本文選題：春性甘藍型油菜 + 開花相關基因　； 參考：《青海大學》2017年碩士論文

【摘要】：油菜是世界重要油料作物之一,也是我國重要的食用油來源,其在我國的種植面積和總產(chǎn)均居世界首位。而開花是影響油菜成熟期、產(chǎn)量及品質的重要因素。油菜開花相關基因的研究具有重要的理論價值和應用前景。本研究以特早熟春性甘藍型油菜86號為研究材料,利用cDNA-AFLP技術篩選其苗期和蕾期差異表達的基因片段,克隆出差異表達基因的cDNA全長序列,并通過相對熒光定量PCR分析其在油菜不同時期不同組織的表達模式。主要研究結果如下:(1)cDNA-AFLP篩選分離出86號油菜苗期和蕾期差異表達的基因序列共64條,經(jīng)BLAST比對,有54條序列均在油菜基因組序列中,其中的42條序列與擬南芥已知功能的基因序列相似度極高;另外12條序列雖在油菜基因組上,但其功能未知,也未在其它植物中分離出,是一些未知基因片段。(2)用RACE技術克隆出了未知基因片段中的84-23、85-25、128-1、107-23、171-1、174-1基因的3'端全長序列和128-1、107-23、167-12基因的5'端全長序列,并根據(jù)擴增出的5'和3'序列設計的全長引物克隆出了128-1和107-23的cDNA全長序列。其中克隆出的128-1基因cDNA全長為1071bp,序列分析發(fā)現(xiàn),該基因與甘藍型油菜中預測的基因XM_013850601.1只有1個堿基的同義突變。128-1基因編碼349個氨基酸殘基的蛋白,氨基酸同源比對發(fā)現(xiàn)該蛋白可能與TPR超家族蛋白合成有關�？寺〕龅�107-23基因cDNA全長1345bp,與甘藍型油菜中預測的XM_013752386.1基因編碼區(qū)相似度很高,但在5'有1個堿基的突變,3'端有2個堿基的突變。107-23基因編碼358個氨基酸殘基的蛋白,氨基酸同源比對表明該蛋白可能是與開花相關的轉錄因子TCP2。(3)通過RT-qPCR分析差異表達基因128-1和107-23在86號油菜不同時期不同組織的表達情況,發(fā)現(xiàn)兩基因在苗期、蕾期和花期各組織都有表達,其中128-1基因在花期花組織的表達量最高。本研究結果表明,新型春性甘藍型油菜中篩選出的差異表達基因128-1和107-23可能與油菜開花基因有關,具體功能有待進一步轉基因驗證。
[Abstract]:Rape is one of the most important oil crops in the world, and it is also an important source of edible oil in China. Flowering is an important factor affecting the maturity, yield and quality of rape. The study of flowering related genes in rapeseed has important theoretical value and application prospect. In this study, early maturing Brassica napus 86 was used as the research material. CDNA-AFLP technique was used to screen the differentially expressed gene fragments at seedling and bud stages, and the full-length cDNA sequence of differentially expressed genes was cloned. The expression patterns in different tissues of rapeseed were analyzed by relative fluorescence quantitative PCR. The main results were as follows: a total of 64 differentially expressed genes were isolated from rape (Brassica napus L.) at seedling stage and bud stage by cDNA-AFLP screening. By BLAST alignment, 54 sequences were found in rapeseed genome sequence. 42 of these sequences were highly similar to those of Arabidopsis thaliana with known functions, and the other 12 sequences were unknown and not isolated from other plants, although they were in the genome of Brassica napus. RACE technique was used to clone the full length of 84-23128-1107-23171-1174-1 and 128-1107-23167-12, respectively. The full-length cDNA sequences of 128-1 and 107-23 were cloned according to the amplified 5 'and 3' full-length primers. The total length of 128-1 gene cDNA was 1071bp.The sequence analysis showed that this gene and the predicted gene XM_013850601.1 in Brassica napus had only one base of synonymous mutation .128-1 gene encoding 349 amino acid residues. Amino acid homology analysis revealed that this protein might be related to the synthesis of TPR superfamily proteins. The total length of cDNA of 107-23 gene was 1345bp. it was similar to the predicted coding region of XM_013752386.1 gene in Brassica napus, but there were two base mutations at the 3'end of 5'base mutation. 107-23 gene encoded 358 amino acid residues. Amino acid homology analysis indicated that the protein may be a transcription factor related to flowering, TCP2.3. the differential expression genes 128-1 and 107-23 were analyzed by RT-qPCR in different tissues of rape 86 at different stages, and the two genes were found to be in seedling stage. The expression of 128-1 gene was the highest in flower tissues. The results showed that the differentially expressed genes 128-1 and 107-23 may be related to the flowering genes of Brassica napus.
【學位授予單位】：青海大學
【學位級別】：碩士
【學位授予年份】：2017
【分類號】：S565.4;Q943.2

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本文編號：1876008