H1N1亞型流感病毒是A型流感病毒家族中的重要一員,位于哺乳動物感染流感病毒亞型之首,也是引發(fā)大流行性和季節(jié)性人流感的最主要亞型。近年來從禽類,尤其是在野鳥和活禽市場中H1N1病毒的分離概率有增高的趨勢,由該亞型病毒所帶來的公共威脅及其造成的經(jīng)濟損失已遠遠超過其他亞型流感。目前,H1N1流感病毒已經(jīng)在人、哺乳動物和禽類群體中建立了相對穩(wěn)定的遺傳進化譜系。因此,了解H1N1流感病毒遺傳演化譜系的感染和流行情況,對于我們識別流行毒株的譜系來源,明確在各個群體中流行的優(yōu)勢譜系,選擇與流行譜系抗原性相匹配的疫苗以及篩選疫苗種毒等方面將大有裨益。本研究對來自GenBank和GISAID數(shù)據(jù)庫中分離自中國的2,037條H1N1亞型流感病毒HA基因的遺傳進化分析顯示,該病毒已演化出4個不同的遺傳進化譜系,分別是古典豬流感病毒譜系、季節(jié)性人流感病毒譜系、禽流感病毒譜系和歐亞類禽豬流感病毒譜系�；谶M化樹的譜系分析結(jié)果,我們對各譜系HA基因的核苷酸序列進行了比對,并選擇HA基因的相對保守區(qū)域,針對每一譜系設計了多對鑒別引物,擬建立H1N1亞型流感病毒遺傳進化譜系鑒別熒光定量PCR檢測方法。同時,構(gòu)建各譜... 

【文章來源】：吉林大學吉林省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

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【學位級別】：碩士

【部分圖文】：

古典豬流感病毒譜系鑒別引物所處HA基因核苷酸序列的區(qū)域Figure1TheregionofHAgenenucleotidesequenceofclassicalswineinfluenzaviruslineageidentificationprimers

第二篇研究內(nèi)容H1N1亞型流感病毒遺傳進化譜系鑒別熒光定量PCR檢測方法的建立13的差異位點位于鑒別引物的3′端，有利于降低非特異性PCR擴增出現(xiàn)的概率。針對該區(qū)域設計的鑒別引物，可實現(xiàn)H1N1亞型流感病毒古典豬流感譜系的鑒別。圖2、圖3、圖4分別是季節(jié)性人流感病毒譜系、禽流感病毒譜系與歐亞類禽豬流感病毒譜系鑒別引物與其他譜系HA基因核酸序列相同位置的差異分析。圖1古典豬流感病毒譜系鑒別引物所處HA基因核苷酸序列的區(qū)域Figure1TheregionofHAgenenucleotidesequenceofclassicalswineinfluenzaviruslineageidentificationprimers圖2季節(jié)性人流感病毒譜系鑒別引物所處HA基因核苷酸序列的區(qū)域Figure2TheregionofHAgenenucleotidesequenceofseasonalhumaninfluenzaviruslineageidentificationprimers

第二篇研究內(nèi)容H1N1亞型流感病毒遺傳進化譜系鑒別熒光定量PCR檢測方法的建立14圖3禽流感病毒譜系鑒別引物所處HA基因核苷酸序列的區(qū)域Figure3TheregionofHAgenenucleotidesequenceofavianinfluenzaviruslineageidentificationprimers圖4歐亞類禽豬流感病毒譜系鑒別引物所處HA基因核苷酸序列的區(qū)域Figure4TheregionofHAgenenucleotidesequenceofEurasianavian-likeswineinfluenzaviruslineageidentificationprimers針對H1N1亞型流感病毒HA基因四個不同的遺傳進化譜系，各遺傳進化譜


本文編號：3404878