阿特拉津降解菌株BTAH1的分離鑒定、降解特性及應(yīng)用的研究
發(fā)布時(shí)間:2021-10-15 21:52
阿特拉津,也稱莠去津,是在世界范圍內(nèi)廣泛使用的一種三嗪類除草劑,在國(guó)內(nèi)外雜草防除上占有重要的地位。阿特拉津雖然是一種低毒除草劑,但在土壤中具有比較長(zhǎng)的持留性,其半衰期長(zhǎng),使用量大,因此在國(guó)外很多自然水體中都檢測(cè)到了阿特拉津及其降解產(chǎn)物,并且很多濃度都遠(yuǎn)遠(yuǎn)超過(guò)美國(guó)環(huán)保局規(guī)定的安全濃度,造成嚴(yán)重的環(huán)境污染,隨著除草劑在我國(guó)的推廣使用,阿特拉津給我國(guó)的環(huán)境也帶來(lái)了很大的影響,多次發(fā)生嚴(yán)重污染事故。阿特拉津的長(zhǎng)殘留性還有一個(gè)非常嚴(yán)重的后果,即對(duì)后茬作物的藥害問題。有研究表明,當(dāng)土壤中含量大于0.1mg/kg時(shí),即影響小麥的萌發(fā)與生長(zhǎng),而對(duì)于極其敏感的作物水稻來(lái)說(shuō),河水中阿特拉津?qū)λ久缙诘陌踩喔葷舛葹?.01mg/L,而對(duì)水稻的致死濃度是0.1mg/L。在阿特拉津污染修復(fù)的過(guò)程中,通常使用的兩種生物處理的方案:生物刺激和生物原位修復(fù)。對(duì)生物刺激來(lái)說(shuō),如果要成功,土著微生物必須已經(jīng)具備阿特拉津代謝的能力,它們的代謝活性可以通過(guò)對(duì)土壤補(bǔ)充適當(dāng)?shù)臓I(yíng)養(yǎng)物質(zhì)而得到增強(qiáng)。在生物原位修復(fù)中,土著微生物不具有阿特拉津降解能力而必須通過(guò)外源微生物的投加來(lái)獲得這一能力。一系列的實(shí)驗(yàn)表明采用生物原位的方法來(lái)消除土...
【文章來(lái)源】:南京農(nóng)業(yè)大學(xué)江蘇省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:139 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
符號(hào)與縮略語(yǔ)
第一章 除草劑阿特垃津生物降解研究進(jìn)展
1 概述
1.1 理化性質(zhì)
1.2 毒性
1.3 應(yīng)用范圍
1.4 不同作物對(duì)阿特拉津的抗性
1.5 阿特拉津?qū)ψ魑锏乃幒胺治?br> 1.6 有關(guān)阿特拉津的一些標(biāo)準(zhǔn)
2 阿特拉津的微生物降解
2.1 簡(jiǎn)單的s-三嗪化合物的微生物代謝
2.2 阿特拉津的微生物代謝
參考文獻(xiàn)
第二章 研究中所涉及的主要研究方法概述
1 常見鑒定分類方法概述
1.1 概述
1.2 表型多樣性研究
1.3 遺傳多樣性研究
2 降解基因的克隆方法概述
2.1 根據(jù)已知序列克隆基因
2.2 新基因的克隆方法
參考文獻(xiàn)
第三章 阿特拉津降解菌的富集、分離及鑒定
第一節(jié) 阿特拉津降解菌的富集和分離
1 材料與方法
1.1 培養(yǎng)基和儀器
1.2 土壤樣品的富集
1.3 阿特拉津降解菌的分離
1.4 阿特拉津濃度的檢測(cè)
1.5 BTAH1碳源、氮源和微生物利用
1.6 蛋白胨、酵母粉和NaCl濃度對(duì)BTAH1生長(zhǎng)的影響
1.7 BTAH1在基礎(chǔ)鹽培養(yǎng)基和1/10LB培養(yǎng)基中生長(zhǎng)曲線的測(cè)定
