本文關(guān)鍵詞：流場(chǎng)中微納顆粒受力特性的分子動(dòng)力學(xué)模擬研究，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

《吉林大學(xué)》 2016年

分子動(dòng)力學(xué)模擬研究1,4-二氫吡啶衍生物對(duì)鈣離子通道的抑制機(jī)理

劉曉光  

【摘要】：離子通道蛋白促進(jìn)離子的跨膜擴(kuò)散,是神經(jīng)系統(tǒng)的主要組成部分。在平滑肌的收縮和神經(jīng)遞質(zhì)的釋放等不同生物學(xué)過(guò)程中,它們起著關(guān)鍵作用。對(duì)于許多人類(lèi)疾病的治療,離子通道是重要的分子靶點(diǎn)。伴隨著計(jì)算機(jī)技術(shù)和計(jì)算方法的不斷發(fā)展,分子動(dòng)力學(xué)模擬已經(jīng)普遍應(yīng)用于研究生物體系內(nèi)大分子的結(jié)構(gòu)特征和功能機(jī)理。分子動(dòng)力學(xué)模擬可以在分子和原子的微觀(guān)水平上揭示生物體蛋白活動(dòng)的本質(zhì)規(guī)律,從而為相應(yīng)的實(shí)驗(yàn)研究和藥物的臨床測(cè)試提供理論支持。近幾十年來(lái),1,4-二氫吡啶衍生物(DHPs)已經(jīng)被用來(lái)治療高血壓,心絞痛和神經(jīng)系統(tǒng)疾病。作為一種最廣泛使用的抑制劑,它們高效阻滯鈣離子通道并且主要靶向于L-型鈣離子通道,但是其低選擇性促使他們同時(shí)阻滯Cav1.2鈣離子通道和Cav3.1鈣離子通道。這可能會(huì)帶來(lái)藥物的副作用和潛在的生理安全隱患。最近,科研工作者在實(shí)驗(yàn)上合成并測(cè)試了一些帶有不同疏水基團(tuán)的新型二氫吡啶衍生物。其中M12分子對(duì)Cav3.1鈣離子通道有較高的選擇性。然而,實(shí)驗(yàn)并未給出Cav3.1-DHPs復(fù)合物的結(jié)構(gòu)信息。在本文中,我們結(jié)合同源建模,分子對(duì)接,分子動(dòng)力學(xué)模擬和自由能計(jì)算來(lái)研究新型1,4-二氫吡啶衍生物對(duì)L-型鈣離子通道和T-型鈣離子通道的抑制機(jī)理。分子動(dòng)力學(xué)模擬結(jié)果顯示我們的Cav3.1模型和復(fù)合物結(jié)構(gòu)非常穩(wěn)定。自由能計(jì)算結(jié)果表明我們的模型同實(shí)驗(yàn)結(jié)果高度吻合。基于第一系列配體和第二系列配體的構(gòu)象分析,我們確認(rèn)了DHPs衍生物和鈣離子通道間的主要相互作用。并且我們進(jìn)一步從微觀(guān)角度詳細(xì)研究了配體的不同結(jié)合能。兩種鈣離子通道的不同疏水相互作用導(dǎo)致M12分子表現(xiàn)出對(duì)Cav3.1鈣離子通道的高選擇性。結(jié)合分子動(dòng)力學(xué)模擬結(jié)果,能量分布顯示Cav3.1-DHPs的結(jié)合位點(diǎn)是IIIS6段和IVS6段的幾個(gè)散布的疏水氨基酸。同時(shí),我們的研究結(jié)果為進(jìn)一步的突變實(shí)驗(yàn)和設(shè)計(jì)鈣離子通道拮抗劑的新藥效團(tuán)提供了重要信息。

【關(guān)鍵詞】：
【學(xué)位授予單位】：吉林大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2016
【分類(lèi)號(hào)】：O626.32
【目錄】：

下載全文 更多同類(lèi)文獻(xiàn)

CAJ全文下載

(如何獲取全文？ 歡迎：購(gòu)買(mǎi)知網(wǎng)充值卡、在線(xiàn)充值、在線(xiàn)咨詢(xún))

CAJViewer閱讀器支持CAJ、PDF文件格式

【相似文獻(xiàn)】

中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條

1 王麗,邊秀房,李輝;金屬Cu液固轉(zhuǎn)變及晶體生長(zhǎng)的分子動(dòng)力學(xué)模擬[J];物理化學(xué)學(xué)報(bào);2000年09期

2 滕智津,韓振為;分子動(dòng)力學(xué)模擬在蛋白質(zhì)固體表面吸附構(gòu)象轉(zhuǎn)變中的應(yīng)用[J];化學(xué)工業(yè)與工程;2005年03期

