CiWRKY17基因克隆與生物信息學(xué)分析
發(fā)布時間:2022-11-06 15:54
本研究主要目的是克隆中間錦雞兒WRKY17轉(zhuǎn)錄因子并對其編碼蛋白的理化性質(zhì)及結(jié)構(gòu)特征進行生物學(xué)特性分析。首先對CiWRKY17進行基因克隆,其次將PCR擴增后得到的全長連接到克隆載體上,最后利用生物信息學(xué)工具分析CiWRKY17等蛋白的生物學(xué)特性。結(jié)果顯示,CiWRKY17基因全長957 bp,編碼318個氨基酸殘基,此蛋白屬于WRKY超家族中IId亞家族(組)的成員,是位于細胞核中的穩(wěn)定親水性蛋白,其二級結(jié)構(gòu)主要由無規(guī)則卷曲、α-螺旋和β-折疊構(gòu)成,其中無規(guī)則卷曲為二級結(jié)構(gòu)中最主要的結(jié)構(gòu)元件,并且二級結(jié)構(gòu)與三級結(jié)構(gòu)預(yù)測結(jié)果高度一致。最后得出結(jié)論,這8種不同植物中的WRKY17轉(zhuǎn)錄因子具有高度相似的結(jié)構(gòu)和特征,因此應(yīng)均具有與鹽脅迫相關(guān)的抗性。
【文章頁數(shù)】:9 頁
【文章目錄】:
1 結(jié)果與分析
1.1 Ci WRKY17基因的克隆
1.2 Ci WRKY17的同源性分析及系統(tǒng)發(fā)育樹構(gòu)建
1.3 Ci WRKY17的蛋白結(jié)構(gòu)分析
1.3.1 WRKY17蛋白一級結(jié)構(gòu)與理化性分析
1.3.2 WRKY17疏水性分析
1.3.3 WRKY17蛋白亞細胞定位分析
1.3.4 WRKY17蛋白二級和三級結(jié)構(gòu)預(yù)測分析
2 討論
3 材料與方法
3.1 實驗材料
3.2 序列來源
3.3 中間錦雞兒葉片組織總RNA提取及反轉(zhuǎn)錄
3.4 引物的設(shè)計
3.5 PCR的擴增
3.6 目的基因的轉(zhuǎn)化連接
3.7 菌落PCR鑒定
3.8 生物信息學(xué)分析
作者貢獻
【參考文獻】:
期刊論文
[1]響應(yīng)鎘脅迫的水稻W(wǎng)RKY15轉(zhuǎn)錄因子基因的分離與表達特征[J]. 彭喜旭,白寧寧,王海華. 中國水稻科學(xué). 2018(02)
[2]WRKY轉(zhuǎn)錄因子的研究進展[J]. 張凡,尹俊龍,郭瑛琪,岳艷玲. 生物技術(shù)通報. 2018(01)
[3]小麥種子萌發(fā)對鹽脅迫的生物學(xué)響應(yīng)[J]. 王玉玲,歐行奇,朱啟迪,李新華,喬紅,楊曉菲. 河南科技學(xué)院學(xué)報(自然科學(xué)版). 2017(04)
[4]鄂爾多斯中間錦雞兒研究利用綜述[J]. 白春利,趙和平,賈明,丁海君. 畜牧與飼料科學(xué). 2016(08)
[5]不同品系小麥的耐鹽性研究[J]. 馬林,任崴,陳小梅,周叢梅. 新疆農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2014(02)
[6]蛋白質(zhì)的二級結(jié)構(gòu)預(yù)測研究進展[J]. 唐媛,李春花,張瑗,尚進,鄒凌云,李立奇. 現(xiàn)代生物醫(yī)學(xué)進展. 2013(26)
[7]小麥種質(zhì)芽期和苗期的耐鹽性鑒定評價[J]. 張巧鳳,陳宗金,吳紀中,蔣彥婕,楊繼書,蔡士賓. 植物遺傳資源學(xué)報. 2013(04)
[8]小麥的耐鹽性及其改良研究進展[J]. 裴自友,溫輝芹,任永康,王晉,莊麗芳. 作物研究. 2012(01)
[9]WRKY轉(zhuǎn)錄因子功能研究進展[J]. 張娟. 西北植物學(xué)報. 2009(10)
[10]中國錦雞兒屬植物資源研究——分布及分種描述[J]. 牛西午. 西北植物學(xué)報. 1999(05)
本文編號:3703782
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【文章目錄】:
1 結(jié)果與分析
1.1 Ci WRKY17基因的克隆
1.2 Ci WRKY17的同源性分析及系統(tǒng)發(fā)育樹構(gòu)建
1.3 Ci WRKY17的蛋白結(jié)構(gòu)分析
1.3.1 WRKY17蛋白一級結(jié)構(gòu)與理化性分析
1.3.2 WRKY17疏水性分析
1.3.3 WRKY17蛋白亞細胞定位分析
1.3.4 WRKY17蛋白二級和三級結(jié)構(gòu)預(yù)測分析
2 討論
3 材料與方法
3.1 實驗材料
3.2 序列來源
3.3 中間錦雞兒葉片組織總RNA提取及反轉(zhuǎn)錄
3.4 引物的設(shè)計
3.5 PCR的擴增
3.6 目的基因的轉(zhuǎn)化連接
3.7 菌落PCR鑒定
3.8 生物信息學(xué)分析
作者貢獻
【參考文獻】:
期刊論文
[1]響應(yīng)鎘脅迫的水稻W(wǎng)RKY15轉(zhuǎn)錄因子基因的分離與表達特征[J]. 彭喜旭,白寧寧,王海華. 中國水稻科學(xué). 2018(02)
[2]WRKY轉(zhuǎn)錄因子的研究進展[J]. 張凡,尹俊龍,郭瑛琪,岳艷玲. 生物技術(shù)通報. 2018(01)
[3]小麥種子萌發(fā)對鹽脅迫的生物學(xué)響應(yīng)[J]. 王玉玲,歐行奇,朱啟迪,李新華,喬紅,楊曉菲. 河南科技學(xué)院學(xué)報(自然科學(xué)版). 2017(04)
[4]鄂爾多斯中間錦雞兒研究利用綜述[J]. 白春利,趙和平,賈明,丁海君. 畜牧與飼料科學(xué). 2016(08)
[5]不同品系小麥的耐鹽性研究[J]. 馬林,任崴,陳小梅,周叢梅. 新疆農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2014(02)
[6]蛋白質(zhì)的二級結(jié)構(gòu)預(yù)測研究進展[J]. 唐媛,李春花,張瑗,尚進,鄒凌云,李立奇. 現(xiàn)代生物醫(yī)學(xué)進展. 2013(26)
[7]小麥種質(zhì)芽期和苗期的耐鹽性鑒定評價[J]. 張巧鳳,陳宗金,吳紀中,蔣彥婕,楊繼書,蔡士賓. 植物遺傳資源學(xué)報. 2013(04)
[8]小麥的耐鹽性及其改良研究進展[J]. 裴自友,溫輝芹,任永康,王晉,莊麗芳. 作物研究. 2012(01)
[9]WRKY轉(zhuǎn)錄因子功能研究進展[J]. 張娟. 西北植物學(xué)報. 2009(10)
[10]中國錦雞兒屬植物資源研究——分布及分種描述[J]. 牛西午. 西北植物學(xué)報. 1999(05)
本文編號:3703782
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