發(fā)布時間：2018-06-25 21:18

  本文選題：佛法僧目 + 線粒體全基因組��； 參考：《魯東大學》2017年碩士論文

【摘要】：鳥類作為脊椎動物亞門的一綱,種類有9000多種,是脊椎動物中品種最豐富的類群。當下普遍關注鳥類形成發(fā)展過程和系統(tǒng)進化關系,但在某些層面存在分歧,單純的依靠研究動物外形狀態(tài)很難進行區(qū)分。由于線粒體DNA擁有嚴格母系遺傳、簡單的搭配構(gòu)造、進化速度快、DNA變異速率高的特性,在研究脊椎動物的系統(tǒng)發(fā)育、分類中具備重要作用。研究各物種mt DNA序列的演化歷史和遺傳信息的構(gòu)成,可為確定物種發(fā)育地位、保護遺傳資源提供依據(jù)。目前在美國國家生物技術(shù)信息中心只公開了鳥類線粒體280多種全基因組序列,與龐大的物種品種總數(shù)相對比,數(shù)量特別稀少。此次研究過程中,通過測序、搭建手段、聚合酶鏈式反應第一次獲得佛法僧目(Coraciiformes)白胸翡翠(Halcyon smyrnensis),普通翠鳥(Alcedo atthis)和斑魚狗(Ceryle rudis)3種鳥類線粒體全基因組序列。其長度在17,892 bp-17,223 bp之間,在結(jié)構(gòu)特性、組成成分擁有相似性:(1)編碼蛋白質(zhì)的序列為13個、rRNA序列為2個、t RNA序列為22個,非編碼控制區(qū)為1個,L鏈中具備蛋白基因1個和t RNA8個,剩余的在H鏈中;(2)線粒體基因組的A+T百分比分別是55.15%、55.26%和54.30%,G+C含量分別為44.85%、44.74%和45.70%,擁有AT堿基偏向;(3)可將控制區(qū)劃分為3個區(qū)(Domain I III),涵蓋了保守序列區(qū)、復制終止TAS相關序列、雙向啟動子和重鏈復制起始等;(4)三種鳥類的ND3基因中位于174位點為一個“C”,該情況也出現(xiàn)在古顎總目某些物種之中;(5)三種鳥類的控制區(qū)Domain III均有不同程度的串聯(lián)重復序列;這些特點都符合鳥類線粒體基因組的結(jié)構(gòu)特征。實驗涉及佛法僧目,目前本目的線粒體全基因組序列信息較少,結(jié)合先前對佛法僧目的研究結(jié)論涉及的相關7個目共17個物種的數(shù)據(jù)對佛法僧目的系統(tǒng)發(fā)育關系進行了分析。以紅原雞(Gallus gallus)作為外群,用貝葉斯法(BI)構(gòu)建的系統(tǒng)進化樹顯示:(1)佛法僧目是一個單系型;(2)在佛法僧目中,把普通翠鳥劃歸翠鳥科,斑魚狗和冠魚狗劃歸魚狗科,赤翡翠、白眉翡翠、藍翡翠和白胸翡翠劃歸笑翠鳥科,三寶鳥劃歸為佛法僧科(后驗概率值為1.00);(3)，

本文編號：2067519