螢火蟲生物發(fā)光中加氧反應(yīng)機理的理論研究
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【部分圖文】:
圖2采用的計算模型及關(guān)鍵原子標號
圖1熒光素酶催化氧化反應(yīng)階段的兩個半反應(yīng)圖3UM06-2X/6-31G**計算的從3[L·2-…O2·-]/1[L·2-…O2·-]到FDO-的反應(yīng)位能曲線及穩(wěn)定點的結(jié)構(gòu).其中紅色、黃色、黑色、藍色和白色小球分別代表O、S、C、N和H原子.(ΔG單位為kcal·mol-1)
圖1熒光素酶催化氧化反應(yīng)階段的兩個半反應(yīng)
首先以1[L·2-…O2·-]作為初始反應(yīng)物.在1[L·2-…O2·-]?FDO-的反應(yīng)過程中,從RC到產(chǎn)物(P)共優(yōu)化得到兩個中間體(Int1和Int2)和三個過渡態(tài)(TS1、TS2和TS3),見圖3.頻率分析顯示TS1(-266.6cm-1)、TS2(-194.2cm-....
圖3UM06-2X/6-31G**計算的從3[L·2-…O2·-]/1[L·2-…O2·-]到FDO-的反應(yīng)位能曲線及穩(wěn)定點的結(jié)構(gòu).其中紅色、黃色、黑色、藍色和白色小球分別代表O、S、C、N和H原子.(ΔG單位為kcal·mol-1)
圖2采用的計算模型及關(guān)鍵原子標號圖4UM06-2X/6-31G**計算的O2·-和L·2-沿IRC的關(guān)鍵幾何結(jié)構(gòu)參數(shù)和電荷變化
圖4UM06-2X/6-31G**計算的O2·-和L·2-沿IRC的關(guān)鍵幾何結(jié)構(gòu)參數(shù)和電荷變化
圖3UM06-2X/6-31G**計算的從3[L·2-…O2·-]/1[L·2-…O2·-]到FDO-的反應(yīng)位能曲線及穩(wěn)定點的結(jié)構(gòu).其中紅色、黃色、黑色、藍色和白色小球分別代表O、S、C、N和H原子.(ΔG單位為kcal·mol-1)3結(jié)論
本文編號:3998575
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