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海洋細(xì)菌SAR86全球分布及其多樣性研究

發(fā)布時(shí)間:2024-07-02 19:47
  地球表面積約有71%是海洋,海洋環(huán)境獨(dú)特且復(fù)雜,其中海洋微生物多樣的生活環(huán)境與種類是海洋生態(tài)系統(tǒng)的重要組成部分。海洋微生物在高壓力、高鹽度、低溫度、寡營(yíng)養(yǎng)狀態(tài)等特殊環(huán)境中具有可適應(yīng)的生理特征和獨(dú)特的細(xì)胞結(jié)構(gòu),由于適應(yīng)這些特殊環(huán)境的獨(dú)有機(jī)制,成為了生命起源演化與微生物進(jìn)化的基礎(chǔ)。浮游細(xì)菌是海洋微生物的重要組成部分,在“微生物食物環(huán)”中發(fā)揮非常重要的作用,它的生產(chǎn)力相當(dāng)于整個(gè)海洋初級(jí)生產(chǎn)力的10-80%左右,這種過程還承擔(dān)著海洋中75-95%有機(jī)質(zhì)的分解任務(wù)。海洋環(huán)境中的變形菌門作為重要的浮游細(xì)菌類群,它們?cè)诤Q笾械奶佳h(huán)和氮循環(huán)等物質(zhì)循環(huán)中都具有很重要的作用。在海洋中,變形菌門是主要的微生物類群之一,隸屬變形菌門γ-變形菌綱的海洋細(xì)菌SAR86近年來(lái)成為研究熱點(diǎn)之一。本研究采用生物統(tǒng)計(jì)學(xué)、分子生態(tài)學(xué)以及高通量測(cè)序分析等方法對(duì)海洋細(xì)菌SAR86的全球分布及其生態(tài)功能進(jìn)行研究分析。我們對(duì)NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)里的3398條SAR86序列進(jìn)行分析,這些序列采集自五大洋中的海水樣品。基于對(duì)擴(kuò)增的16S rRNA序列分析,發(fā)現(xiàn)SAR86的多樣性在分類學(xué)水平上顯示出明顯的生物地理學(xué)分布特征。通過數(shù)據(jù)分析,我...

【文章頁(yè)數(shù)】:56 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

圖1采樣的地理位置以創(chuàng)建用于此分析的SAR86的16SrRNA基因

圖1采樣的地理位置以創(chuàng)建用于此分析的SAR86的16SrRNA基因

海洋細(xì)菌SAR86全球分布及其多樣性研究18圖1采樣的地理位置以創(chuàng)建用于此分析的SAR86的16SrRNA基因。紅色圓點(diǎn)代表SAR86在全球內(nèi)的位置分布。大部分SAR86分布在近海,分布在全球海洋中。Figure1Thegeographicallocationssampledto....


圖2SAR86OTU在五個(gè)海洋系統(tǒng)中的分布

圖2SAR86OTU在五個(gè)海洋系統(tǒng)中的分布

海洋細(xì)菌SAR86全球分布及其多樣性研究18圖1采樣的地理位置以創(chuàng)建用于此分析的SAR86的16SrRNA基因。紅色圓點(diǎn)代表SAR86在全球內(nèi)的位置分布。大部分SAR86分布在近海,分布在全球海洋中。Figure1Thegeographicallocationssampledto....


圖3在四個(gè)季節(jié)中16SrRNA宏基因組SAR86組的系統(tǒng)樹

圖3在四個(gè)季節(jié)中16SrRNA宏基因組SAR86組的系統(tǒng)樹

第三章SAR86的SAR86的全球分布及功能預(yù)測(cè)19是每個(gè)分支中分支數(shù)量最多的海洋。Figure3DistributionofSAR86OTUsinfiveoceans.TheverticalaxisisthepercentageofallOTUs,thehorizontalax....


圖4SAR86在五個(gè)大洋中不同深度的分布,垂直軸是各分支OTU的百分比

圖4SAR86在五個(gè)大洋中不同深度的分布,垂直軸是各分支OTU的百分比

海洋細(xì)菌SAR86全球分布及其多樣性研究203.2.3SAR86的水層分布從SAR86在全球海洋中的深度分布(圖4),SAR86分布在大西洋和太平洋的最大深度為120和180米。最低的分配深度位于海水表面。SAR86的豐度是太平洋0至50米深度中最大的。OTU的數(shù)量達(dá)到所有序列的....



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