核糖開關(guān)位于RNA(ribonucleic acid)的非編碼區(qū),參與調(diào)控很多重要的生物過(guò)程。本文利用已發(fā)展的RNA轉(zhuǎn)錄折疊預(yù)測(cè)方法,研究了位于Thermotoga petrophila中的氟離子核糖開關(guān)。計(jì)算結(jié)果表明,該核糖開關(guān)在轉(zhuǎn)錄過(guò)程中先折疊成一個(gè)包含假結(jié)并可以特異性結(jié)合配體的適體域結(jié)構(gòu)。當(dāng)氟離子濃度較低時(shí),隨著RNA序列的延長(zhǎng),轉(zhuǎn)錄終止子開始成核、延長(zhǎng),最終完全形成,引起轉(zhuǎn)錄提前終止;當(dāng)氟離子濃度較高時(shí),配體和適體域結(jié)構(gòu)結(jié)合形成一個(gè)穩(wěn)定的復(fù)合體結(jié)構(gòu),阻止了轉(zhuǎn)錄終止子的形成,從而使得下游基因可以正常表達(dá)。該核糖開關(guān)受轉(zhuǎn)錄速度和配體濃度的聯(lián)合控制,體現(xiàn)出動(dòng)力學(xué)調(diào)控特性。

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【文章目錄】：
0 引言
1 研究方法
    1.1 計(jì)算躍遷速率
    1.2 復(fù)性折疊動(dòng)力學(xué)
    1.3 轉(zhuǎn)錄折疊動(dòng)力學(xué)研究
    1.4 配體結(jié)合動(dòng)力學(xué)研究
2 結(jié)果
    2.1 氟離子核糖開關(guān)的調(diào)控行為
    2.2 轉(zhuǎn)錄過(guò)程對(duì)氟離子核糖開關(guān)的影響
    2.3 氟離子核糖開關(guān)的調(diào)控特性
3 結(jié)論



本文編號(hào)：3822969