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黃頂菊種子萌發(fā)過程中DNA甲基化的MSAP分析

發(fā)布時間:2018-04-30 03:15

  本文選題:黃頂菊 + 種子萌發(fā)。 參考:《植物保護學報》2017年05期


【摘要】:為明確入侵植物黃頂菊Flaveria bidentis生長發(fā)育與DNA甲基化之間的相互關系,采用甲基化敏感擴增多態(tài)性(methylation sensitive amplification polymorphism,MSAP)方法研究了黃頂菊種子萌發(fā)過程中DNA甲基化的動態(tài)變化。結果表明,DNA甲基化與去甲基化兩者共同調控黃頂菊生命初期的生長發(fā)育,且去甲基化的變化在種子萌發(fā)過程中占主導。篩選出的12對引物共擴增出998條MSAP條帶,其中多態(tài)性條帶為951條,多態(tài)性百分比為95.37%。黃頂菊種子萌發(fā)過程中胞嘧啶發(fā)生甲基化主要以雙鏈甲基化形式為主,位點數為94個,而單鏈甲基化位點數僅為50個;多態(tài)性位點數占總位點數比率為48.95%,表明有近一半的位點發(fā)生了DNA甲基化和去甲基化的變化;發(fā)生去甲基化變化的多態(tài)性片段有73個,而發(fā)生甲基化變化的有21個,說明黃頂菊種子萌發(fā)階段DNA甲基化的變化主要以去甲基化形式為主,且在萌發(fā)第4天后去甲基化數目持續(xù)快速上升。
[Abstract]:In order to clarify the relationship between Flaveria bidentis growth and DNA methylation in invasive plant, the dynamic changes of DNA methylation during seed germination were studied by methylation sensitive amplified polymorphic sensitive amplification polymorphism (MSAP) method. The results showed that both DNA methylation and demethylation regulated the growth and development of Chrysanthemum chinensis in the early stage of life, and the change of demethylation played a dominant role in the process of seed germination. A total of 998 MSAP bands were amplified from 12 pairs of primers, including 951 polymorphic bands, and the percentage of polymorphic bands was 95.3737. During seed germination, cytosine methylation mainly occurred in the form of double strand methylation, with 94 site points and 50 single strand methylation sites. The percentage of polymorphic sites to total sites was 48.95, indicating that nearly half of the sites had DNA methylation and demethylation, and 73 polymorphic fragments had demethylation changes, while 21 had methylation changes. The results showed that the change of DNA methylation was mainly in the form of demethylation during germination, and the number of demethylation increased rapidly after 4 days of germination.
【作者單位】: 農業(yè)部環(huán)境保護科研監(jiān)測所;山西農業(yè)大學;天津農學院;
【基金】:國家自然科學基金(31401811) 天津市應用基礎與前沿技術研究計劃(15JCQNJC15300)
【分類號】:Q16

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本文編號:1822823

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