本研究通過基因挖掘法、培養(yǎng)法和文獻(xiàn)調(diào)研,分別搜索分析了鉻耐受菌、鉻還原菌和鉻耐受還原菌多樣性,為鉻污染環(huán)境修復(fù)提供微生物資源。（1）鉻耐受菌的多樣性研究。將長鏈chrA基因選作鉻耐受機(jī)制的代表基因在JGI基因組數(shù)據(jù)庫（JGI Genome database）中調(diào)查鉻耐受菌的多樣性�；虻恼{(diào)查以種為單位,在JGI Genome database中共有7887條不同菌種的基因組數(shù)據(jù),其中1887個(gè)菌種攜帶長鏈chrA基因。這1887株菌分布于21個(gè)不同的菌門,39個(gè)綱,74個(gè)目,172個(gè)科和620屬。其中變形菌門（Proteobacteria）包含的菌株最多（1091株）,其次為厚壁菌門（Firmicutes,237株）,擬桿菌門（Bacteroidetes,181株）和放線菌門（Actinobacteria,174株）。在屬水平上,假單胞菌屬（Pseudomonas）包含的菌株最多（49株）,其次為芽孢桿菌屬（Bacillus,46株）和弧菌屬（Vibrio,43株）。通過培養(yǎng)法,從西溪濕地土壤中直接篩選到9株六價(jià)鉻耐受菌,其中4株屬于放線菌門（Actinobacteria）,3株屬于變... 

【文章頁數(shù)】：72 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【文章目錄】：
致謝
摘要
Abstract
1 引言
    1.1 鉻污染與微生物修復(fù)
        1.1.1 鉻污染現(xiàn)狀
        1.1.2 鉻污染的危害
        1.1.3 鉻污染的微生物修復(fù)技術(shù)
    1.2 細(xì)菌鉻耐受、還原機(jī)制
        1.2.1 鉻外排機(jī)理
        1.2.2 鉻還原機(jī)理
        1.2.3 DNA損傷修復(fù)
        1.2.4 鉻耐受菌和鉻耐受還原菌
    1.3 微生物群落多樣性研究方法
        1.3.1 傳統(tǒng)培養(yǎng)法
        1.3.2 Biolog微平板法
        1.3.3 磷脂脂肪酸方法
        1.3.4 現(xiàn)代分子生物學(xué)方法
    1.4 論文選題及技術(shù)路線
        1.4.1 論文選題
        1.4.2 技術(shù)路線
2 鉻耐受菌的多樣性調(diào)研
    2.1 實(shí)驗(yàn)材料及儀器
    2.2 實(shí)驗(yàn)方法
        2.2.1 長鏈chrA基因的搜索
        2.2.2 長鏈chrA基因序列OTU聚類
        2.2.3 長鏈ChrA系統(tǒng)發(fā)育樹的構(gòu)建
        2.2.4 培養(yǎng)法篩選六價(jià)鉻耐受菌
        2.2.5 六價(jià)鉻耐受菌的鑒定
        2.2.6 六價(jià)鉻耐受菌對Cr(Ⅵ)的耐受能力的測定
    2.3 結(jié)果與討論
        2.3.1 在JGI Genome database中鉻耐受菌的搜索結(jié)果及多樣性分析..
        2.3.2 長鏈ChrA蛋白序列的系統(tǒng)發(fā)育分析
        2.3.3 六價(jià)鉻耐受菌的篩選及多樣性分析
        2.3.4 文獻(xiàn)中已篩選到的鉻耐受菌株的多樣性分析
        2.3.5 新菌種Epilithonimonas xixisoli sp.nov.的鉻耐受能力測定
        2.3.6 基因挖掘法、培養(yǎng)法和文獻(xiàn)調(diào)研所得結(jié)果的綜合分析
    2.4 小結(jié)
3 鉻還原菌的多樣性調(diào)研
    3.1 實(shí)驗(yàn)材料及儀器
    3.2 實(shí)驗(yàn)方法
        3.2.1 Cr(Ⅵ)reductase基因的搜索
        3.2.2 系統(tǒng)發(fā)育樹的構(gòu)建
    3.3 結(jié)果與討論
        3.3.1 在JGI Genome database中鉻還原菌的搜索結(jié)果及多樣性分析
        3.3.2 Cr(Ⅵ)reductase蛋白序列的系統(tǒng)發(fā)育分析
    3.4 小結(jié)
4 鉻耐受還原菌的多樣性調(diào)研
    4.1 實(shí)驗(yàn)材料及儀器
    4.2 實(shí)驗(yàn)方法
        4.2.1 長鏈chrA及Cr(Ⅵ)reductase基因的搜索
        4.2.2 系統(tǒng)發(fā)育樹的構(gòu)建
        4.2.3 六價(jià)鉻耐受還原菌的篩選及還原能力測定
    4.3 結(jié)果與討論
        4.3.1 在JGI Genome database中鉻耐受還原菌的搜索結(jié)果及多樣性分析
        4.3.2 長鏈ChrA蛋白、Cr(Ⅵ)reductase蛋白和16S rRNA基因序列的系統(tǒng)發(fā)育分析
        4.3.3 六價(jià)鉻耐受還原菌的篩選
        4.3.4 六價(jià)鉻耐受還原菌Arthrobacter sp.GL06還原能力的測定
        4.3.5 文獻(xiàn)中已篩選到的鉻耐受還原菌株的多樣性分析
        4.3.6 基因挖掘法、培養(yǎng)法和文獻(xiàn)調(diào)研所得結(jié)果的綜合分析
    4.4 小結(jié)
5 研究結(jié)論與展望
    5.1 研究結(jié)論
    5.2 展望
參考文獻(xiàn)
作者簡歷


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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本文編號：3646935