甲羥戊酸-5-磷酸激酶（5-phosphomevalonate kinase,PMK）是甲羥戊酸（mevalonate,MVA）途徑中的關鍵限速酶,其在ATP和二價金屬離子的存在下能夠可逆地催化甲羥戊酸-5-磷酸（mevalerate 5-phosphoric acid,MVAP）磷酸化從而形成甲羥戊酸-5-焦磷酸（mevalonate-5-pyrophosphate,MVAPP）。該文以香樟Cinnamomum camphora作為研究材料,基于前期的轉錄組數(shù)據(jù),從cDNA中克隆出PMK基因,命名為CcPMK（GenBank登錄號MN163057）。該基因開放閱讀框（ORF）為1 545 bp,編碼514個氨基酸,生物信息學分析推測其相對分子質量為56.14 kDa,等電點（theoretical pI）為7.64,不含信號肽,不存在跨膜結構。通過多序列比對及系統(tǒng)進化樹分析,發(fā)現(xiàn)CcPMK與其他植物的PMK氨基酸序列相似性高達75%,其包含45%的α-螺旋和16%的β折疊,CcPMK具有3個PMK蛋白質家族的特征motif和1個ATP結合位點Gly-Leu-Gly-Ser-Ser-A... 

【文章來源】：中國中藥雜志. 2020,45(01)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：7 頁

【文章目錄】：
1 材料
    1.1 植物
    1.2 儀器
    1.3 試劑
2 方法
    2.1 總RNA的提取
    2.2 cDNA的合成
    2.3 cDNA全長的獲得
    2.4 克隆載體的構建、轉化及鑒定
    2.5 生物信息學分析
    2.6 qRT-PCR檢測
3 結果
    3.1 總RNA的提取及檢測
    3.2 CcPMK基因cDNA全長的克隆
    3.3 CcPMK蛋白的生物信息學分析
        3.3.1 理化性質分析
        3.3.2 序列比對及結構域分析
        3.3.3 系統(tǒng)進化樹的構建
    3.4 CcPMK基因的特異性表達分析
4 討論


【參考文獻】：
期刊論文
[1]茉莉花磷酸甲羥戊酸激酶基因克隆及表達分析[J]. 陳笛,王鵬杰,鄭玉成,鄭知臨,陳桂信,葉乃興.  南方農(nóng)業(yè)學報. 2018(10)
[2]香樟GGPPS基因的克隆及生物信息學分析[J]. 曹先爽,王進,張瑤瑤,王煜煒,馬曉江,宋麗,湯鋒,岳永德.  基因組學與應用生物學. 2018(08)
[3]香樟FPPS基因的克隆及生物信息學分析[J]. 張瑤瑤,宋麗,劉偉,曹先爽,王煜煒,王進.  分子植物育種. 2018(19)
[4]梅州香樟揮發(fā)油抗炎活性試驗[J]. 葉小玲,趙瑩,張聲源,張偉楠,饒頌華,聶華.  廣東化工. 2018(08)
[5]香樟MK基因的克隆與生物信息學分析[J]. 曹先爽,王進,張瑤瑤,王煜煒,馬曉江,宋麗,湯鋒,岳永德.  熱帶作物學報. 2017(12)
[6]植物萜類合成代謝途徑及限速酶的研究進展[J]. 陳瑤,謝琴鼎,唐亞琴,唐開宇,黃乾明.  分子植物育種. 2018(07)
[7]APGⅣ系統(tǒng)在植物學教學中的應用初探[J]. 劉文哲,趙鵬.  高等理科教育. 2017(04)
[8]4種樟屬植物精油抗氧化活性的比較研究[J]. 羅世惠,黃婷,史宗畔,陳代俐,陳斌,何正波.  重慶師范大學學報(自然科學版). 2018(01)
[9]金釵石斛焦磷酸甲羥戊酸脫羧酶基因的克隆及表達分析[J]. 李清,李標,郭順星.  基因組學與應用生物學. 2018(02)
[10]香樟1-脫氧-D-木酮糖-5-磷酸還原異構酶基因CcDXR1的克隆和表達分析[J]. 鄭漢,荊禮,姚娜,楊青山,彭華勝,申業(yè),黃璐琦.  藥學學報. 2016(09)

碩士論文
[1]茯苓磷酸甲羥戊酸激酶基因克隆及功能分析[D]. 何海.華中農(nóng)業(yè)大學 2016



本文編號：3644626