四種倍半萜合酶的酶促反應(yīng)動(dòng)力學(xué)和熱力學(xué)分析
發(fā)布時(shí)間:2021-03-31 20:29
倍半萜合酶催化反應(yīng)起始為法尼基焦磷酸裂解二磷酸部分,導(dǎo)致不穩(wěn)定的萜烯碳正離子。隨后,倍半萜合酶中底物結(jié)合位點(diǎn)的催化輪廓引發(fā)并引導(dǎo)級(jí)聯(lián)的碳正離子反應(yīng)(例如,雙鍵遷移,氫化物和甲基轉(zhuǎn)移或去質(zhì)子化),從而導(dǎo)致單一萜烯或多種萜烯的合成。對(duì)于倍半萜合酶的突變研究能夠鑒定蛋白質(zhì)氨基酸序列對(duì)酶催化效率和產(chǎn)物特異性的影響,進(jìn)一步闡明倍半萜合酶的催化機(jī)理,在實(shí)際應(yīng)用中可為新的藥物前體的開發(fā)提供理論指導(dǎo)。倍半萜類合酶的催化機(jī)制中存在限速步驟,一例研究發(fā)現(xiàn)(E,E)-FPP向NPP的異構(gòu)化過程是限制Trichodiene合酶(FSTS)催化反應(yīng)途徑中化學(xué)催化速率的步驟,有報(bào)道,理論計(jì)算發(fā)現(xiàn)(E,E)-FPP異構(gòu)化為transoid(R,E)-NPP的過程為吸熱反應(yīng)。酶的催化活性和動(dòng)力學(xué)行為是生物化學(xué)和生物技術(shù)研究中非常重要的內(nèi)容。目前對(duì)倍半萜合酶限速步驟的研究很少,而明確限速步驟,可以指導(dǎo)定點(diǎn)突變,提高酶的催化活性。等溫滴定量熱法可用于測(cè)量酶動(dòng)力學(xué)參數(shù)及熱力學(xué)參數(shù)。因?yàn)殡S著反應(yīng)的進(jìn)行而產(chǎn)生的熱能是直接且敏感的可觀察事件,該方法的原理是通過酶與底物的化學(xué)滴定實(shí)驗(yàn),記錄化學(xué)反應(yīng)吸/放熱隨時(shí)間的變化以確定酶促反應(yīng)...
【文章來(lái)源】:河北大學(xué)河北省
【文章頁(yè)數(shù)】:85 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
倍半萜合酶催化過程示意圖
河北大學(xué)碩士學(xué)位論文2或萜醇的合成[25-28];另外一類會(huì)產(chǎn)生中性的中間產(chǎn)物nerolidylpyrophosphate(NPP),再次發(fā)生異構(gòu)化和離子化及環(huán)化反應(yīng),使倍半萜產(chǎn)物的種類進(jìn)一步增加[29-31]。倍半萜合酶催化過程依賴金屬離子,如圖1-2,酶活性中心的保守基序與金屬離子和底物焦磷酸基團(tuán)的配位作用可觸發(fā)活性口袋的構(gòu)象變化,使活性位點(diǎn)口袋封閉,為催化反應(yīng)提供疏水的環(huán)境。迄今為止,已經(jīng)鑒定了許多具有醫(yī)學(xué)和工業(yè)重要性的倍半萜合酶基因[32,33]。隨著STS基因的可用性,一些倍半萜的生產(chǎn)已顯著擴(kuò)大。圖1-1倍半萜合酶催化過程示意圖Fig.1-1Diagramofcatalyticprocessofsesquiterpenesynthase圖1-2土曲霉(Aspergillusterreus))aristolochenesynthase金屬離子綁定示意圖[32]Fig.1-2SchematicdiagramofAspergillusterreusaristolochenesynthasemetalionbinding[32]
第1章緒論5種倍受全世界關(guān)注的酶,因?yàn)樗呋?E,E)-FPP轉(zhuǎn)化為amorpha-4,11-diene,這是重要的抗瘧藥青蒿素的前體[64]。該反應(yīng)起始是焦磷酸基團(tuán)在與保守基序和金屬離子的配位作用下從FPP上離去,活性中心口袋呈封閉狀態(tài),焦磷酸基團(tuán)在C3重獲形成NPP,NPP經(jīng)過C1-C6環(huán)化和C1-C10環(huán)化最終形成(1S,6R,7R,10R)紫穗槐-4,11-二烯[65-67],如圖1-3。圖1-3AaADS催化過程示意圖[65]Fig.1-3DiagramofcatalyticprocessofAaADS[65]有研究報(bào)道,AaADS蛋白包含72%的α-螺旋,23%的β-折疊和26%的無(wú)規(guī)卷曲,該酶在花蕾和幼葉中的表達(dá)很高,表現(xiàn)出一種組織特異性的表達(dá)模式[65]。AaADSR262K突變體影響的是催化機(jī)制中碳正離子向Amorpha-4,11-diene的轉(zhuǎn)化過程,降低了萜烯的合成,增加了萜醇的生成[48]。1.4(+)-epi-α-沒藥醇合酶簡(jiǎn)介一種獨(dú)特的C15倍半萜類物質(zhì)Hernandulcin是從Lippiadulcis的葉子中分離出來(lái)的天然甜味劑,還能作為草藥治療咳嗽,支氣管炎[16]。Hernandulcin形成的第一步是(+)-epi-α-bisabolol合酶(LdBOS)催化FPP合成(+)-epi-α-bisabolol。由Lippiadulcis中克隆得到的LdBOS的cDNA全長(zhǎng)1641bp,編碼546個(gè)氨基酸殘基,分子量為63.8kDa,與其它已知的倍半萜合酶一樣,(+)-epi-α-bisabolol合酶具有DDxxD保守基序,參與活性中心處與Mg2+和底物焦磷酸配位,體現(xiàn)了與其他倍半萜合酶相關(guān)的序列同一性。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]R262K點(diǎn)突變將紫穗槐二烯合酶變?yōu)椋?R)-(E)-nerolidol合酶[J]. 李振秋,高瑞平,程隆斌,劉秀華,朱華結(jié). 河北農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2015(03)
