基于枯草芽孢桿菌產(chǎn)物應用的基因組精簡研究進展
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【部分圖文】:
圖1γ-PGA結(jié)構(gòu)圖
γ-PGA是由谷氨酸單體通過α-氨基與γ-羧基形成γ-酰胺鍵而聚合成的陰離子型多肽,結(jié)構(gòu)如圖1。γ-PGA具有可食性、吸水性、保水性、可生物降解和環(huán)境友好等特性,廣泛應用于醫(yī)藥、食品、環(huán)境等領(lǐng)域。γ-PGA常用微生物發(fā)酵法生產(chǎn)。相對于固態(tài)發(fā)酵(solidstatefermen....
圖2NK蛋白結(jié)構(gòu)圖[29]
NK由aprN基因編碼,全長為1473bp,是由編碼77個氨基酸的前導肽、29個氨基酸的信號肽和275個氨基酸的成熟肽組成的單鏈多肽蛋白酶,屬于枯草桿菌蛋白酶家族[27]。NK的pdb號為4DWW[28],結(jié)構(gòu)如圖2[29],含有2個Ca2+結(jié)合位點(位點A和位點B,均位于....
圖3VK2分子結(jié)構(gòu)式
基因組簡化可從自下而上和自上而下兩種方法得以實現(xiàn)[44]。前一種方法從必需基因合成最小細胞,后一種方法通過刪除非必需基因組區(qū)域來簡化現(xiàn)有基因組。與自下而上相比,自上而下的策略實現(xiàn)基因組刪減的可操作性更強;蚪M精簡目前常用的技術(shù)主要基于同源重組、位點特異性重組、雙鏈斷裂修復重組、....
圖4同源重組基因組精簡原理圖[45]
傳統(tǒng)的基因組編輯方法依賴于抗生素抗性標記,去除這些標記耗時費力。基于RNA引導的DNA核酸內(nèi)切酶聚集的規(guī)則間隔短回文重復序列(CRISPR)是從細菌適應性免疫系統(tǒng)發(fā)展而成的一種非常強大的基因組編輯技術(shù),原理如圖6[59]。根據(jù)供體DNA、Cas9和gRNA在CRISPR/Cas9....
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