多環(huán)芳烴（Polycyclic aromatic hydrocarbons,PAHs）是世界上最早認識的一類致畸、致癌和致突變化合物,具有難降解、半衰期長、易在土壤、沉積物、水體等環(huán)境介質(zhì)中累積且毒性較強,并可通過食物鏈的傳遞對生態(tài)環(huán)境和人體健康造成極大的危害。微生物降解是去除土壤PAHs污染的最主要途徑,細菌則是其中參與PAHs降解較為活躍的一類微生物。本研究分離獲得兩株菲（Phenanthrene,PHE）高效降解菌株Massiliasp.WG5和WX5,選擇以致癌PAHs的模式化合物PHE為目標污染物,研究Massiliaspp.對菲的降解途徑、分子機制及修復應(yīng)用,取得的主要研究結(jié)果如下:（1）16SrRNA基因PCR擴增測序結(jié)果發(fā)現(xiàn),WG5和WX5兩株菌的16SrRNA基因序列完全一致,鑒定為變形菌門（Proteobacteria）下的Massiliasp.。而且,兩株菌生理生化上僅在LB液體培養(yǎng)條件下存在明顯肉眼可見的區(qū)別,培養(yǎng)后期WG5菌株呈現(xiàn)渾濁而WX5菌株呈現(xiàn)絮狀沉淀。完成這兩株菌的全基因組測序后,分析發(fā)現(xiàn)兩個菌株的全基因組相似度高,序列相似度高達99.37%,而基因組... 

【文章來源】：浙江大學浙江省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

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摘要
ABSTRACT
縮寫、符號清單、術(shù)語表
1. 引言
    1.1. 土壤中的多環(huán)芳烴
        1.1.1. 土壤中PAHs污染的國內(nèi)外現(xiàn)狀
        1.1.2. 土壤PAHs污染來源
        1.1.3. PAHs污染對土壤微生物的影響
    1.2. PAHS污染土壤修復國內(nèi)外研究進展
        1.2.1. 物理修復技術(shù)
        1.2.2. 化學修復技術(shù)
        1.2.3. 生物修復技術(shù)
        1.2.4. 不同修復技術(shù)比較
    1.3. PAHS微生物降解途徑及其機制
        1.3.1. PAHs微生物降解途徑
        1.3.2. PAHs細菌降解機制
    1.4. 論文研究目標、內(nèi)容和技術(shù)路線
        1.4.1. 研究目標
        1.4.2. 研究內(nèi)容
        1.4.3. 技術(shù)路線
2. Mussilia sp.WG5和WX5菌株的分離及其生理生化分子特性
    2.1. 材料與方法
        2.1.1. 實驗材料
        2.1.2. 實驗方法
    2.2. 結(jié)果與討論
        2.2.1. Massilia sp. WF1菌株基因組
        2.2.2. Massilia sp. WG5和WX5的分離、純化和鑒定
        2.2.3. Massilia sp. WG5菌株基因組
        2.2.4. Massilia sp. WG5菌株基因組甲基化
        2.2.5. Massilia sp. WX5菌株基因組
        2.2.6. Massilia sp. WX5菌株基因組甲基化
        2.2.7. Massilia spp.比較基因組
    2.3. 小結(jié)
3. Massilia sp. WG5和WX5菌株菲降解特性及其降解機制
    3.1. 材料與方法
        3.1.1. 實驗材料
        3.1.2. 實驗方法
    3.2. 結(jié)果與討論
        3.2.1. 菲降解速率測定
        3.2.2. 菲降解產(chǎn)物分離測定
        3.2.3. 菲降解產(chǎn)物直接測定
        3.2.4. 菲降解基因和降解途徑推斷
    3.3. 小結(jié)
4. Massilia sp.WG5菌株轉(zhuǎn)錄組分析和PHE降解途徑驗證
    4.1. 材料與方法
        4.1.1. 實驗材料
        4.1.2. 實驗方法
    4.2. 結(jié)果與討論
        4.2.1. 測序數(shù)據(jù)優(yōu)化結(jié)果及質(zhì)量評估
        4.2.2. 基因表達定量分析
        4.2.3. 差異表達基因分析
        4.2.4. WG5菌株P(guān)HE降解通路表達差異分析
    4.3. 小結(jié)
5. Massilia sp.WG5菌株在PHE污染土壤中的修復應(yīng)用
    5.1. 材料與方法
        5.1.1. 實驗材料
        5.1.2. 實驗方法
    5.2. 結(jié)果與討論
        5.2.1. 土壤中PHE的殘留
        5.2.2. iHAAQ方法建立
        5.2.3. PHE污染土壤中的細菌群落結(jié)構(gòu)動態(tài)
    5.3. 小結(jié)
6. 研究結(jié)論、創(chuàng)新點、不足之處及展望
    6.1. 研究結(jié)論
        6.1.1. Massilia sp. WG5和WX5菌株的分離及其生理生化分子特性
        6.1.2. Massilia sp. WG5和WX5菌株菲降解特性及其降解機制
        6.1.3. Massilia sp. WG5菌株轉(zhuǎn)錄組分析和PHE降解途徑驗證
        6.1.4. Massilia sp. WG5菌株在PHE污染土壤中的修復應(yīng)用
    6.2. 創(chuàng)新點
    6.3. 不足與展望
參考文獻
附表
作者簡介


