目前,世界衛(wèi)生組織已將環(huán)境雌激素列為第1類致癌物,由其造成的污染已經(jīng)成為全球性的第三大環(huán)境問題,嚴重威脅人類健康和生態(tài)安全。治理雌激素污染迫在眉睫,也日益成為社會關(guān)注的熱點問題。利用微生物降解代謝過程進行雌激素生物降解,是去除環(huán)境中雌激素最環(huán)保、最經(jīng)濟的有效方法,在雌激素污染治理中發(fā)揮至關(guān)重要的作用,日益受到人們的重視。本文從某生產(chǎn)雌激素藥廠附近土壤樣品中篩選分離得到一株能夠高效降解類固醇雌激素的菌株,命名為DH-S01。形態(tài)學觀察顯示,菌落呈圓形,邊緣整齊,有光澤,呈橙紅色或紫紅色,菌體易挑起,呈桿狀,無鞭毛。生理生化實驗確定為革蘭氏染色陰性細菌,能夠代謝葡萄糖、麥芽糖、蔗糖等。結(jié)合分子生物學鑒定,確定菌株DH-S01為沙雷氏菌（Serratia）。降解實驗結(jié)果表明,菌株DH-S01能夠利用類固醇雌激素雌酮和17β-雌二醇為唯一碳源進行生長傳代培養(yǎng),實驗周期內(nèi)的雌酮和17β-雌二醇的生物降解率都在90%以上。為了深入了解該菌株的基因組結(jié)構(gòu)與功能信息和其雌激素降解機制,基于PacBio測序平臺,對菌株進行全基因組測序及分析。菌株DH-S01基因組由一個大小為5256558bp的環(huán)狀染色... 

【文章頁數(shù)】：75 頁

【學位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
Abstract
第一章 引言
    1.1 沙雷氏菌
    1.2 類固醇雌激素
    1.3 微生物基因組學
    1.4 研究內(nèi)容與意義
    1.5 技術(shù)路線
第二章 降解菌的分離及降解特性研究
    2.1 材料與方法
        2.1.1 實驗儀器和藥品
        2.1.2 樣品采集和培養(yǎng)基配制
        2.1.3 菌株的分離
        2.1.4 菌株生長曲線的繪制
        2.1.5 檢測方法與標準曲線的建立
        2.1.6 菌株的形態(tài)學分析
        2.1.7 菌株的生理生化分析
        2.1.8 菌株的分子生物學分析
        2.1.9 菌株生長降解條件的優(yōu)化
        2.1.10 類固醇雌激素降解實驗
    2.2 結(jié)果與討論
        2.2.1 菌株的鑒定與保藏
        2.2.2 DH-S01生長與類固醇雌激素降解
    2.3 本章小結(jié)
第三章 DH-S01全基因組測序及分析
    3.1 材料與方法
        3.1.1 實驗材料、試劑和儀器
        3.1.2 DNA提取與檢測
        3.1.3 全基因組測序和組裝
        3.1.4 全基因組基因注釋
        3.1.5 平均核苷酸相似性分析
    3.2 結(jié)果和討論
        3.2.1 提取DNA及檢測
        3.2.2 測序質(zhì)控與組裝
        3.2.3 基因組組分分析
        3.2.4 DH-S01平均核苷酸相似性分析
        3.2.5 基因功能注釋
    3.3 本章小結(jié)
第四章 DH-S01類固醇雌激素降解相關(guān)基因研究
    4.1 材料與方法
        4.1.1 應(yīng)用數(shù)據(jù)庫
        4.1.2 實驗材料、試劑和儀器
        4.1.3 聚合酶鏈式反應(yīng)
        4.1.4 反轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈式反應(yīng)
    4.2 結(jié)果與討論
        4.2.1 類固醇雌激素降解相關(guān)基因注釋
        4.2.2 類固醇雌激素降解相關(guān)基因PCR分析
        4.2.3 類固醇雌激素降解相關(guān)基因RT-PCR分析
    4.3 本章小結(jié)
第五章 DH-S01比較基因組學分析
    5.1 材料與方法
        5.1.1 實驗材料
        5.1.2 共線性分析
        5.1.3 共有基因和特有基因分析
    5.2 結(jié)果與討論
        5.2.1 基因組共線性分析
        5.2.2 基因組Venn圖分析
    5.3 本章小結(jié)
結(jié)論
參考文獻
致謝
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本文編號：3690861