1.8 BTAH1最適生長(zhǎng)條件的測(cè)定
1.9 BTAH1的生理塵化鑒定
1.10 BTAH1的16S rDNA序列的測(cè)定
2 結(jié)果與分析
2.1 阿特拉津降解菌的分離及其對(duì)阿特拉津的降解情況
2.2 菌株BTAH1對(duì)維生素、碳源和氮源的利用情況及蛋白胨濃度對(duì)BTAH1生長(zhǎng)的影響
2.3 BTAH1在基礎(chǔ)鹽培養(yǎng)基和1/10 LB培養(yǎng)基中的生長(zhǎng)曲線
2.4 溫度、通氣量和pH值對(duì)BTAH1生長(zhǎng)的影響
2.5 BTAH1的生理生化鑒定
2.6 BTAH1基因組DNA的提取和16S rDNA的擴(kuò)增
2.7 菌株BTAH1 16S rDNA序列的聚類分析
3 討論
第二節(jié) 阿特拉津降解菌株BTAH1的鑒定
1 材料與方法
1.1 培養(yǎng)基
1.2 菌株
1.3 模式菌株的活化
1.4 碳源發(fā)酵實(shí)驗(yàn)
1.5 16S rDNA同源性分析
1.6 菌體的培養(yǎng)、收集及DNA的大量提取
1.7 用于DNA-DNA液相雜交的DNA濃度、純度檢查
1.8 Tm值及G+C mol%測(cè)定
1.9 DNA-DNA雜交
2 結(jié)果與分析
2.1 BTAH1與四個(gè)模式菌株在形態(tài)學(xué)上的比較
2.2 BTAH1與四個(gè)模式菌株在碳源發(fā)酵產(chǎn)酸上的比較
2.3 五個(gè)菌株16S rDNA同源性的比較
2.4 菌株BTAH1的Tm值和G+C%含量及DNA-DNA液相雜交溫度的確定
2.5 DNA-DNA液相雜交復(fù)性速率及DNA-DNA同源性
3 討論
參考文獻(xiàn)
第四章 菌株BTAH1對(duì)阿特拉津的降解特性與降解基因的研究
第一節(jié) 菌株BTAH1對(duì)阿特拉津降解特性的研究
1 材料與方法
1.1 培養(yǎng)基和藥品
1.2 菌株BTAH1對(duì)阿特拉津的利用
1.3 培養(yǎng)基氮濃度及pH值測(cè)定
1.4 溫度和pH對(duì)菌株BTAH1降解阿特拉津的影響
1.5 菌株BTAH1對(duì)阿特拉津的脫氯作用
1.6 菌株BTAH1降解中間產(chǎn)物的檢測(cè)
1.7 菌株BTAH1降解譜的測(cè)定
2.結(jié)果與分析
2.1 菌株BTAH1對(duì)阿特拉津的利用
2.2 菌株BTAH1降解后培養(yǎng)基的氨濃度和pH值
2.3 溫度和pH值對(duì)阿特拉津降解的影響
2.4 BTAH1對(duì)阿特拉津的脫氯作用
2.5 降解過(guò)程中羥基阿特拉津的檢測(cè)
2.6 降解過(guò)程中氰尿酸的檢測(cè)
2.7 BTAH1的降解譜
3 討論
第二節(jié) 菌株BTAH1阿特拉津降解基因保守性的研究及降解基因的定位
1 材料與方法
1.1 培養(yǎng)基和試劑
1.2 菌株
1.3 基因組DNA的小量提取
1.4 阿特拉津降解基因保守片段的擴(kuò)增
1.5 質(zhì)粒DNA的小量提取
1.6 質(zhì)粒DNA的小量酶切
1.7 BTAH1的阿特拉津降解基因的Southern雜交定位
2.結(jié)果與分析
2.1 阿特拉津降解基因保守片段的擴(kuò)增
2.2 阿特拉津降解基因保守性的分析
2.3 菌株BTAH1中質(zhì)粒的檢測(cè)
2.4 菌株BTAH1中質(zhì)粒的純化和酶切比較
2.5 菌株BTAH1阿特拉津降解基因的定位
3 討論
第三節(jié) BTAH1質(zhì)粒上阿特拉津降解相關(guān)片段的克隆
1.材料與方法