【參考文獻】：
期刊論文
[1]利用比較轉(zhuǎn)錄組分析克雷白氏肺炎桿菌（Klebsiella pneumoniae Tzyx1）降解多環(huán)芳烴特性[J]. 于紅艷,張昕欣,陳紅云,吳翰桂.  環(huán)境科學學報. 2018(02)
[2]植物修復多環(huán)芳烴污染土壤研究進展[J]. 張娟,劉燕.  環(huán)境科學與技術(shù). 2016(06)
[3]多環(huán)芳烴降解菌的篩選及其在焦化場地污染土壤修復中的應(yīng)用[J]. 李鳳梅,郭書海,張燦燦,張玲妍,楊雪蓮.  環(huán)境污染與防治. 2016(04)
[4]多環(huán)芳烴的微生物降解機制研究進展[J]. 王濤,藍慧,田云,盧向陽.  化學與生物工程. 2016(02)
[5]土壤中多環(huán)芳烴菲的自然降解特性[J]. 田華,劉哲,趙璐,李煥妮.  環(huán)境工程學報. 2015(08)
[6]微生物修復土壤多環(huán)芳烴污染的研究進展[J]. 侯梅芳,潘棟宇,黃賽花,劉超男,趙海青,唐小燕.  生態(tài)環(huán)境學報. 2014(07)
[7]高通量測序技術(shù)在土壤微生物多樣性研究中的研究進展[J]. 樓駿,柳勇,李延.  中國農(nóng)學通報. 2014(15)
[8]鐵氧化物催化類Fenton反應(yīng)[J]. 馮勇,吳德禮,馬魯銘.  化學進展. 2013(07)
[9]中國化石能源消費碳排放與經(jīng)濟增長關(guān)系研究[J]. 武紅,谷樹忠,關(guān)興良,魯莎莎.  自然資源學報. 2013(03)
[10]植物DNA甲基化研究進展[J]. 李娜,張旸,解莉楠,李玉花.  植物生理學報. 2012(11)

博士論文
[1]Massilia sp.WF1和Phanerochaete chrysosporium對菲降解、吸附機理的研究[D]. 顧海萍.浙江大學 2016

碩士論文
[1]Mycobacterium sp. WY10的特性及其對菲和芘的降解研究[D]. 陳遠志.浙江大學 2017
[2]Massilia sp.WF1對菲的降解特性研究[D]. 羅小艷.浙江大學 2015



本文編號：3164786