慢性腎�。–hronic kidney disease,CKD）是一種被定義為腎臟結(jié)構(gòu)、功能或兩者持續(xù)改變的綜合癥,而血清肌酐（serum creatinine,Scr）是臨床上評價(jià)腎臟功能的重要指標(biāo)。近年來,全世界慢性腎病的患病率達(dá)到7%-12%。目前,全基因組關(guān)聯(lián)研究（Genome-wide association studies,GWAS）已經(jīng)鑒定出許多與慢性腎病相關(guān)的重要遺傳變異。但是,從GWAS鑒定出的遺傳變異中,真正對慢性腎病發(fā)揮作用的功能基因仍然未知。本研究采用基于匯總數(shù)據(jù)的孟德爾隨機(jī)化（Summary data-based Mendelian randomization,SMR）分析方法來鑒定影響慢性腎病的因果基因。該方法使用與基因表達(dá)相關(guān)性最顯著的SNP作為工具變量,研究基因表達(dá)與慢性腎病和血清肌酐之間的因果關(guān)系;并使用蛋白-蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)探索由鑒定到的基因所產(chǎn)生的蛋白之間的功能相互作用;同時(shí),使用IPA（Ingenuity Pathway Analysis）來分析基因之間的通路關(guān)系;使用差異表達(dá)分析找出慢性腎病組和健康對照中有表達(dá)差異的基因。結(jié)果顯示:1、SMR方... 

【文章來源】：湖南師范大學(xué)湖南省 211工程院校

【文章頁數(shù)】：51 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【文章目錄】：
中文摘要
ABSTRACT
1.文獻(xiàn)綜述
    1.1 慢性腎病簡介
    1.2 慢性腎病的全基因組關(guān)聯(lián)分析
    1.3 孟德爾隨機(jī)化
    1.4 SMR在其他疾病上的應(yīng)用
2.材料與方法
    2.1 GWAS匯總數(shù)據(jù)
    2.2 eQTL匯總數(shù)據(jù)
    2.3 基于匯總數(shù)據(jù)的孟德爾隨機(jī)化分析
    2.4 異質(zhì)性檢驗(yàn)
    2.5 蛋白-蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)
    2.6 IPA分析
    2.7 差異表達(dá)分析
3.結(jié)果與分析
    3.1 e GFRcrea的 SMR與異質(zhì)性檢驗(yàn)結(jié)果
    3.2 CKD的 SMR與異質(zhì)性檢驗(yàn)結(jié)果
    3.3 蛋白-蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)結(jié)果
    3.4 IPA分析結(jié)果
    3.5 差異表達(dá)分析結(jié)果
4.討論
5.研究結(jié)論與創(chuàng)新性
    5.1 結(jié)果
    5.2 本研究的創(chuàng)新性
參考文獻(xiàn)
致謝


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]G蛋白信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)調(diào)節(jié)因子4在腎癌組織中的表達(dá)及意義[J]. 安豐,楊繼宏,崔振宇,師曉強(qiáng),劉明鍇,郭景陽,王洪福.  山東醫(yī)藥. 2017(14)



本文編號(hào)：3163123