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影像遺傳學(xué)新方法研究-加權(quán)距離相關(guān)

發(fā)布時(shí)間:2021-07-16 12:51
  影像遺傳學(xué)主要用于揭示神經(jīng)精神疾病風(fēng)險(xiǎn)基因的發(fā)病機(jī)制,并了解人腦結(jié)構(gòu),功能和個體差異之間的關(guān)系。越來越多的以體素為單位的全腦成像表型被用于檢驗(yàn)與遺傳標(biāo)記的關(guān)聯(lián),而分析此類數(shù)據(jù)的挑戰(zhàn)在于它們的雙重高維性和復(fù)雜性。近年來出現(xiàn)了一些非參數(shù)的方法來解決兩個多元變量之間的相關(guān)性分析問題,其中最為典型的是距離相關(guān)性[1]。距離相關(guān)可以度量兩個任意維度的隨機(jī)變量的線性以及非線性相關(guān)性,并且不依賴任何模型假設(shè),這使得它更適用于影像遺傳學(xué)的分析。但是,對于全腦成像的功能表型,體素的數(shù)量可能是數(shù)千個甚至更多,在這種高維甚至超高維情況下,距離相關(guān)的效果會變差,出現(xiàn)距離相關(guān)檢驗(yàn)的功效會隨著維度的增加而急劇下降[2],這反映了距離相關(guān)并不適用于分析這類全腦成像的高維遺傳數(shù)據(jù)。為了有效構(gòu)建關(guān)于影像表型和遺傳變異的雙重多變量分析方法,我們提出了一種基于加權(quán)距離相關(guān)(weighted distance correlation,wdCor)的影像遺傳學(xué)關(guān)聯(lián)分析的新框架。wdCor提出的主要思想是將較大的權(quán)重分配給真正和遺傳標(biāo)記有相關(guān)性的體素,將可忽略的權(quán)重分配給剩余那些體素,從而減少這部分在進(jìn)行相關(guān)性檢驗(yàn)時(shí)所帶來的影響... 

【文章來源】:中國科學(xué)技術(shù)大學(xué)安徽省 211工程院校 985工程院校

【文章頁數(shù)】:44 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【部分圖文】:

影像遺傳學(xué)新方法研究-加權(quán)距離相關(guān)


圖4.1?tWCo/■檢驗(yàn)獲得的左海馬區(qū)(左圖>?和右海馬區(qū)(右圖)的Q-Q圖??

權(quán)重分布,海馬,權(quán)重分布,最優(yōu)化


?第4章ADNI數(shù)據(jù)集分析???表4.2?MCor檢驗(yàn)和dCo/?檢驗(yàn)檢驗(yàn)出的前5個SNP(右海馬體)??SNP?BP?p.value?Gene??wdCor??rs2075650?45395619?2.4e-06?TOMM40??rs2075762?18989859?1,6e-04?None??rs9710520?58168922?2.6e-04?ZSCAN4??rsl688114?3037787?8.0e-04?TLE2??rs?12610292?58167753?l.le-03?ZSCAN4??dCor??rs?1654654?24372210?3.7e-05?None??rs2075650?45395619?l.le-04?TOMM40??rsl?57580?45395266?2.4e-04?TOMM40??rs?11672342?30266602?3.1e-04?None??rs2097765?28156666?4.3e-04?None??為了更直觀的分析rs2075650和右海馬體的關(guān)聯(lián),圖4.2展示了?rs2075650和??右海體切片的最優(yōu)權(quán)重分布。??0.3、??〇.2、.丨.丄;..:'?.卜?'?'??圖4.2右海馬切片與rs2075650的最優(yōu)化權(quán)重分布??28??

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]Neurofibrillary tangles in Alzheimer’s disease: elucidation of the molecular mechanism by immunohistochemistry and tau protein phospho-proteomics[J]. Athanasios Metaxas,Stefan J.Kempf.  Neural Regeneration Research. 2016(10)



本文編號:3287045

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