利用糞便DNA技術(shù)對(duì)候鳥進(jìn)行物種鑒定,對(duì)了解鳥類在繁殖地和越冬地的種類分布、研究其遷徙路線等具有重要意義。本研究擴(kuò)增、測(cè)定了76份雁形目鳥類糞便的Dloop區(qū)序列,將其與NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)中已知鳥類同源序列進(jìn)行比對(duì)分析（BLAST比對(duì)法）。結(jié)果表明:相似度為98. 07%—100%,其中75%的單倍型可以被認(rèn)定為單一物種,25%的單倍型檢測(cè)為非單一物種,即包含2個(gè)近緣物種。比較基于Ts、Ts+Tv堿基替換計(jì)算的K2P遺傳距離,說(shuō)明后者更適合于D-loop區(qū)序列特征。而且,以此為基礎(chǔ)的遺傳距離法、ABGD劃分法和系統(tǒng)發(fā)育樹法可以得出一致的物種鑒定結(jié)果,消除了BLAST比對(duì)法時(shí)出現(xiàn)的非單一物種。由此構(gòu)建了一套方法齊全、標(biāo)準(zhǔn)明確的鳥類糞便物種鑒定體系。該體系使得鳥類物種鑒定流程更具系統(tǒng)性、規(guī)范性,得出可信的鑒定結(jié)論,可以推廣應(yīng)用于其他檢材的物種鑒定領(lǐng)域。 

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【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 材料
    1.2 基因組DNA提取、PCR擴(kuò)增與測(cè)序
    1.3 數(shù)據(jù)處理
2 結(jié)果
    2.1 序列比對(duì)
    2.2 遺傳距離、系統(tǒng)發(fā)育分析與ABGD的劃分
3 討論


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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碩士論文
[1]基于糞便分子生物學(xué)的馬鹿個(gè)體識(shí)別、親緣關(guān)系分析及家域確定[D]. 張輝.東北林業(yè)大學(xué) 2010



本文編號(hào)：3689900