甲羥戊酸-5-磷酸激酶（5-phosphomevalonate kinase,PMK）是甲羥戊酸（mevalonate,MVA）途徑中的關(guān)鍵限速酶,其在ATP和二價金屬離子的存在下能夠可逆地催化甲羥戊酸-5-磷酸（mevalerate 5-phosphoric acid,MVAP）磷酸化從而形成甲羥戊酸-5-焦磷酸（mevalonate-5-pyrophosphate,MVAPP）。該文以香樟Cinnamomum camphora作為研究材料,基于前期的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),從cDNA中克隆出PMK基因,命名為CcPMK（GenBank登錄號MN163057）。該基因開放閱讀框（ORF）為1 545 bp,編碼514個氨基酸,生物信息學(xué)分析推測其相對分子質(zhì)量為56.14 kDa,等電點(diǎn)（theoretical pI）為7.64,不含信號肽,不存在跨膜結(jié)構(gòu)。通過多序列比對及系統(tǒng)進(jìn)化樹分析,發(fā)現(xiàn)CcPMK與其他植物的PMK氨基酸序列相似性高達(dá)75%,其包含45%的α-螺旋和16%的β折疊,CcPMK具有3個PMK蛋白質(zhì)家族的特征motif和1個ATP結(jié)合位點(diǎn)Gly-Leu-Gly-Ser-Ser-A... 

【文章來源】：中國中藥雜志. 2020,45(01)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：7 頁

【文章目錄】：
1 材料
    1.1 植物
    1.2 儀器
    1.3 試劑
2 方法
    2.1 總RNA的提取
    2.2 cDNA的合成
    2.3 cDNA全長的獲得
    2.4 克隆載體的構(gòu)建、轉(zhuǎn)化及鑒定
    2.5 生物信息學(xué)分析
    2.6 qRT-PCR檢測
3 結(jié)果
    3.1 總RNA的提取及檢測
    3.2 CcPMK基因cDNA全長的克隆
    3.3 CcPMK蛋白的生物信息學(xué)分析
        3.3.1 理化性質(zhì)分析
        3.3.2 序列比對及結(jié)構(gòu)域分析
        3.3.3 系統(tǒng)進(jìn)化樹的構(gòu)建
    3.4 CcPMK基因的特異性表達(dá)分析
4 討論


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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碩士論文
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本文編號：3644626