基于Pseudomonas sp. T13強化的好氧反硝化系統(tǒng)構建及脫氮效能研究
【學位授予單位】:哈爾濱工業(yè)大學
【學位級別】:博士
【學位授予年份】:2017
【分類號】:X703
【圖文】:
napA 16S圖2-3 PCR凝膠電泳圖Figure 2-3 PCR gel electrophoresis實時熒光定量PCR儀(ABI 7500 FAST,美表2-18 PCR反應混合液Table 2-18 Mixture of PCR reaction試劑(濃度) 用量μLDNA模板 0.5dNTP (10 mmol/L) 0.5Taq Buffer (10×) 2.5MgCl2(25 mmol/L) 2Taq Polymerase 0.2PCR-grade pure H2O 18.3Primer F (10 μmol/L) 0.5Primer R (10 μmol/L) 0.5
第 2 章 實驗材料與方法DOTUR和Phylip等軟件計算矩陣距離并由此進行聚類分析,根據(jù)97%相似性劃分分類操作單元 (operational taxonomic units,OTU),獲得rarefaction 曲線,計算評估豐度評價指數(shù)(Chao1)和多樣性指數(shù)(Shannon)[129];再利用RDP na veBayesian rRNA classifier和Greengenes classify在線分類,結(jié)合BLAST比對確定所測的序列分類地位。所獲得高通量測序原始數(shù)據(jù)上傳并公開于NCBI網(wǎng)絡公開數(shù)據(jù)庫(Short Read Archive (SRA) database),獲取數(shù)據(jù)查閱登錄號PRJNA310145。2.2.6.4 菌群網(wǎng)絡構建及分析(Cytoscape network)基于Illumina 高通量測序獲得的OTUs數(shù)據(jù),采用Cytoscape 3.2.1進行網(wǎng)絡構建[121]。相關操作如圖2-5所示。
0201 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22菌株編號00.2去圖 3-3 分離獲得 22株脫氮菌對總氮和硝氮去除能力比較Figure 3-3 Comparision of TN and NO3- N removal by 22 strains3.2.3 好氧反硝化菌多相分類鑒定3.2.3.1 好氧反硝化菌的形態(tài)特征通過平板劃線法選取單菌落,得到形態(tài)特征相同、均勻分布的細菌單克隆培養(yǎng)物,并進行革蘭氏染色,如圖 3-4。根據(jù)《伯杰氏細菌手冊》首先觀察微生物群體形態(tài)。在固體培養(yǎng)基中培養(yǎng) 24 h 后,觀察發(fā)現(xiàn)菌株 T13的單菌落為圓形、不透明的淡黃色,直徑大小在 1.5-3.5 mm 之間,菌落邊緣不太規(guī)則,表面為凸起的褶皺,菌間具有一定粘性,具體菌落形態(tài)結(jié)果見表 3-1。對菌株進行革蘭氏染色顯示為紅色,則該菌為革蘭氏陰性菌。
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本文編號:2791240
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