1.1 培養(yǎng)基和試劑
1.2 菌株與質(zhì)粒
1.3 質(zhì)粒DNA的提取和酶切
1.4 質(zhì)粒DNA酶切產(chǎn)物的Southern雜交檢測(cè)
1.5 質(zhì)粒DNA酶切片段的回收
1.6 脫磷載體的制備
1.7 酶連
1.8 高效感受態(tài)細(xì)胞的制備和轉(zhuǎn)化
1.9 陽(yáng)性克隆的雜交法篩選
1.10 陽(yáng)性克隆測(cè)序和序列分析
2 結(jié)果與分析
2.1 質(zhì)粒DNA的酶切分析
2.2 質(zhì)粒DNA的酶切產(chǎn)物的Southern雜交
2.3 脫磷載體的制備和質(zhì)粒DNA的酶切產(chǎn)物回收
2.4 陽(yáng)性克隆的篩選和酶切驗(yàn)證
2.5 陽(yáng)性克隆的PCR驗(yàn)證
2.6 pBT24序列分析
2.7 pBT24序列與pADP-1、pAA1相關(guān)序列的比較
2.8 atzB基因序列的比較
2.9 pBT2和pBT24序列的酶切位點(diǎn)驗(yàn)證
3 討論
參考文獻(xiàn)
第五章 BTAH1在土壤中對(duì)阿特拉津的降解
第一節(jié) 菌株BTAH1在土壤中對(duì)阿特拉津的降解
1 材料與方法
1.1 培養(yǎng)基
1.2 供試菌株和植物
1.3 供試土壤
1.4 降解菌濃度和施用時(shí)間對(duì)土壤中阿特拉津降解的影響
1.5 降解菌的施用對(duì)敏感作物(小麥)生長(zhǎng)的影響
2 結(jié)果與分析
2.1 降解菌BTAH1的使用濃度和施用時(shí)間對(duì)土壤中阿特拉津降解的影響
2.2 降解菌的修復(fù)作用對(duì)小麥長(zhǎng)勢(shì)的影響
2.3 降解菌的修復(fù)作用對(duì)小麥鮮重的影響
3 討論
第二節(jié) BTAH1的使用對(duì)土壤微生物群落結(jié)構(gòu)的影響
1 材料與方法
1.1 供試土壤
1.2 供試菌株
1.3 除草劑阿特拉津和降解菌的施用
1.4 測(cè)定方法
1.5 土壤16S rDNA文庫(kù)的建立及ARDRA分析
1.6 土壤細(xì)菌遺傳多樣性的統(tǒng)計(jì)分析
2 結(jié)果與分析
2.1 土壤中阿特拉津的降解情況
2.2 阿特拉津和降解菌的使用對(duì)呼吸強(qiáng)度、土壤微生物C和微生物N的影響
2.3 除草劑和降解菌的使用對(duì)土壤中主要微生物類群的數(shù)量的影響
2.4 四種土壤總DNA的提取、純化和16S rDNA的擴(kuò)增
2.5 四種土壤16S rDNA文庫(kù)的RFLP分析
2.6 阿特拉津及降解菌的使用對(duì)土壤微生物多樣性的影響
2.7 四種土壤酶切類型的兩兩比較及主要酶切類型克隆數(shù)的比較
3 討論
參考文獻(xiàn)
全文總結(jié)
附錄一 文中所用試劑與培養(yǎng)基配方
附錄二 相關(guān)DNA序列
致射
攻讀學(xué)位期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文目錄
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]除草劑二氯喹啉酸對(duì)水稻田土壤中微生物種群的影響[J]. 呂鎮(zhèn)梅,閔航,葉央芳. 應(yīng)用生態(tài)學(xué)報(bào). 2004(04)
[2]苯噻草胺對(duì)水田土壤呼吸強(qiáng)度和酶活性的影響[J]. 葉央芳,閔航,周湘池. 土壤學(xué)報(bào). 2004(01)
