利用分析Fto功能及運用單堿基編輯技術(shù)研究m 6 A去甲基化的作用
發(fā)布時間:2021-07-30 02:52
N6-甲基腺苷(N6-methyladenosine,m6A)是真核生物mRNA中最豐富的一種甲基化修飾。甲基轉(zhuǎn)移酶和去甲基化酶的存在,使得m6A修飾在細胞中成為一個動態(tài)可逆的過程,最終決定m6A修飾的靶mRNA轉(zhuǎn)錄本的命運。m6A在基因表達調(diào)節(jié)、蛋白質(zhì)翻譯、細胞行為等方面起著至關(guān)重要的作用。肥胖相關(guān)蛋白(Fat mass and obesity associated protein,Fto)是一種m6A去甲基化酶,其在腦發(fā)育中的m6A去甲基化的生物學(xué)功能仍未知。因此本研究構(gòu)建了Fto基因敲除鼠(Fto-KO),基于分析m6A去甲基化酶Fto的功能來探索m6A去甲基化在小鼠腦發(fā)育中的生物學(xué)作用。結(jié)果顯示,在小鼠出生后第14天(P14),與野生型小鼠相比,Fto-KO鼠的體重、體長和腦組織重量均顯著性下調(diào)。其次,P14時期Fto-KO小鼠的全腦組織明顯變小,特別是小腦發(fā)生嚴重畸形。此外,小鼠腦組織冷凍切片尼氏染色結(jié)...
【文章來源】:華僑大學(xué)福建省
【文章頁數(shù)】:86 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
CRISPR/Ca9系統(tǒng)的作用機制CRISPR/Ca9系統(tǒng)切割DNA鏈,產(chǎn)生雙鏈DNA缺口后
22圖2.1Fto基因敲除策略首先設(shè)計合適的sgRNA靶向Fto基因的3號外顯子,然后將Cas9mRNA和sgRNA顯微注射到C57BL/6J小鼠的受精卵中,通過非同源重組修復(fù)方式(NHEJ)造成Fto基因蛋白讀碼框移碼,功能缺失。2、小鼠交配策略本研究是基于分析m6A去甲基化酶Fto的功能來研究m6A去甲基化對小鼠腦發(fā)育的影響,所以需要獲得一定數(shù)量的Fto純合子基因敲除鼠(基因型標(biāo)記為-/-)供后續(xù)試驗研究。小鼠交配策略如圖2.2所示。首先,將獲得的F0代Fto雜合子基因敲除鼠(基因型標(biāo)記為+/-)和野生型C57BL/6J小鼠(基因型標(biāo)記為+/+)交配,繁殖獲得一定數(shù)量的Fto雜合子基因敲除鼠。然后將獲得的Fto雜合子基因敲除鼠雌雄同籠進行繁殖,獲得目的Fto純合子基因敲除鼠進行后續(xù)實驗。同時,也獲得了更多的Fto雜合子基因敲除鼠,這一部分小鼠繼續(xù)雌雄同籠進行繁殖以獲得更多的Fto純合子基因敲除鼠。
23圖2.2Fto基因敲除鼠初步交配策略圖中白色背景的為野生型小鼠(+/+),綠色背景的為Fto雜合子基因敲除鼠(+/-),紅色背景的為Fto純合子基因敲除鼠(-/-)。2.1.2.2小鼠基因組DNA的抽提1、用酒精棉擦拭剪刀,然后剪取約3mm小鼠的尾尖放置于無菌的2mL離心管中。2、向上述離心管中加入600μL細胞裂解緩沖液(BufferSalting-out)和6μL蛋白酶K(10mg/mL),上下顛倒混勻后放置于55℃恒溫箱內(nèi)過夜消化。3、加入600μL的DNA提取液(苯酚:氯仿:異戊醇=25:24:1),充分顛倒混勻后12000rpm,離心10min。4、用200μL的移液槍緩慢地吸取適量的上清液并轉(zhuǎn)移至無菌的離心管中,加入2倍體積的無水乙醇。充分顛倒混勻后,放置于離心機中,12000rpm離心15min。5、離心完畢后,棄去上清液,并將離心管放置在通風(fēng)櫥內(nèi)使沉淀充分干燥。然后根據(jù)沉淀的大小加入50μL至200μL無菌水,充分溶解即可得到DNA溶液,然后將其放置于-20℃保存。
本文編號:3310539
【文章來源】:華僑大學(xué)福建省
【文章頁數(shù)】:86 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
CRISPR/Ca9系統(tǒng)的作用機制CRISPR/Ca9系統(tǒng)切割DNA鏈,產(chǎn)生雙鏈DNA缺口后
22圖2.1Fto基因敲除策略首先設(shè)計合適的sgRNA靶向Fto基因的3號外顯子,然后將Cas9mRNA和sgRNA顯微注射到C57BL/6J小鼠的受精卵中,通過非同源重組修復(fù)方式(NHEJ)造成Fto基因蛋白讀碼框移碼,功能缺失。2、小鼠交配策略本研究是基于分析m6A去甲基化酶Fto的功能來研究m6A去甲基化對小鼠腦發(fā)育的影響,所以需要獲得一定數(shù)量的Fto純合子基因敲除鼠(基因型標(biāo)記為-/-)供后續(xù)試驗研究。小鼠交配策略如圖2.2所示。首先,將獲得的F0代Fto雜合子基因敲除鼠(基因型標(biāo)記為+/-)和野生型C57BL/6J小鼠(基因型標(biāo)記為+/+)交配,繁殖獲得一定數(shù)量的Fto雜合子基因敲除鼠。然后將獲得的Fto雜合子基因敲除鼠雌雄同籠進行繁殖,獲得目的Fto純合子基因敲除鼠進行后續(xù)實驗。同時,也獲得了更多的Fto雜合子基因敲除鼠,這一部分小鼠繼續(xù)雌雄同籠進行繁殖以獲得更多的Fto純合子基因敲除鼠。
23圖2.2Fto基因敲除鼠初步交配策略圖中白色背景的為野生型小鼠(+/+),綠色背景的為Fto雜合子基因敲除鼠(+/-),紅色背景的為Fto純合子基因敲除鼠(-/-)。2.1.2.2小鼠基因組DNA的抽提1、用酒精棉擦拭剪刀,然后剪取約3mm小鼠的尾尖放置于無菌的2mL離心管中。2、向上述離心管中加入600μL細胞裂解緩沖液(BufferSalting-out)和6μL蛋白酶K(10mg/mL),上下顛倒混勻后放置于55℃恒溫箱內(nèi)過夜消化。3、加入600μL的DNA提取液(苯酚:氯仿:異戊醇=25:24:1),充分顛倒混勻后12000rpm,離心10min。4、用200μL的移液槍緩慢地吸取適量的上清液并轉(zhuǎn)移至無菌的離心管中,加入2倍體積的無水乙醇。充分顛倒混勻后,放置于離心機中,12000rpm離心15min。5、離心完畢后,棄去上清液,并將離心管放置在通風(fēng)櫥內(nèi)使沉淀充分干燥。然后根據(jù)沉淀的大小加入50μL至200μL無菌水,充分溶解即可得到DNA溶液,然后將其放置于-20℃保存。
本文編號:3310539
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