3 黃金保;劉朝;江德正;;分子動(dòng)力學(xué)模擬在聚合物熱解中的應(yīng)用[J];功能高分子學(xué)報(bào);2009年01期

4 馬云霞;趙慧霞;楊曉峰;;分子動(dòng)力學(xué)模擬的基本步驟及誤差分析[J];硅谷;2012年03期

5 吳方棣;鄭輝東;劉俊劭;鄭細(xì)鳴;;分子動(dòng)力學(xué)模擬在化工中的應(yīng)用進(jìn)展[J];重慶理工大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué));2013年10期

6 徐英武,王存新,施蘊(yùn)渝;環(huán)孢霉素A分子的隨機(jī)動(dòng)力學(xué)模擬[J];中國(guó)科學(xué)(B輯 化學(xué) 生命科學(xué) 地學(xué));1993年07期

7 王慧娟;陳成;鄧聯(lián)文;江建軍;;硅晶體中點(diǎn)缺陷結(jié)合過(guò)程的分子動(dòng)力學(xué)模擬[J];材料科學(xué)與工程學(xué)報(bào);2007年02期

8 劉倩;岳紅;張慧軍;莊昌清;;聚合物共混相容性分子動(dòng)力學(xué)模擬進(jìn)展[J];材料開(kāi)發(fā)與應(yīng)用;2011年03期

9 岳雅娟;劉清芝;伍聯(lián)營(yíng);胡仰棟;;有機(jī)分子在聚乙烯膜中擴(kuò)散過(guò)程的分子動(dòng)力學(xué)模擬[J];化工學(xué)報(bào);2012年01期

10 羅彬賓;李祥;陳云飛;;超薄水膜剪切流的分子動(dòng)力學(xué)模擬[J];機(jī)械工程學(xué)報(bào);2007年09期

中國(guó)重要會(huì)議論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條

1 黃慶生;吳洪明;吳建華;;用納米孔道測(cè)定蛋白質(zhì)序列的分子動(dòng)力學(xué)模擬[A];第八屆全國(guó)生物力學(xué)學(xué)術(shù)會(huì)議論文集[C];2006年

2 岳紅偉;王艷;陳光巨;;不同的識(shí)別劑、剪切劑對(duì)接到DNA上的動(dòng)力學(xué)模擬比較[A];中國(guó)化學(xué)會(huì)第27屆學(xué)術(shù)年會(huì)第14分會(huì)場(chǎng)摘要集[C];2010年

3 言天英;高學(xué)平;Gregory A．Voth;;分子動(dòng)力學(xué)模擬離子液體的結(jié)構(gòu)與動(dòng)力學(xué)性質(zhì)[A];中國(guó)化學(xué)會(huì)第九屆全國(guó)量子化學(xué)學(xué)術(shù)會(huì)議暨慶祝徐光憲教授從教六十年論文摘要集[C];2005年

4 黃世萍;;分子篩中烷烴的甲基旋轉(zhuǎn)動(dòng)力學(xué):分子動(dòng)力學(xué)模擬研究[A];中國(guó)化學(xué)會(huì)第26屆學(xué)術(shù)年會(huì)理論化學(xué)方法和應(yīng)用分會(huì)場(chǎng)論文集[C];2008年

5 田國(guó)才;華一新;;分子動(dòng)力學(xué)模擬研究離子液體中水分子的光譜和動(dòng)力學(xué)[A];中國(guó)化學(xué)會(huì)第26屆學(xué)術(shù)年會(huì)理論化學(xué)方法和應(yīng)用分會(huì)場(chǎng)論文集[C];2008年

6 王后芳;雷鳴;;小分子抑制劑與甲狀腺結(jié)合前清蛋白對(duì)接,分子動(dòng)力學(xué)模擬及結(jié)合自由能計(jì)算研究[A];中國(guó)化學(xué)會(huì)第26屆學(xué)術(shù)年會(huì)化學(xué)信息學(xué)與化學(xué)計(jì)量學(xué)分會(huì)場(chǎng)論文集[C];2008年

7 張輝;李全偉;李英;李志強(qiáng);;泡沫液膜的分子動(dòng)力學(xué)模擬及泡沫析液機(jī)制的研究[A];中國(guó)化學(xué)會(huì)第十二屆膠體與界面化學(xué)會(huì)議論文摘要集[C];2009年

8 徐愛(ài)進(jìn);周哲瑋;胡國(guó)輝;;固體平板上超薄水膜潤(rùn)濕過(guò)程的分子動(dòng)力學(xué)模擬[A];慶祝中國(guó)力學(xué)學(xué)會(huì)成立50周年暨中國(guó)力學(xué)學(xué)會(huì)學(xué)術(shù)大會(huì)’2007論文摘要集（下）[C];2007年