[3]土壤微生物總DNA的提取和純化[J]. 張瑞福,曹慧,崔中利,李順鵬,樊奔. 微生物學(xué)報(bào). 2003(02)
[4]阿特拉津及其降解產(chǎn)物對(duì)張家口地區(qū)飲用水資源的影響[J]. 任晉,蔣可. 科學(xué)通報(bào). 2002(10)
[5]微生物分子生態(tài)學(xué)技術(shù)及其在環(huán)境污染研究中的應(yīng)用[J]. 鐘鳴,周啟星. 應(yīng)用生態(tài)學(xué)報(bào). 2002(02)
[6]官?gòu)d水庫(kù)水中阿特拉津殘留的分析及污染來(lái)源[J]. 任晉,蔣可,周懷東. 環(huán)境科學(xué). 2002(01)
[7]乙草胺對(duì)土壤微生物的影響研究[J]. 于建壘,宋國(guó)春,萬(wàn)魯長(zhǎng),曹德強(qiáng),于迎春. 環(huán)境污染治理技術(shù)與設(shè)備. 2000(05)
[8]阿特拉津在土壤中的生物降解研究[J]. 葉常明,王杏君,弓愛君,雷志芳. 環(huán)境化學(xué). 2000(04)
[9]阿特拉津在農(nóng)田灌溉水及土壤中的殘留分析方法及影響的研究[J]. 王立仁,趙明宇. 農(nóng)業(yè)環(huán)境保護(hù). 2000(02)
[10]美國(guó)現(xiàn)行飲用水標(biāo)準(zhǔn)[J]. 路凱,鄂學(xué)禮,陳亞妍. 國(guó)外醫(yī)學(xué)(衛(wèi)生學(xué)分冊(cè)). 2000(02)
本文編號(hào):3438682
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【文章頁(yè)數(shù)】:139 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
符號(hào)與縮略語(yǔ)
第一章 除草劑阿特垃津生物降解研究進(jìn)展
1 概述
1.1 理化性質(zhì)
1.2 毒性
1.3 應(yīng)用范圍
1.4 不同作物對(duì)阿特拉津的抗性
1.5 阿特拉津?qū)ψ魑锏乃幒胺治?br> 1.6 有關(guān)阿特拉津的一些標(biāo)準(zhǔn)
2 阿特拉津的微生物降解
2.1 簡(jiǎn)單的s-三嗪化合物的微生物代謝
2.2 阿特拉津的微生物代謝
參考文獻(xiàn)
第二章 研究中所涉及的主要研究方法概述
1 常見鑒定分類方法概述
1.1 概述
1.2 表型多樣性研究
1.3 遺傳多樣性研究
2 降解基因的克隆方法概述
2.1 根據(jù)已知序列克隆基因
2.2 新基因的克隆方法
參考文獻(xiàn)
第三章 阿特拉津降解菌的富集、分離及鑒定
第一節(jié) 阿特拉津降解菌的富集和分離
1 材料與方法
1.1 培養(yǎng)基和儀器
1.2 土壤樣品的富集
1.3 阿特拉津降解菌的分離
1.4 阿特拉津濃度的檢測(cè)
1.5 BTAH1碳源、氮源和微生物利用
1.6 蛋白胨、酵母粉和NaCl濃度對(duì)BTAH1生長(zhǎng)的影響
1.7 BTAH1在基礎(chǔ)鹽培養(yǎng)基和1/10LB培養(yǎng)基中生長(zhǎng)曲線的測(cè)定
1.8 BTAH1最適生長(zhǎng)條件的測(cè)定
1.9 BTAH1的生理塵化鑒定
1.10 BTAH1的16S rDNA序列的測(cè)定
2 結(jié)果與分析
2.1 阿特拉津降解菌的分離及其對(duì)阿特拉津的降解情況
2.2 菌株BTAH1對(duì)維生素、碳源和氮源的利用情況及蛋白胨濃度對(duì)BTAH1生長(zhǎng)的影響
