【摘要】：地山雀(Pseudopodoceshumilis)是一種青藏高原特有的鳥(niǎo)類。我們使用了來(lái)自26個(gè)地理種群的425個(gè)樣本,以線粒體DNA的細(xì)胞色素b基因的部分序列(890bp)作為分子標(biāo)記,對(duì)地山雀的種群遺傳和地理分布進(jìn)行了研究,結(jié)論如下:1、890bp的序列中包含了 29個(gè)多態(tài)位點(diǎn),其中簡(jiǎn)約信息位點(diǎn)有21個(gè),共獲得27種單倍型,其中Hap_1和Hap_2為分布最廣、數(shù)量最多的單倍型,占到整個(gè)種群的65%以上,總的單倍型多樣性(Hd)為0.73861,核昔酸多樣性(π)為0.00221,各地理種群的單倍型多樣性在0～0.81699之間,最高的為那曲:0.81699,而剛察、芒康和諾爾蓋這3個(gè)種群僅包含一種單倍型。2、根據(jù)單倍型網(wǎng)絡(luò)圖和系統(tǒng)發(fā)育圖,Hap_1和Hap_2為中心單倍型,分布范圍最廣,擁有最多的衛(wèi)星單倍型,Hap_12和Hap_26距離其他單倍型的遺傳距離最遠(yuǎn),其地理分布也局限于青藏高原北部邊緣的青海地區(qū),以大山雀(Parusmajor)作為外群的ML樹(shù),顯示Hap_9和Hap_10是最早分化的單倍型,預(yù)示著西藏東部角可能是一個(gè)冰期避難所。3、地山雀的遺傳分化系數(shù)Gst=0.428855,Fst=0.67386,Hs=0.42092,各種群的Gst的范圍為-0.03109～1,Fst的范圍為-0.27717～1,根據(jù)Fst構(gòu)建的UPGMA樹(shù),結(jié)合地理分布信息,可以把地山雀分為4個(gè)群組:北部組(青藏高原北緣的青海地區(qū))、南部組(青藏高原東南角)、中西部組(青藏高原中西部)和東部組(青藏高原東緣)。北部組相較于其他3個(gè)組的分化程度更高,而中西部組和東部組間的分化程度很低。
[Abstract]:(Pseudopodoceshumilis) is a unique bird on the Qinghai-Tibet Plateau. Using 425 samples from 26 geographical populations and partial sequence of cytochrome b gene (890bp) of mitochondrial DNA as molecular marker, we studied the population inheritance and geographical distribution of groundbird. The results are as follows: the sequence of 1890bp contains 29 polymorphic loci, among which 21 are parsimonious information sites. 27 haplotypes have been obtained, among which Hap_1 and Hap_2 are the most widely distributed haplotypes, accounting for more than 65% of the total population. The total haplotype diversity (Hd) was 0.73861, and the nucleic acid diversity (蟺) was 0.00221. The haplotype diversity of various populations ranged from 0 to 0.81699, and the highest was Naqu: 0.81699. The three populations of Muncombe and Norgey contain only one haplotype. 2. According to haplotype networks and phylogenetic maps, Hap_1 and Hap_2 are central haplotypes, most widely distributed and with the largest number of satellite haplotypes. The genetic distance between Hap_12 and Hap_26 is the furthest from other haplotypes, and its geographical distribution is also confined to the Qinghai region on the northern edge of the Qinghai-Xizang Plateau. (Parusmajor) is used as the outer group of ML trees. Hap_9 and Hap_10 are the earliest haplotypes, indicating that the eastern corner of Tibet may be an ice age shelter. 3. Genetic differentiation coefficient Gst=0.428855,Fst=0.67386,Hs=0.42092, The range of Gst of various groups is -0.03109, the range of FST is -0.277171.According to the UPGMA tree constructed by Fst and combining with geographical distribution information, it can be divided into four groups: the northern group (Qinghai region on the northern edge of the Qinghai-Tibet Plateau). The southern group (southeast corner of the Qinghai-Tibet Plateau), the central and western group (central and western Qinghai-Tibet Plateau) and the eastern group (eastern margin of the Qinghai-Xizang Plateau). The differentiation degree of the northern group was higher than that of the other three groups, but the differentiation degree between the central and western group and the eastern group was very low.
【學(xué)位授予單位】：武漢大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2017
【分類號(hào)】：Q953

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本文編號(hào)：2324033