釀酒酵母輔酶A生物合成蛋白Cab2(磷酸泛酰半胱氨酸合成酶)結(jié)構(gòu)生物學(xué)研究
發(fā)布時間:2022-02-11 18:53
輔酶A是一種廣泛存在于生命有機體中的輔因子,對生命有機體的新陳代謝具有重要的作用。輔酶A的生物合成是以泛酸、ATP和L-半胱氨酸為底物通過5步酶促反應(yīng)形成。這5步酶促反應(yīng)依次是在泛酸激酶、磷酸泛酰半胱氨酸合成酶、磷酸泛酰半胱氨酸脫羧酶、磷酸泛酰巰基乙胺腺苷轉(zhuǎn)移酶和脫磷酸輔酶A激酶的催化作用下完成的。磷酸泛酰半胱氨酸合成酶(PPCS)催化輔酶A合成途徑的第二步反應(yīng),即催化在核苷三磷酸存在的條件下以磷酸泛酸(PPA)與L-半胱氨酸為底物生成磷酸泛酰半胱氨酸(PPC)的合成反應(yīng)。在釀酒酵母中,Cab2蛋白具有PPCS的酶活性。為了探究釀酒酵母Cab2蛋白的催化機制,本文開展了相關(guān)研究。本文解析了Cab2及其與底物PPA、中間體4’-磷酸泛酰-CMP(PMT)和產(chǎn)物PPC的復(fù)合物結(jié)構(gòu)。這些晶體結(jié)構(gòu)為了解Cab2與配體分子的結(jié)合及其催化機制提供了一些重要的結(jié)構(gòu)信息。首先,在Cab2與不同配體的復(fù)合物結(jié)構(gòu)中,高度保守的Asn97殘基的側(cè)鏈γ-氨基通過水分子介導(dǎo)的氫鍵分別與PPA的羧基,PMT的CMP部分的磷酸基團和PPC的PPA部分的羰基結(jié)合。其次,Cab2通過其Lys281和相鄰分子的Lys22...
【文章來源】:中國科學(xué)技術(shù)大學(xué)安徽省211工程院校985工程院校
【文章頁數(shù)】:174 頁
【學(xué)位級別】:博士
【部分圖文】:
圖1.1輔酶A結(jié)構(gòu)式
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酶為代表的典型的細菌源泛酸激酶。此類泛酸激酶的一個重要特點就是其酶活在??體內(nèi)體外都會被輔酶A抑制(Vallari,Jackowski,?and?Rock?1987)。結(jié)構(gòu)解析研宄表??明(圖1.3),此類酶屬于P-l〇〇P激酶,這是第一類泛酸激酶的主要結(jié)構(gòu)特點(Cheek??et?al.?2005;?Cheek,?Zhang,?and?Grishin?2002)〇??第二類泛酸激酶主要存在于真核生物中,比如擬南芥、果蠅、小鼠及人等??(Kupke,?Hemandez-Acosta,?and?Culianez-Macia?2003;?Afshar?et?al.?2001;?Zhang,?Rock,??and?Jackowski?2005;?Leonardi,?Zhang,?et?al.?2007;?Ramaswamy?et?al.?2004)。此類泛??酸激酶基因在許多物種中的表達具有明顯的組織特異性。以人為例,有4種人源??泛酸激酶,PANK丨主要在肝和腎中表達,而PANK2則在大部分組織中均有表??達,PANK3主要在肝臟中表達,在心臟及骨骼肌中也有少量表達,PANK4主要??在骨豁肌中表達(Rock?et?al.?2000;?Hortnagel?2003;?Johnson?et?al.?2004)。此類泛酸??激酶的一個特性就是其酶活會受到乙酰輔酶A的抑制(Leonardi
本文編號:3620783
【文章來源】:中國科學(xué)技術(shù)大學(xué)安徽省211工程院校985工程院校
【文章頁數(shù)】:174 頁
【學(xué)位級別】:博士
【部分圖文】:
圖1.1輔酶A結(jié)構(gòu)式
??圖1.1輔酶A結(jié)構(gòu)式。??注:圖中輔酶A的結(jié)構(gòu)式使用ChemDraw軟件繪制。??表1.1輔鴯A的衍生物及其生物功能??"ZITT?Z7T? ̄ ̄Z?相關(guān)的生物??輔酶A?衍生物?r基團??乙酰輔酶A?'?多種生命代??//?謝過程??〇??乙酰乙酰輔酶?y?膽固醇的生??r?A?物合成??〈?T??\?0?0??(?香豆酰輔酶A?黃酮類與芪??>?/?(?丁?類化合物的??〇==<?生物合成??\?苯甲酰輔酶A?芳香化合物??〇?/H?/?JLJ?的脫芳構(gòu)化??X?苯乙酰輔酶A?^?芳香化合物??J?的脫芳構(gòu)化??H〇7P^°?°??ho^\p==?丙二酰輔酶A?/?/?脂肪酸與聚??。廣°?P?酮類化合物??H\r0?\?’?的合成??/?v/?°h??/?\。?琥珀酰輔酶A?。?亞鐵血紅素??的生獅??/■'■〇?°??\?羥甲基戊二酰?/?丨?類異戊二烯??N?V?輔酶A?的生物合成??〇??庚二酰輔酶A?,?生物素的生??物合成??注:表中輔酶A及其衍生物的結(jié)構(gòu)式使用ChemDraw軟件繪制。??2??
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本文編號:3620783
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