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白洋淀岸邊帶微生物群落結(jié)構(gòu)與多樣性研究

發(fā)布時間:2021-01-09 21:46
  岸邊帶土壤擁有獨(dú)特的地理地貌條件,所形成的微生物種群也較為獨(dú)特,且微生物的多樣性,群落結(jié)構(gòu)等也更容易受到人為干擾的影響而發(fā)生變化。本研究對白洋淀岸邊帶6個代表不同干擾條件及功能區(qū)采樣點(diǎn)的細(xì)菌多樣性進(jìn)行研究(S1水產(chǎn)養(yǎng)殖區(qū),S2居民生活區(qū),S3靜水蓄積區(qū),S4代表性大淀,S5旅游區(qū),S6城郊易污區(qū)),通過Illumina Miseq高通量測序技術(shù)及土壤環(huán)境因子的測定分析,比較了岸邊帶不同的功能區(qū)中細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)、多樣性分布特征及與環(huán)境因子的相關(guān)性,同時使用多種培養(yǎng)基對樣品中的細(xì)菌進(jìn)行分離,研究其可培養(yǎng)細(xì)菌的多樣性,得到結(jié)果如下:(1)白洋淀6個具有不同特征的區(qū)域中,細(xì)菌群落均有較高的多樣性,樣本的物種組成及相對豐度存在差異,優(yōu)勢物種所占比例也略有不同;6個樣本分組群落的組間差異明顯大于組內(nèi)差異,說明細(xì)菌群落會隨白洋淀區(qū)域特征發(fā)生變化;變形菌門、硝化螺旋菌門、厚壁菌門、浮霉菌門在各樣本間均有顯著差異,每個樣本中OTU之間多有聯(lián)系,能互相對物種豐度產(chǎn)生影響;在這些樣本中,S1與S6細(xì)菌多樣性較為相似,S2與S3細(xì)菌多樣性較為相似,而S4(代表性大淀)細(xì)菌多樣性與所有樣本均差別較大;樣本中的微生... 

【文章來源】: 唐靈杰 河北大學(xué)

【文章頁數(shù)】:81 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【部分圖文】:

白洋淀岸邊帶微生物群落結(jié)構(gòu)與多樣性研究


岸邊帶示意圖

曲線圖,曲線圖,物種,多樣性


河北大學(xué)碩士學(xué)位論文142.3.2物種注釋與評估2.3.2.1OTU分析對優(yōu)化序列提取非重復(fù)序列,去除沒有重復(fù)的單序列,按照97%相似性對非重復(fù)序列(不含單序列)進(jìn)行OTU聚類,并在聚類過程中去除嵌合體,按照一定數(shù)量或各樣本中序列最低數(shù)量,將所有樣本的序列隨機(jī)抽取至統(tǒng)一數(shù)據(jù)量,然后再進(jìn)行各項(xiàng)分析,得到的各分類單元數(shù)量見表2-7:表2-7各分類單元統(tǒng)計(jì)表Table2-7StatisticsofeachtaxonPhylumClassOrderFamilyGenusSpeciesOTU49139269515101621007831Pan/CoreOTU用于描述隨著樣本量的加大物種總量和核心物種量變化的情況。PanOTU指得是泛OTU,是所有樣本所包含的OTU的總和,用于觀測隨著樣本數(shù)目的增加,總OTU數(shù)目的增加情況。CoreOTU指的是核心OTU,是所有樣本共有的OTU的數(shù)目,用于觀測隨著樣本數(shù)目的增加,共有OTU數(shù)目的減少情況。圖2-1中曲線均趨于平緩,物種總量和核心物種量不會繼續(xù)隨樣本量增加而變化,說明本次測序樣本量足夠。圖2-1Pan/Core曲線圖Fig2-1Pan/Coregraph2.3.2.2Alpha多樣性分析Alpha多樣性是指一個特定區(qū)域或者生態(tài)系統(tǒng)內(nèi)的多樣性,通過觀察各種指數(shù)值進(jìn)而得到物種的多樣性豐度等信息(表2-8,圖2-2)。表2-8是6個樣本(含3個重復(fù))的Alpha多樣性指數(shù)表,其中,sobs指數(shù)為實(shí)際觀

指數(shù),多樣性,碩士學(xué)位,河北


指數(shù)組間差異檢驗(yàn)圖

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]白洋淀多環(huán)芳烴與有機(jī)氯農(nóng)藥季節(jié)性污染特征及來源分析[J]. 王乙震,張俊,周緒申,孔凡青,徐銘霞.  環(huán)境科學(xué). 2017(03)
[2]高通量測序技術(shù)在人工濕地微生物多樣性研究中的研究進(jìn)展[J]. 王林,李冰,朱健.  中國農(nóng)學(xué)通報. 2016(05)
[3]厭氧氨氧化細(xì)菌和反硝化厭氧甲烷氧化細(xì)菌在岸邊帶土壤中的分布規(guī)律[J]. 夏超,祝貴兵,鄒雨璇,周蓉,趙思研.  環(huán)境科學(xué)學(xué)報. 2015(12)
[4]硫酸鹽還原菌處理含硫酸鹽有機(jī)廢水的原理及其應(yīng)用[J]. 吳慶慶,邱賢華,熊貞晟,陳素華.  安全與環(huán)境工程. 2015(01)
[5]白洋淀富營養(yǎng)化湖泊濕地厭氧氨氧化菌的分布及對氮循環(huán)的影響[J]. 王衫允,祝貴兵,曲冬梅,尹澄清.  生態(tài)學(xué)報. 2012(21)
[6]白洋淀底泥重金屬形態(tài)及豎向分布[J]. 李必才,何連生,楊敏,孟睿,袁冬海,席北斗,舒儉民.  環(huán)境科學(xué). 2012(07)
[7]白洋淀湖濱濕地岸邊帶氨氧化古菌與氨氧化細(xì)菌的分布特性[J]. 葉磊,祝貴兵,王雨,馮曉娟,王為東,王衫允,尹澄清.  生態(tài)學(xué)報. 2011(08)
[8]固相微萃取-氣相色譜法測定白洋淀水樣中的鄰苯二甲酸酯類化合物[J]. 劉芃巖,高麗,申杰,劉微,蔡立鵬.  色譜. 2010(05)
[9]白洋淀蘆葦型水陸交錯帶水化學(xué)動態(tài)及其凈化功能研究[J]. 王為東,王亮,聶大剛,尹澄清.  生態(tài)環(huán)境學(xué)報. 2010(03)
[10]海洋環(huán)境中難培養(yǎng)微生物的寡營養(yǎng)培養(yǎng)[J]. 田甜,李冬梅,戴世鯤,殷克東,孫慧敏,李翔.  微生物學(xué)通報. 2009(07)

博士論文
[1]富營養(yǎng)化湖泊沉積物—水界面重金屬釋放的生物化學(xué)過程研究[D]. 魯成秀.山東師范大學(xué) 2016

碩士論文
[1]濕地岸邊帶新型氨氧化微生物分布及相互關(guān)系[D]. 史國帥.吉林建筑大學(xué) 2019
[2]濕地系統(tǒng)氮循環(huán)微生物的分布與活性[D]. 劉璐.長春工程學(xué)院 2016



本文編號:2967455

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