9 張繼偉;卞富永;施國(guó)軍;徐四川;;多巴胺在細(xì)胞膜中擴(kuò)散和透過(guò)分子動(dòng)力學(xué)模擬研究[A];第八屆全國(guó)化學(xué)生物學(xué)學(xué)術(shù)會(huì)議論文摘要集[C];2013年

10 趙克杰;陳常青;;銅單晶中納米孔洞生長(zhǎng)尺度效應(yīng)的分子動(dòng)力學(xué)模擬[A];慶祝中國(guó)力學(xué)學(xué)會(huì)成立50周年暨中國(guó)力學(xué)學(xué)會(huì)學(xué)術(shù)大會(huì)’2007論文摘要集（下）[C];2007年

中國(guó)重要報(bào)紙全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前2條

1 ;[N];中國(guó)電子報(bào);2006年

2 記者 耿挺;[N];上�？萍紙�(bào);2014年

中國(guó)博士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條

1 張?jiān)瓢?微尺度下單晶硅疲勞失效機(jī)理的分子動(dòng)力學(xué)模擬研究[D];國(guó)防科學(xué)技術(shù)大學(xué);2014年

2 于華;蛋白質(zhì)—肽相互作用的分子動(dòng)力學(xué)模擬研究[D];浙江大學(xué);2015年

3 張仕通;層狀復(fù)合金屬氫氧化物理論模擬分子力場(chǎng)的建立及其結(jié)構(gòu)拓?fù)滢D(zhuǎn)變研究[D];北京化工大學(xué);2015年

4 馮婷婷;幾種重要疾病蛋白和抑制劑相互作用機(jī)理的分子動(dòng)力學(xué)模擬研究[D];中國(guó)科學(xué)技術(shù)大學(xué);2015年

5 劉金峰;發(fā)展和應(yīng)用分塊的量子化學(xué)方法進(jìn)行生物大分子性質(zhì)計(jì)算和動(dòng)力學(xué)模擬[D];華東師范大學(xué);2016年

6 孫浩;糖原合成酶激酶-3β結(jié)構(gòu)與功能的動(dòng)力學(xué)模擬研究[D];浙江大學(xué);2009年

7 陳林;極端嗜熱蛋白結(jié)構(gòu)與功能的分子動(dòng)力學(xué)模擬研究[D];吉林大學(xué);2013年

8 王瑩;基于分子動(dòng)力學(xué)模擬的兩種重要蛋白結(jié)構(gòu)與功能研究[D];上海交通大學(xué);2012年

9 薛嶠;分子動(dòng)力學(xué)模擬在生物大分子體系中的應(yīng)用[D];吉林大學(xué);2014年

10 楊坤;一類(lèi)非平衡分子動(dòng)力學(xué)模擬中優(yōu)化方法的研究[D];大連理工大學(xué);2009年

中國(guó)碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條

1 楊梁;流場(chǎng)中微納顆粒受力特性的分子動(dòng)力學(xué)模擬研究[D];浙江大學(xué);2015年

2 袁軍;NPT系綜下應(yīng)用ABEEM-7P水分子模型對(duì)水的動(dòng)力學(xué)模擬[D];遼寧師范大學(xué);2015年

3 高亞;分子在ITQ-3分子篩內(nèi)擴(kuò)散行為的分子動(dòng)力學(xué)模擬[D];中北大學(xué);2016年

4 王丹丹;納米孔道內(nèi)分子擴(kuò)散性質(zhì)的分子動(dòng)力學(xué)模擬[D];中北大學(xué);2016年

5 李堃;受限納流體的分子動(dòng)力學(xué)模擬與DNA檢測(cè)[D];東南大學(xué);2015年

6 許兆林;粗糙固體表面對(duì)流動(dòng)與傳熱影響機(jī)理的分子動(dòng)力學(xué)模擬研究[D];東南大學(xué);2015年

7 孫丹丹;C_(60)、脂質(zhì)納氣泡與類(lèi)細(xì)胞膜作用的分子動(dòng)力學(xué)模擬研究[D];東南大學(xué);2015年

8 張志明;CDK2的分子動(dòng)力學(xué)模擬研究[D];吉林大學(xué);2016年

9 劉曉光;分子動(dòng)力學(xué)模擬研究1,4-二氫吡啶衍生物對(duì)鈣離子通道的抑制機(jī)理[D];吉林大學(xué);2016年

10 王后芳;甲狀腺結(jié)合前清蛋白與小分子結(jié)合的分子對(duì)接及動(dòng)力學(xué)模擬研究[D];北京化工大學(xué);2008年

  本文關(guān)鍵詞：流場(chǎng)中微納顆粒受力特性的分子動(dòng)力學(xué)模擬研究，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。