2.3 BTAH1在基礎(chǔ)鹽培養(yǎng)基和1/10 LB培養(yǎng)基中的生長(zhǎng)曲線
2.4 溫度、通氣量和pH值對(duì)BTAH1生長(zhǎng)的影響
2.5 BTAH1的生理生化鑒定
2.6 BTAH1基因組DNA的提取和16S rDNA的擴(kuò)增
2.7 菌株BTAH1 16S rDNA序列的聚類分析
3 討論
第二節(jié) 阿特拉津降解菌株BTAH1的鑒定
1 材料與方法
1.1 培養(yǎng)基
1.2 菌株
1.3 模式菌株的活化
1.4 碳源發(fā)酵實(shí)驗(yàn)
1.5 16S rDNA同源性分析
1.6 菌體的培養(yǎng)、收集及DNA的大量提取
1.7 用于DNA-DNA液相雜交的DNA濃度、純度檢查
1.8 Tm值及G+C mol%測(cè)定
1.9 DNA-DNA雜交
2 結(jié)果與分析
2.1 BTAH1與四個(gè)模式菌株在形態(tài)學(xué)上的比較
2.2 BTAH1與四個(gè)模式菌株在碳源發(fā)酵產(chǎn)酸上的比較
2.3 五個(gè)菌株16S rDNA同源性的比較
2.4 菌株BTAH1的Tm值和G+C%含量及DNA-DNA液相雜交溫度的確定
2.5 DNA-DNA液相雜交復(fù)性速率及DNA-DNA同源性
3 討論
參考文獻(xiàn)
第四章 菌株BTAH1對(duì)阿特拉津的降解特性與降解基因的研究
第一節(jié) 菌株BTAH1對(duì)阿特拉津降解特性的研究
1 材料與方法
1.1 培養(yǎng)基和藥品
1.2 菌株BTAH1對(duì)阿特拉津的利用
1.3 培養(yǎng)基氮濃度及pH值測(cè)定
1.4 溫度和pH對(duì)菌株BTAH1降解阿特拉津的影響
1.5 菌株BTAH1對(duì)阿特拉津的脫氯作用
1.6 菌株BTAH1降解中間產(chǎn)物的檢測(cè)
1.7 菌株BTAH1降解譜的測(cè)定
2.結(jié)果與分析
2.1 菌株BTAH1對(duì)阿特拉津的利用
2.2 菌株BTAH1降解后培養(yǎng)基的氨濃度和pH值
2.3 溫度和pH值對(duì)阿特拉津降解的影響
2.4 BTAH1對(duì)阿特拉津的脫氯作用
2.5 降解過(guò)程中羥基阿特拉津的檢測(cè)
2.6 降解過(guò)程中氰尿酸的檢測(cè)
2.7 BTAH1的降解譜
3 討論
第二節(jié) 菌株BTAH1阿特拉津降解基因保守性的研究及降解基因的定位
1 材料與方法
1.1 培養(yǎng)基和試劑
1.2 菌株
1.3 基因組DNA的小量提取
1.4 阿特拉津降解基因保守片段的擴(kuò)增
1.5 質(zhì)粒DNA的小量提取
1.6 質(zhì)粒DNA的小量酶切
1.7 BTAH1的阿特拉津降解基因的Southern雜交定位
2.結(jié)果與分析
2.1 阿特拉津降解基因保守片段的擴(kuò)增
2.2 阿特拉津降解基因保守性的分析
2.3 菌株BTAH1中質(zhì)粒的檢測(cè)
2.4 菌株BTAH1中質(zhì)粒的純化和酶切比較
2.5 菌株BTAH1阿特拉津降解基因的定位
3 討論
第三節(jié) BTAH1質(zhì)粒上阿特拉津降解相關(guān)片段的克隆
1.材料與方法
1.1 培養(yǎng)基和試劑
1.2 菌株與質(zhì)粒
1.3 質(zhì)粒DNA的提取和酶切
1.4 質(zhì)粒DNA酶切產(chǎn)物的Southern雜交檢測(cè)
1.5 質(zhì)粒DNA酶切片段的回收
1.6 脫磷載體的制備
1.7 酶連
1.8 高效感受態(tài)細(xì)胞的制備和轉(zhuǎn)化
1.9 陽(yáng)性克隆的雜交法篩選
