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基于ITS、trnL-F、rpl16序列分析火石花的親緣關系

發(fā)布時間:2019-05-30 13:16
【摘要】:火石花(Gerbera delavayi Franch)是菊科大丁草屬中火石花屬植物,分布于我國云南省、四川省南部及越南北部地區(qū);鹗ǜ煽莺蟮娜~片具有良好的助燃性,祖先曾世代將其用于打火時取火之用,故又名“火草”;鹗ň哂袕V泛的應用價值,首先,它葉背部的粘毛纖維可做紡織火草衣的材料,深受我國白、彝、壯、傈僳、納西族等少數(shù)民族人民的喜愛,火草紡織技藝已被列入我國第四批國家級、云南省、四川省非物質文化遺產。其次,火石花的葉片可烹食,根系含有香豆素等殺菌成份,可以用于治療腸胃疾病。此外,火石花的花有一定的觀賞價值,具有作為鮮切花的潛力。如今,火石花尚未實現(xiàn)人工種植,且野生資源還受到破壞,因此,火石花的保護性開發(fā)迫在眉睫。本文對我國西南地區(qū)火石花9個居群(普洱居群、麗江居群、洱源居群、富源居群、武定居群、石林居群、新平居群、開遠居群以及四川的德昌居群)rDNA ITS序列和cpDNA trnL-F、rpl16序列進行PCR的擴增和序列分析,并以非洲菊(Gerbera jamesonii)的ITS序列和trnL-F、rpl16序列作為外類群,比較了序列之間的差異,分析了火石花不同居群在地理距離與遺傳距離之間的關系,并構建了 NJ系統(tǒng)發(fā)育樹,同時在Genbank上查找火石花屬植物ITS序列及trnL-F序列,進行了序列間的比較分析,最后建立了火石花屬植物的親緣關系樹。結果表明:ITS序列分析:(1)火石花9個居群的ITS序列全長介于600bp~700bp之間,平均長度約為657bp,(G+C)含量為57.00%~57.55%;ITS序列共有22個變異位點,ITS1、5.8S以及1TS2上均有變異;(2)地理距離與遺傳距離有正相關(r~2=0.652),序列間遺傳分化距離為0.0011~0.0243,其中普洱居群與其他居群間遺傳距離最大;(3)火石花9個居群分成三個分支,普洱居群單獨成支,麗江和洱源居群聚為一支,富源、武定、德昌、石林、新平和開遠6個居群聚為一支。對于火石花屬植物研究表明,部分火石花屬植物對比序列長度為749bp,保守位點為444個,變異位點247個,有154個信息位點,NJ樹將火石花屬植物分為二大支,得到火石花屬植物親緣關系很近。trnL-F序列分析:(1)火石花9個居群的trnL-F序列全長介于800bp~1000bp之間,平均長度約為880bp,其中,trnL-F序列G+C含量較低28.79%~36.35%;trnL-F序列共有241個變異位點,trnL(UAA)內含子序列有42個,其余在trnL-trnF序列上為199個;(2)地理距離與遺傳距離無相關相關(r~2=0.076),9個居群火石花親緣關系擬合不好。對于火石花屬植物研究表明,部分火石花屬植物序列對比長度為903bp,保守位點為825個,變異位點為30個,信息位點為14個,大多數(shù)變異位點可作為某一物種的特異位點,親緣關系擬合良好,火石花屬植物同樣也被分為二大支,火石花屬親緣關系很近。rpl16序列分析:(1)火石花9個居群的rpl16序列全長介于700bp~800bp之間,平均長度約為737bp,變異位點48個,(G+C)含量為52.22~52.80%之間;(2)地理距離與遺傳距離有正相關關系(r~2=0.730);(3)火石花9個居群分成三個分支,普洱居群單獨成支,洱源居群單獨成支,麗江、富源、武定、德昌、石林、新平和開遠7個居群聚為一支。
[Abstract]:......
【學位授予單位】:昆明理工大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2017
【分類號】:Q943

【參考文獻】

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