(09)
[8]植物NAC轉(zhuǎn)錄因子的研究進(jìn)展[J]. 冶曉芳,唐益苗,高世慶,楊穎,劉美英,王永波,趙昌平. 生物技術(shù)通報(bào). 2009(10)
博士論文
[1]兩個(gè)玉米近等基因系葉夾角差異的蛋白質(zhì)組學(xué)研究[D]. 王寧.河南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[2]鷹嘴豆NAC轉(zhuǎn)錄因子CarNAC4、CarNAC5和CarNAC2參與逆境脅迫響應(yīng)的功能分析[D]. 于興旺.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[3]水稻抗逆轉(zhuǎn)錄因子SNAC1靶基因的分離和功能分析[D]. 游均.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
碩士論文
[1]玉米花分生組織基因ZmMADS35的功能淺析[D]. 趙若冰.沈陽(yáng)農(nóng)業(yè)大學(xué) 2019
[2]華中五味子不同時(shí)期木質(zhì)素和木脂素含量變化及其合成關(guān)鍵酶CCR基因的研究[D]. 周勢(shì)超.陜西師范大學(xué) 2018
[3]玉米干旱脅迫應(yīng)答NAC基因的克隆及功能分析[D]. 張麗.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2017
[4]楊樹PtoMYB170轉(zhuǎn)錄因子在次生壁合成調(diào)控及抗旱中的功能研究[D]. 劉瑞.西南大學(xué) 2016
[5]毛白楊MYB055轉(zhuǎn)錄因子在次生壁合成中的調(diào)控機(jī)制研究[D]. 葉勝龍.西南大學(xué) 2015
本文編號(hào):3452489
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