三株原核微生物新屬種的多相分類及不同營養(yǎng)因子對(duì)微生物新物種分離的影響
發(fā)布時(shí)間:2020-01-16 22:36
【摘要】:本論文共包括兩部分研究內(nèi)容,第一部分對(duì)本實(shí)驗(yàn)室分離自菊三七屬植物的菌株HBUM179779T、HBUM179663T和分離自污泥的菌株3-BNT進(jìn)行多相分類研究;第二部分通過在VL55基礎(chǔ)培養(yǎng)基中添加6種不同的營養(yǎng)因子,利用常規(guī)稀釋和大量稀釋對(duì)土壤中的微生物新物種進(jìn)行分離。獲得以下成果:菌株HBUM179779T屬于噬幾丁質(zhì)菌科(Chitinophagaceae)的一個(gè)新屬,革蘭氏陰性,細(xì)胞呈短桿狀,具有周生鞭毛,大小為0.2-0.4μm×1.4-1.6μm。根據(jù)16S rRNA基因序列同源性比對(duì),菌株HBUM179779T與根際假黃桿菌(Pseudoflavitalea rhizosphaerae)T16R-265T的親緣關(guān)系最近,序列相似性為94.46%;蚪MDNA(G+C)mol%含量為47.1%。甲基萘醌種類為MK-7。主要脂肪酸類型為iso-C15:1 G、iso-C15:0和iso-C17:0 3-OH。主要磷酸類脂有PE和兩個(gè)未鑒定脂類。菌株HBUM179663T屬于草藥菌屬(Herbiconiux)的一個(gè)新種,革蘭氏陽性,細(xì)胞呈短桿狀,無芽胞,無鞭毛,無運(yùn)動(dòng)性,大小為0.4-0.5μm×1.4-1.6μm。根據(jù)16S rRNA基因序列同源性比對(duì),菌株HBUM179663T與馬鈴薯草藥菌(Herbiconiux Solani)K134/01T的親緣關(guān)系最近,序列相似性為96.65%;蚪MDNA(G+C)mol%含量為75.7%。甲基萘醌種類為MK-11。主要脂肪酸是anteiso-C15:0、anteiso-C17:0和C16:0。主要磷酸類脂有PLS、PME、PE和DPG。菌株3-BNT屬于伯克氏菌科(Burkholderiaceae)的一個(gè)新屬,革蘭氏陰性,細(xì)胞呈桿狀,無芽孢,單端生鞭毛,大小為0.4-0.6μm×1.8-2.1μm。根據(jù)16S rRNA基因序列同源性比對(duì),菌株3-BNT與烏汶伯克霍爾德氏菌(Burkholderia ubonensis)CIP 107078T的親緣關(guān)系最近,序列相似性為92.83%;蚪MDNA(G+C)mol%含量為42.4%。泛醌種類為UQ5、UQ6和UQ8。主要脂肪酸是C16:0、C18:1ω7c和cyclo C17:0。主要磷酸類脂有DPG、PE和PG。本實(shí)驗(yàn)通過在VL55培養(yǎng)基中添加6種不同的營養(yǎng)因子,利用常規(guī)稀釋和大量稀釋對(duì)采自河北、青海和云南三個(gè)地區(qū)的3份土壤樣品進(jìn)行微生物新物種的分離,共分離得到415株純培養(yǎng)物。河北土樣通過常規(guī)稀釋分離得到的72株菌歸屬于14個(gè)屬,大量稀釋分離得到的52株菌歸屬于22個(gè)屬;青海土樣通過常規(guī)稀釋分離得到的37株菌歸屬于9個(gè)屬,大量稀釋分離得到的50株菌歸屬于17個(gè)屬;云南土樣通過常規(guī)稀釋分離得到的71株菌歸屬于23個(gè)屬,通過大量稀釋法分離得到的133株菌歸屬于15個(gè)屬。其中,菌株HBUM200206是通過大量稀釋從青海土樣中分離得到的一株菌,與運(yùn)動(dòng)?xùn)|菌(Dongia mobilis)LM22T的親緣關(guān)系最近,序列相似性為94.58%,因此菌株HBUM200206可能是紅螺菌科(Rhodospirillaceae)的一個(gè)潛在新屬。菌株HBUM200161、HBUM200202、HBUM200239、HBUM200240、HBUM200352、HBUM200424、HBUM200427、HBUM200448、HBUM200452、HBUM200488、HBUM200497和HBUM200503與親緣關(guān)系最近的模式菌株的16S rRNA基因序列相似性均小于98.65%,可能為潛在的新種。
【圖文】:
圖 2.1 磷酸類脂雙向薄板層析ig 2.1 Two way TLC of the phosph兩個(gè)展層缸中,使缸內(nèi)氣體層至頂邊 1.5cm 取板,展層風(fēng)機(jī)逐行吹干 10-20min。再圖 2.1 所示的 2 方向上行,,試劑薄霧噴灑,于 110℃烤至PME,與 GluNu 的磷酸類脂相或掃描。然后繼續(xù)在 1401
第 2 章 三株原核微生物新屬種的多相分類seudoflavitalea rhizosphaerae)T16R-265T親緣關(guān)系最近,序列相似6%;菌株 HBUM179663T與馬鈴薯草藥菌(Herbiconiux Solani)K134/系最近,序列相似性為 96.65%;菌株 3-BNT與烏汶伯克霍爾德urkholderia ubonensis)CIP 107078T序列相似性最近,序列相似性為 92 BioEdit 和 Mega5.0 軟件構(gòu)建的三株供試菌的 N-J 系統(tǒng)發(fā)育樹,如圖 2.4 所示。
【學(xué)位授予單位】:河北大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2017
【分類號(hào)】:Q93
本文編號(hào):2570492
【圖文】:
圖 2.1 磷酸類脂雙向薄板層析ig 2.1 Two way TLC of the phosph兩個(gè)展層缸中,使缸內(nèi)氣體層至頂邊 1.5cm 取板,展層風(fēng)機(jī)逐行吹干 10-20min。再圖 2.1 所示的 2 方向上行,,試劑薄霧噴灑,于 110℃烤至PME,與 GluNu 的磷酸類脂相或掃描。然后繼續(xù)在 1401
第 2 章 三株原核微生物新屬種的多相分類seudoflavitalea rhizosphaerae)T16R-265T親緣關(guān)系最近,序列相似6%;菌株 HBUM179663T與馬鈴薯草藥菌(Herbiconiux Solani)K134/系最近,序列相似性為 96.65%;菌株 3-BNT與烏汶伯克霍爾德urkholderia ubonensis)CIP 107078T序列相似性最近,序列相似性為 92 BioEdit 和 Mega5.0 軟件構(gòu)建的三株供試菌的 N-J 系統(tǒng)發(fā)育樹,如圖 2.4 所示。
【學(xué)位授予單位】:河北大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2017
【分類號(hào)】:Q93
【參考文獻(xiàn)】
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本文編號(hào):2570492
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