[2]β-欖香烯抗癌活性及其新型給藥系統(tǒng)的研究進(jìn)展[J]. 陳美婉,鐘章鋒,王勝鵬,王一濤. 中國(guó)新藥雜志. 2012(12)
本文編號(hào):3112029
【文章來(lái)源】:河北大學(xué)河北省
【文章頁(yè)數(shù)】:85 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
倍半萜合酶催化過程示意圖
河北大學(xué)碩士學(xué)位論文2或萜醇的合成[25-28];另外一類會(huì)產(chǎn)生中性的中間產(chǎn)物nerolidylpyrophosphate(NPP),再次發(fā)生異構(gòu)化和離子化及環(huán)化反應(yīng),使倍半萜產(chǎn)物的種類進(jìn)一步增加[29-31]。倍半萜合酶催化過程依賴金屬離子,如圖1-2,酶活性中心的保守基序與金屬離子和底物焦磷酸基團(tuán)的配位作用可觸發(fā)活性口袋的構(gòu)象變化,使活性位點(diǎn)口袋封閉,為催化反應(yīng)提供疏水的環(huán)境。迄今為止,已經(jīng)鑒定了許多具有醫(yī)學(xué)和工業(yè)重要性的倍半萜合酶基因[32,33]。隨著STS基因的可用性,一些倍半萜的生產(chǎn)已顯著擴(kuò)大。圖1-1倍半萜合酶催化過程示意圖Fig.1-1Diagramofcatalyticprocessofsesquiterpenesynthase圖1-2土曲霉(Aspergillusterreus))aristolochenesynthase金屬離子綁定示意圖[32]Fig.1-2SchematicdiagramofAspergillusterreusaristolochenesynthasemetalionbinding[32]
第1章緒論5種倍受全世界關(guān)注的酶,因?yàn)樗呋?E,E)-FPP轉(zhuǎn)化為amorpha-4,11-diene,這是重要的抗瘧藥青蒿素的前體[64]。該反應(yīng)起始是焦磷酸基團(tuán)在與保守基序和金屬離子的配位作用下從FPP上離去,活性中心口袋呈封閉狀態(tài),焦磷酸基團(tuán)在C3重獲形成NPP,NPP經(jīng)過C1-C6環(huán)化和C1-C10環(huán)化最終形成(1S,6R,7R,10R)紫穗槐-4,11-二烯[65-67],如圖1-3。圖1-3AaADS催化過程示意圖[65]Fig.1-3DiagramofcatalyticprocessofAaADS[65]有研究報(bào)道,AaADS蛋白包含72%的α-螺旋,23%的β-折疊和26%的無(wú)規(guī)卷曲,該酶在花蕾和幼葉中的表達(dá)很高,表現(xiàn)出一種組織特異性的表達(dá)模式[65]。AaADSR262K突變體影響的是催化機(jī)制中碳正離子向Amorpha-4,11-diene的轉(zhuǎn)化過程,降低了萜烯的合成,增加了萜醇的生成[48]。1.4(+)-epi-α-沒藥醇合酶簡(jiǎn)介一種獨(dú)特的C15倍半萜類物質(zhì)Hernandulcin是從Lippiadulcis的葉子中分離出來(lái)的天然甜味劑,還能作為草藥治療咳嗽,支氣管炎[16]。Hernandulcin形成的第一步是(+)-epi-α-bisabolol合酶(LdBOS)催化FPP合成(+)-epi-α-bisabolol。由Lippiadulcis中克隆得到的LdBOS的cDNA全長(zhǎng)1641bp,編碼546個(gè)氨基酸殘基,分子量為63.8kDa,與其它已知的倍半萜合酶一樣,(+)-epi-α-bisabolol合酶具有DDxxD保守基序,參與活性中心處與Mg2+和底物焦磷酸配位,體現(xiàn)了與其他倍半萜合酶相關(guān)的序列同一性。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]R262K點(diǎn)突變將紫穗槐二烯合酶變?yōu)椋?R)-(E)-nerolidol合酶[J]. 李振秋,高瑞平,程隆斌,劉秀華,朱華結(jié). 河北農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2015(03)
[2]β-欖香烯抗癌活性及其新型給藥系統(tǒng)的研究進(jìn)展[J]. 陳美婉,鐘章鋒,王勝鵬,王一濤. 中國(guó)新藥雜志. 2012(12)
本文編號(hào):3112029
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