1.10 陽(yáng)性克隆測(cè)序和序列分析
2 結(jié)果與分析
2.1 質(zhì)粒DNA的酶切分析
2.2 質(zhì)粒DNA的酶切產(chǎn)物的Southern雜交
2.3 脫磷載體的制備和質(zhì)粒DNA的酶切產(chǎn)物回收
2.4 陽(yáng)性克隆的篩選和酶切驗(yàn)證
2.5 陽(yáng)性克隆的PCR驗(yàn)證
2.6 pBT24序列分析
2.7 pBT24序列與pADP-1、pAA1相關(guān)序列的比較
2.8 atzB基因序列的比較
2.9 pBT2和pBT24序列的酶切位點(diǎn)驗(yàn)證
3 討論
參考文獻(xiàn)
第五章 BTAH1在土壤中對(duì)阿特拉津的降解
第一節(jié) 菌株BTAH1在土壤中對(duì)阿特拉津的降解
1 材料與方法
1.1 培養(yǎng)基
1.2 供試菌株和植物
1.3 供試土壤
1.4 降解菌濃度和施用時(shí)間對(duì)土壤中阿特拉津降解的影響
1.5 降解菌的施用對(duì)敏感作物(小麥)生長(zhǎng)的影響
2 結(jié)果與分析
2.1 降解菌BTAH1的使用濃度和施用時(shí)間對(duì)土壤中阿特拉津降解的影響
2.2 降解菌的修復(fù)作用對(duì)小麥長(zhǎng)勢(shì)的影響
2.3 降解菌的修復(fù)作用對(duì)小麥鮮重的影響
3 討論
第二節(jié) BTAH1的使用對(duì)土壤微生物群落結(jié)構(gòu)的影響
1 材料與方法
1.1 供試土壤
1.2 供試菌株
1.3 除草劑阿特拉津和降解菌的施用
1.4 測(cè)定方法
1.5 土壤16S rDNA文庫(kù)的建立及ARDRA分析
1.6 土壤細(xì)菌遺傳多樣性的統(tǒng)計(jì)分析
2 結(jié)果與分析
2.1 土壤中阿特拉津的降解情況
2.2 阿特拉津和降解菌的使用對(duì)呼吸強(qiáng)度、土壤微生物C和微生物N的影響
2.3 除草劑和降解菌的使用對(duì)土壤中主要微生物類群的數(shù)量的影響
2.4 四種土壤總DNA的提取、純化和16S rDNA的擴(kuò)增
2.5 四種土壤16S rDNA文庫(kù)的RFLP分析
2.6 阿特拉津及降解菌的使用對(duì)土壤微生物多樣性的影響
2.7 四種土壤酶切類型的兩兩比較及主要酶切類型克隆數(shù)的比較
3 討論
參考文獻(xiàn)
全文總結(jié)
附錄一 文中所用試劑與培養(yǎng)基配方
附錄二 相關(guān)DNA序列
致射
攻讀學(xué)位期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文目錄
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]除草劑二氯喹啉酸對(duì)水稻田土壤中微生物種群的影響[J]. 呂鎮(zhèn)梅,閔航,葉央芳. 應(yīng)用生態(tài)學(xué)報(bào). 2004(04)
[2]苯噻草胺對(duì)水田土壤呼吸強(qiáng)度和酶活性的影響[J]. 葉央芳,閔航,周湘池. 土壤學(xué)報(bào). 2004(01)
[3]土壤微生物總DNA的提取和純化[J]. 張瑞福,曹慧,崔中利,李順鵬,樊奔. 微生物學(xué)報(bào). 2003(02)
[4]阿特拉津及其降解產(chǎn)物對(duì)張家口地區(qū)飲用水資源的影響[J]. 任晉,蔣可. 科學(xué)通報(bào). 2002(10)
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