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基于ITS、trnL-F、rpl16序列分析火石花的親緣關(guān)系

發(fā)布時(shí)間:2019-05-30 13:16
【摘要】:火石花(Gerbera delavayi Franch)是菊科大丁草屬中火石花屬植物,分布于我國(guó)云南省、四川省南部及越南北部地區(qū);鹗ǜ煽莺蟮娜~片具有良好的助燃性,祖先曾世代將其用于打火時(shí)取火之用,故又名“火草”;鹗ň哂袕V泛的應(yīng)用價(jià)值,首先,它葉背部的粘毛纖維可做紡織火草衣的材料,深受我國(guó)白、彝、壯、傈僳、納西族等少數(shù)民族人民的喜愛,火草紡織技藝已被列入我國(guó)第四批國(guó)家級(jí)、云南省、四川省非物質(zhì)文化遺產(chǎn)。其次,火石花的葉片可烹食,根系含有香豆素等殺菌成份,可以用于治療腸胃疾病。此外,火石花的花有一定的觀賞價(jià)值,具有作為鮮切花的潛力。如今,火石花尚未實(shí)現(xiàn)人工種植,且野生資源還受到破壞,因此,火石花的保護(hù)性開發(fā)迫在眉睫。本文對(duì)我國(guó)西南地區(qū)火石花9個(gè)居群(普洱居群、麗江居群、洱源居群、富源居群、武定居群、石林居群、新平居群、開遠(yuǎn)居群以及四川的德昌居群)rDNA ITS序列和cpDNA trnL-F、rpl16序列進(jìn)行PCR的擴(kuò)增和序列分析,并以非洲菊(Gerbera jamesonii)的ITS序列和trnL-F、rpl16序列作為外類群,比較了序列之間的差異,分析了火石花不同居群在地理距離與遺傳距離之間的關(guān)系,并構(gòu)建了 NJ系統(tǒng)發(fā)育樹,同時(shí)在Genbank上查找火石花屬植物ITS序列及trnL-F序列,進(jìn)行了序列間的比較分析,最后建立了火石花屬植物的親緣關(guān)系樹。結(jié)果表明:ITS序列分析:(1)火石花9個(gè)居群的ITS序列全長(zhǎng)介于600bp~700bp之間,平均長(zhǎng)度約為657bp,(G+C)含量為57.00%~57.55%;ITS序列共有22個(gè)變異位點(diǎn),ITS1、5.8S以及1TS2上均有變異;(2)地理距離與遺傳距離有正相關(guān)(r~2=0.652),序列間遺傳分化距離為0.0011~0.0243,其中普洱居群與其他居群間遺傳距離最大;(3)火石花9個(gè)居群分成三個(gè)分支,普洱居群?jiǎn)为?dú)成支,麗江和洱源居群聚為一支,富源、武定、德昌、石林、新平和開遠(yuǎn)6個(gè)居群聚為一支。對(duì)于火石花屬植物研究表明,部分火石花屬植物對(duì)比序列長(zhǎng)度為749bp,保守位點(diǎn)為444個(gè),變異位點(diǎn)247個(gè),有154個(gè)信息位點(diǎn),NJ樹將火石花屬植物分為二大支,得到火石花屬植物親緣關(guān)系很近。trnL-F序列分析:(1)火石花9個(gè)居群的trnL-F序列全長(zhǎng)介于800bp~1000bp之間,平均長(zhǎng)度約為880bp,其中,trnL-F序列G+C含量較低28.79%~36.35%;trnL-F序列共有241個(gè)變異位點(diǎn),trnL(UAA)內(nèi)含子序列有42個(gè),其余在trnL-trnF序列上為199個(gè);(2)地理距離與遺傳距離無相關(guān)相關(guān)(r~2=0.076),9個(gè)居群火石花親緣關(guān)系擬合不好。對(duì)于火石花屬植物研究表明,部分火石花屬植物序列對(duì)比長(zhǎng)度為903bp,保守位點(diǎn)為825個(gè),變異位點(diǎn)為30個(gè),信息位點(diǎn)為14個(gè),大多數(shù)變異位點(diǎn)可作為某一物種的特異位點(diǎn),親緣關(guān)系擬合良好,火石花屬植物同樣也被分為二大支,火石花屬親緣關(guān)系很近。rpl16序列分析:(1)火石花9個(gè)居群的rpl16序列全長(zhǎng)介于700bp~800bp之間,平均長(zhǎng)度約為737bp,變異位點(diǎn)48個(gè),(G+C)含量為52.22~52.80%之間;(2)地理距離與遺傳距離有正相關(guān)關(guān)系(r~2=0.730);(3)火石花9個(gè)居群分成三個(gè)分支,普洱居群?jiǎn)为?dú)成支,洱源居群?jiǎn)为?dú)成支,麗江、富源、武定、德昌、石林、新平和開遠(yuǎn)7個(gè)居群聚為一支。
[Abstract]:......
【學(xué)位授予單位】:昆明理工大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2017
【分類號(hào)】:Q943

【參考文獻(xiàn)】

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本文編號(hào):2488875

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