青藏高原青甘韭的多次多倍化及譜系地理學(xué)研究
發(fā)布時(shí)間:2020-12-25 00:00
青藏高原植物青甘韭這一二倍體-四倍體復(fù)合體被我們選用為模式植物來探討其四倍體的單次或多次起源及其對第四紀(jì)冰期動(dòng)蕩氣候的回應(yīng)。我們對該物種分布區(qū)域內(nèi)48個(gè)居群的306個(gè)個(gè)體(所有個(gè)體的倍性均已知)的五套葉綠體片段(包括accD-psaI, trnH-psbA, trnL-trnF, trnS-trnG四套基因間隔區(qū)和rpl16內(nèi)含子區(qū)域)進(jìn)行測序。測序所得的多態(tài)性位點(diǎn)共確定了32種單倍型,其中11種單倍型為二倍體所特有,13種單倍型為四倍體所特有,而另外8種單倍型則為二倍體和四倍體這兩種核型所共享的單倍型。如上所述,這32種單倍型在不同核型中的分布結(jié)合NETWORK分析結(jié)果共同表明:青甘韭四倍體至少經(jīng)歷了八次獨(dú)立的起源事件。葉綠體單倍型的分布格局在高原東部和西部之間存在著明顯的差異:高原東部的大部分居群包含有多種單倍型,而高原西部地區(qū)的17個(gè)四倍體居群卻只包含有一種單倍型,從而表明高原西部居群經(jīng)歷了一次近期的擴(kuò)張事件。除此之外,我們發(fā)現(xiàn)該多倍體復(fù)合體還經(jīng)歷了一次較早時(shí)期的種群擴(kuò)張事件,大約發(fā)生在5-150千年前,位于高原最大次冰期(800-170千年前)之后。另外,高原上四倍體居群的高頻...
【文章來源】:蘭州大學(xué)甘肅省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:64 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
腸、、,
較低支持率的情況相似(如 Avise2000)。系統(tǒng)樹將這犯種單倍型分為A和B兩支。相對于B支,A支是一個(gè)較大的分支,它占有32種單倍型中的27種單倍型,余下的5種單倍型構(gòu)成了基部分支B(圖3一3A)。然而,A支內(nèi)單倍型間的系統(tǒng)發(fā)生關(guān)系中,除了其中5個(gè)包含有2一4種單倍型的亞支得到了中等強(qiáng)度的支持外,其余各單倍型間的系統(tǒng)關(guān)系都沒有得到很好的解決。Network以及TCS支系圖分析結(jié)果與系統(tǒng)發(fā)育分析結(jié)果相一致,并使得32種單倍型間的系統(tǒng)關(guān)系得到了較好的解決(圖3一3B)。而進(jìn)一步的星狀收縮分析最終確定了4個(gè)聚類分支(I,11,111,IV;圖3一3B)
圖34青甘韭cpDNA單倍型分布圖,細(xì)線圓圈代表二倍體居群,粗線圓圈代表四倍體居群。A,主要以及特有單倍型的分布圖,彩色圓圈表示在一個(gè)以上居群中出現(xiàn)的單倍型,白色圓圈則表示只在一個(gè)居群中出現(xiàn)的單倍型(我們將之定義為特有單倍型,其中內(nèi)部加小黑點(diǎn)者表示B支特有單倍型);B,四個(gè)單倍型聚類分支的分布圖(依據(jù)圖3一3B)Fig.34T七eg以犯不甲hicdis州bu石onofcPDNAh即】0勿pesobservedinA.戶談卿動(dòng)枷”um.Thinlines田舊undc流lesindiG時(shí)ediPloidpoPu】西佃‘班司加記lines代presenttetraPtoids.A,
本文編號:2936553
【文章來源】:蘭州大學(xué)甘肅省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:64 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
腸、、,
較低支持率的情況相似(如 Avise2000)。系統(tǒng)樹將這犯種單倍型分為A和B兩支。相對于B支,A支是一個(gè)較大的分支,它占有32種單倍型中的27種單倍型,余下的5種單倍型構(gòu)成了基部分支B(圖3一3A)。然而,A支內(nèi)單倍型間的系統(tǒng)發(fā)生關(guān)系中,除了其中5個(gè)包含有2一4種單倍型的亞支得到了中等強(qiáng)度的支持外,其余各單倍型間的系統(tǒng)關(guān)系都沒有得到很好的解決。Network以及TCS支系圖分析結(jié)果與系統(tǒng)發(fā)育分析結(jié)果相一致,并使得32種單倍型間的系統(tǒng)關(guān)系得到了較好的解決(圖3一3B)。而進(jìn)一步的星狀收縮分析最終確定了4個(gè)聚類分支(I,11,111,IV;圖3一3B)
圖34青甘韭cpDNA單倍型分布圖,細(xì)線圓圈代表二倍體居群,粗線圓圈代表四倍體居群。A,主要以及特有單倍型的分布圖,彩色圓圈表示在一個(gè)以上居群中出現(xiàn)的單倍型,白色圓圈則表示只在一個(gè)居群中出現(xiàn)的單倍型(我們將之定義為特有單倍型,其中內(nèi)部加小黑點(diǎn)者表示B支特有單倍型);B,四個(gè)單倍型聚類分支的分布圖(依據(jù)圖3一3B)Fig.34T七eg以犯不甲hicdis州bu石onofcPDNAh即】0勿pesobservedinA.戶談卿動(dòng)枷”um.Thinlines田舊undc流lesindiG時(shí)ediPloidpoPu】西佃‘班司加記lines代presenttetraPtoids.A,
本文編號:2936553
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