發(fā)布時間：2022-07-07 11:11

　　鹽堿菌是一類能在高鹽強堿生境下進行生長、發(fā)育、繁殖的極端微生物,其最適生長鹽度須要高于0.5 mol·L^–1,同時最適生長pH須大于9.0。數(shù)十年間,鹽堿菌獨特的生命方式引起了廣泛的關(guān)注,人類對鹽堿菌的研究有了巨大的進展:從解析其適應(yīng)鹽堿的生命機制,到應(yīng)用其提供的高潛力新型酶類及化合物進行工業(yè)生產(chǎn),再到理解鹽堿菌群在生境中扮演的角色及生態(tài)功能。而隨著基因組測序技術(shù)與設(shè)備的更新與進步,低廉、快速、高效、準確地獲得鹽堿菌的基因序列及鹽堿菌群宏基因組構(gòu)成加速了我們對其生命機制、生產(chǎn)應(yīng)用、生態(tài)功能的全面認識。本課題組保藏菌株,即中度嗜鹽嗜堿好氧菌Alkalicoccus saliphilus DSM 15402^T,我們報道了該菌株基因組草圖的基本信息,其草圖約有3.52 Mb,在3434個預(yù)測基因中鑒定出一些致力于保障胞內(nèi)滲透平衡的基因,提供了DSM 15402^T這株中度嗜鹽嗜堿菌對高鹽環(huán)境的分子層面的獨特適應(yīng)嗜極機理。另一株菌分離自中國新疆維吾爾自治區(qū)鹽湖底泥中的嗜鹽細菌,即Alkalicoccus halolimnae BZ... 

【文章頁數(shù)】：80 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
Abstract
主要符號對照表
第一章 緒論
    1.1 極端微生物概述
    1.2 本課題的研究背景
        1.2.1 鹽堿細菌對極端環(huán)境的響應(yīng)機制
        1.2.2 鹽堿群落多樣性的意義
        1.2.3 產(chǎn)iGDGTs的鹽堿古菌對環(huán)境變化的響應(yīng)
    1.3 本課題的研究手段—二代測序技術(shù)
    1.4 本課題的研究目的及意義
    1.5 本課題的研究框架—對適應(yīng)性的解析
    1.6 創(chuàng)新點
第二章 二代測序技術(shù)注釋鹽堿細菌的嗜極基因
    2.1 鹽堿菌A.saliphilus DSM 15402T的嗜極基因
        2.1.1 實驗材料
        2.1.2 實驗方法
        2.1.3 實驗結(jié)果與分析
    2.2 嗜鹽菌A. halolimnae BZ-SZ-XJ29T的嗜極基因
        2.2.1 實驗材料
        2.2.2 實驗方法
        2.2.3 實驗結(jié)果與分析
    2.3 本章小結(jié)
第三章 松嫩平原鹽堿土細菌群落特征及驅(qū)動因子
    3.1 實驗材料
        3.1.1 實驗樣品
        3.1.2 主要藥品和試劑
        3.1.3 主要儀器、軟件和數(shù)據(jù)庫
    3.2 實驗方法
        3.2.1 樣品采集和環(huán)境參數(shù)測量
        3.2.2 氣象數(shù)據(jù)的獲取
        3.2.3 土壤總DNA提取及 16srDNA的擴增
        3.2.4 Illumina Miseq 16SrDNA基因測序
        3.2.5 數(shù)據(jù)統(tǒng)計與分析
    3.3 實驗結(jié)果與分析
        3.3.1 樣點地理信息
        3.3.2 土壤理化指標
        3.3.3 測序深度分析(群落多樣性上限)
        3.3.4 樣本多樣性指數(shù)分析
        3.3.5 群落結(jié)構(gòu)分析
        3.3.6 科水平RDA圖
        3.3.7 物種(科)水平熱圖
        3.3.8 科水平PCA圖
    3.4 討論
    3.5 本章小結(jié)
第四章 鹽堿土中類異戊二烯四醚膜脂的分布特征及其古菌源探究
    4.1 實驗材料
        4.1.1 實驗樣品
        4.1.2 主要藥品和試劑
        4.1.3 主要儀器、軟件和數(shù)據(jù)庫
    4.2 實驗方法
        4.2.1 樣品采集和環(huán)境參數(shù)測量
        4.2.2 脂質(zhì)提取和分離
        4.2.3 CL?iGDGTs的分析和定量
        4.2.4 土壤總DNA提取及 16srRNA基因擴增
        4.2.5 Illumina Miseq測序及分析
    4.3 實驗結(jié)果與分析
        4.3.1 土壤理化指標
        4.3.2 iGDGTs特征
        4.3.3 iGDGTs與環(huán)境因子
        4.3.4 群落結(jié)構(gòu)
        4.3.5 推測iGDGTs的微生物源
    4.4 討論
    4.5 本章小結(jié)
第五章 全文結(jié)論
參考文獻
附錄
致謝
作者簡歷


【參考文獻】：
期刊論文
[1]應(yīng)用IlluminaMiSeq高通量測序技術(shù)分析河西走廊地區(qū)鹽堿土壤微生物多樣性[J]. 牛世全,龍洋,李海云,達文燕,胡山,李渭娟,朱學(xué)泰,孔維寶.  微生物學(xué)通報. 2017(09)
[2]可培養(yǎng)鹽堿菌多樣性的研究進展[J]. 趙百鎖,李俊.  微生物學(xué)報. 2017(09)
[3]內(nèi)蒙古河套灌區(qū)不同鹽堿程度的土壤細菌群落多樣性[J]. 李新,焦燕,代鋼,楊銘德,溫慧洋.  中國環(huán)境科學(xué). 2016(01)
[4]黑龍江與青海凍土甘油二烷基甘油四醚脂類化合物的組成特征[J]. 吳霞,董海良,蔣宏忱,張傳倫.  中國科技論文. 2013(12)
[5]新疆阿克蘇地區(qū)鹽堿地細菌類群多樣性及優(yōu)勢菌群分析[J]. 鄭賀云,黎志坤,李超,張鮮姣,胡建偉,朱紅惠.  微生物學(xué)通報. 2012(07)
[6]中國土壤pH對微生物四醚膜脂分布特征及陸源輸入指數(shù)BIT的影響[J]. 楊歡,丁偉華,王金祥,金承勝,何鋼強,秦養(yǎng)民,謝樹成.  中國科學(xué):地球科學(xué). 2012(05)
[7]鹽堿土改良技術(shù)回顧與展望[J]. 李志杰,孫文彥,馬衛(wèi)萍,尹紅娟,李懷軍,曲善功,曹衛(wèi)東.  山東農(nóng)業(yè)科學(xué). 2010(02)
[8]松嫩平原鹽堿土理化性質(zhì)與生態(tài)恢復(fù)[J]. 張巍,馮玉杰.  土壤學(xué)報. 2009(01)
[9]中國鹽漬土研究的發(fā)展歷程與展望[J]. 楊勁松.  土壤學(xué)報. 2008(05)
[10]土壤微生物總DNA的提取和純化[J]. 張瑞福,曹慧,崔中利,李順鵬,樊奔.  微生物學(xué)報. 2003(02)

碩士論文
[1]黃河三角洲土壤細菌多樣性分析及嗜鹽細菌的分離鑒定[D]. 賈芳芳.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2012



本文編號：3656316