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CiWRKY17基因克隆與生物信息學(xué)分析

發(fā)布時間:2022-11-06 15:54
  本研究主要目的是克隆中間錦雞兒WRKY17轉(zhuǎn)錄因子并對其編碼蛋白的理化性質(zhì)及結(jié)構(gòu)特征進(jìn)行生物學(xué)特性分析。首先對CiWRKY17進(jìn)行基因克隆,其次將PCR擴增后得到的全長連接到克隆載體上,最后利用生物信息學(xué)工具分析CiWRKY17等蛋白的生物學(xué)特性。結(jié)果顯示,CiWRKY17基因全長957 bp,編碼318個氨基酸殘基,此蛋白屬于WRKY超家族中IId亞家族(組)的成員,是位于細(xì)胞核中的穩(wěn)定親水性蛋白,其二級結(jié)構(gòu)主要由無規(guī)則卷曲、α-螺旋和β-折疊構(gòu)成,其中無規(guī)則卷曲為二級結(jié)構(gòu)中最主要的結(jié)構(gòu)元件,并且二級結(jié)構(gòu)與三級結(jié)構(gòu)預(yù)測結(jié)果高度一致。最后得出結(jié)論,這8種不同植物中的WRKY17轉(zhuǎn)錄因子具有高度相似的結(jié)構(gòu)和特征,因此應(yīng)均具有與鹽脅迫相關(guān)的抗性。 

【文章頁數(shù)】:9 頁

【文章目錄】:
1 結(jié)果與分析
    1.1 Ci WRKY17基因的克隆
    1.2 Ci WRKY17的同源性分析及系統(tǒng)發(fā)育樹構(gòu)建
    1.3 Ci WRKY17的蛋白結(jié)構(gòu)分析
        1.3.1 WRKY17蛋白一級結(jié)構(gòu)與理化性分析
        1.3.2 WRKY17疏水性分析
        1.3.3 WRKY17蛋白亞細(xì)胞定位分析
        1.3.4 WRKY17蛋白二級和三級結(jié)構(gòu)預(yù)測分析
2 討論
3 材料與方法
    3.1 實驗材料
    3.2 序列來源
    3.3 中間錦雞兒葉片組織總RNA提取及反轉(zhuǎn)錄
    3.4 引物的設(shè)計
    3.5 PCR的擴增
    3.6 目的基因的轉(zhuǎn)化連接
    3.7 菌落PCR鑒定
    3.8 生物信息學(xué)分析
作者貢獻(xiàn)


【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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[9]WRKY轉(zhuǎn)錄因子功能研究進(jìn)展[J]. 張娟.  西北植物學(xué)報. 2009(10)
[10]中國錦雞兒屬植物資源研究——分布及分種描述[J]. 牛西午.  西北植物學(xué)報. 1999(05)



本文編號:3703782

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