日本三角渦蟲HSP70家族相關(guān)基因功能研究
發(fā)布時間:2020-12-22 01:48
日本三角渦蟲(Dugesia japonica)隸屬扁形動物門(Platyhelminthes),渦蟲綱(Turbellaria),在動物系統(tǒng)演化中占有重要地位,并且具有極強的損傷修復及再生能力。但目前,其再生機制并不清楚。本文利用生物信息學、Real-time PCR、原位雜交和RNA干擾等技術(shù)對日本三角渦蟲轉(zhuǎn)錄組中表達量較高的熱休克蛋白70家族基因Djhsp70a、Djhsp70b、Djhsp70c、Djhsp70d進行了定量、定位和功能分析,結(jié)果如下:(1)首先對四基因進行溫度、切割損傷和離子液體應(yīng)激處理,結(jié)果表明:渦蟲在培養(yǎng)溫度低于或者高于20℃,切割損傷和離子液體處理應(yīng)激條件下,四基因表達量均明顯上調(diào)。(2)Djhsp70a生物信息學分析發(fā)現(xiàn):DjHSP70a蛋白是穩(wěn)定的親水性蛋白,具有多個磷酸化位點和糖基化位點,含有HSP70家族標簽3和末端高度保守的EEVD序列;整體原位雜交結(jié)果顯示:Djhsp70a基因在整體以及再生渦蟲中廣泛表達,其中整體渦蟲身體兩側(cè)有較強雜交信號,再生渦蟲芽基處有雜交信號且再生5d和7d時雜交信號最強;Djhsp70a基因干擾后,2/3整體渦蟲咽后部...
【文章來源】:河南師范大學河南省
【文章頁數(shù)】:98 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
縮略語
摘要
ABSTRACT
1 引言
1.1 日本三角渦蟲概述
1.2 渦蟲再生研究進展
1.3 熱休克蛋白70的研究進展
1.3.1 熱休克蛋白70的分類
1.3.2 HSP70的結(jié)構(gòu)和生物學特征
1.3.3 HSP70的生物學功能
1.4 立題依據(jù)與意義
2 材料與方法
2.1 實驗材料
2.1.1 實驗材料的采集與培養(yǎng)
2.1.2 實驗儀器
2.1.3 實驗試劑
2.1.4 實驗所用引物
2.2 實驗方法與步驟
2.2.1 日本三角渦蟲總RNA的提取與檢測
2.2.2 一般反轉(zhuǎn)錄模板的制備
2.2.3 Real-time-PCR模板的制備
2.2.4 Real-time PCR擴增
2.2.5 HSP70家族各目的基因的生物信息學分析及系統(tǒng)進化樹構(gòu)建
2.2.6 應(yīng)激反應(yīng)過程中四目的基因的表達變化
2.2.7 HSP70家族各目的基因的原位雜交
2.2.8 HSP70家族各目的基因的RNA干擾
3 實驗結(jié)果
3.1 cDNA模板的制備
3.1.1 總RNA的提取
3.1.2 反轉(zhuǎn)錄模板cDNA的檢測
3.2 熱休克蛋白70家族四基因的生物信息學分析
3.2.1 Djhsp70a基因生物信息學分析
3.2.2 Djhsp70b基因生物信息學分析
3.2.3 Djhsp70c基因生物信息學分析
3.2.4 Djhsp70d基因的生物信息學分析
3.2.5 HSP70家族四基因?qū)?yīng)蛋白質(zhì)的同源性和進化分析
3.3 不同應(yīng)激條件下四基因的表達量變化
3.3.1 不同溫度條件處理
3.3.2 切割損傷處理
3.3.3 不同濃度離子液體處理
3.4 HSP70家族四基因的整體原位雜交結(jié)果
3.4.1 Djhsp70a基因整體原位雜交結(jié)果
3.4.2 Djhsp70b基因整體原位雜交結(jié)果
3.4.3 Djhsp70c基因整體原位雜交結(jié)果
3.4.4 Djhsp70d基因整體原位雜交結(jié)果
3.5 四基因RNA干擾結(jié)果
3.5.1 Djhsp70a基因RNA干擾結(jié)果
3.5.2 Djhsp70b基因RNA干擾結(jié)果
3.5.3 Djhsp70c基因RNA干擾結(jié)果
3.5.4 Djhsp70d基因RNA干擾結(jié)果
4 討論
4.1 四基因在應(yīng)激反應(yīng)中的保護作用
4.2 四基因的結(jié)構(gòu)分析
4.3 四基因的表達及功能分析
5 結(jié)論
參考文獻
致謝
攻讀碩士學位期間發(fā)表的論文和參與的課題
本文編號:2930912
【文章來源】:河南師范大學河南省
【文章頁數(shù)】:98 頁
【學位級別】:碩士
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摘要
ABSTRACT
1 引言
1.1 日本三角渦蟲概述
1.2 渦蟲再生研究進展
1.3 熱休克蛋白70的研究進展
1.3.1 熱休克蛋白70的分類
1.3.2 HSP70的結(jié)構(gòu)和生物學特征
1.3.3 HSP70的生物學功能
1.4 立題依據(jù)與意義
2 材料與方法
2.1 實驗材料
2.1.1 實驗材料的采集與培養(yǎng)
2.1.2 實驗儀器
2.1.3 實驗試劑
2.1.4 實驗所用引物
2.2 實驗方法與步驟
2.2.1 日本三角渦蟲總RNA的提取與檢測
2.2.2 一般反轉(zhuǎn)錄模板的制備
2.2.3 Real-time-PCR模板的制備
2.2.4 Real-time PCR擴增
2.2.5 HSP70家族各目的基因的生物信息學分析及系統(tǒng)進化樹構(gòu)建
2.2.6 應(yīng)激反應(yīng)過程中四目的基因的表達變化
2.2.7 HSP70家族各目的基因的原位雜交
2.2.8 HSP70家族各目的基因的RNA干擾
3 實驗結(jié)果
3.1 cDNA模板的制備
3.1.1 總RNA的提取
3.1.2 反轉(zhuǎn)錄模板cDNA的檢測
3.2 熱休克蛋白70家族四基因的生物信息學分析
3.2.1 Djhsp70a基因生物信息學分析
3.2.2 Djhsp70b基因生物信息學分析
3.2.3 Djhsp70c基因生物信息學分析
3.2.4 Djhsp70d基因的生物信息學分析
3.2.5 HSP70家族四基因?qū)?yīng)蛋白質(zhì)的同源性和進化分析
3.3 不同應(yīng)激條件下四基因的表達量變化
3.3.1 不同溫度條件處理
3.3.2 切割損傷處理
3.3.3 不同濃度離子液體處理
3.4 HSP70家族四基因的整體原位雜交結(jié)果
3.4.1 Djhsp70a基因整體原位雜交結(jié)果
3.4.2 Djhsp70b基因整體原位雜交結(jié)果
3.4.3 Djhsp70c基因整體原位雜交結(jié)果
3.4.4 Djhsp70d基因整體原位雜交結(jié)果
3.5 四基因RNA干擾結(jié)果
3.5.1 Djhsp70a基因RNA干擾結(jié)果
3.5.2 Djhsp70b基因RNA干擾結(jié)果
3.5.3 Djhsp70c基因RNA干擾結(jié)果
3.5.4 Djhsp70d基因RNA干擾結(jié)果
4 討論
4.1 四基因在應(yīng)激反應(yīng)中的保護作用
4.2 四基因的結(jié)構(gòu)分析
4.3 四基因的表達及功能分析
5 結(jié)論
參考文獻
致謝
攻讀碩士學位期間發(fā)表的論文和參與的課題
本文編號:2930912
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