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梭梭熱激因子家族基因HaHsfA5的鑒定及其在高溫脅迫記憶中的表達(dá)

發(fā)布時(shí)間:2022-01-03 21:50
  植物能夠?qū)?jīng)歷過(guò)的高溫脅迫產(chǎn)生"脅迫記憶",從而更好地適應(yīng)反復(fù)發(fā)生的高溫脅迫。鑒定梭梭熱激因子基因HaHsfA5序列和結(jié)構(gòu)特征,分析其在梭梭幼苗高溫脅迫記憶中的表達(dá)規(guī)律,對(duì)梭梭高溫脅迫適應(yīng)性研究有重要理論價(jià)值。本研究?jī)?nèi)容包括:以反轉(zhuǎn)錄PCR克隆HaHsfA5讀碼框全長(zhǎng)序列;以在線生物信息學(xué)工具預(yù)測(cè)HaHsfA5的蛋白理化參數(shù)、蛋白結(jié)構(gòu)域和基元;進(jìn)行HaHsfA5的序列比對(duì)和進(jìn)化樹(shù)分析;以qRT-PCR分析HaHsfA5在高溫脅迫記憶中的表達(dá)。生物信息分析顯示HaHsfA5為分子量較小、不穩(wěn)定、親水的HSFs家族A亞族蛋白,與甜菜、菠菜、藜麥的Hsf A5有較近親緣關(guān)系。qRT-PCR分析顯示經(jīng)過(guò)高溫脅迫鍛煉的梭梭幼苗在高溫脅迫處理下HaHsfA5表達(dá)顯著上調(diào),而正常條件下生長(zhǎng)的梭梭幼苗在高溫脅迫處理下其表達(dá)并未顯著上調(diào)。綜合Ha HsfA5的結(jié)構(gòu)特征和表達(dá)規(guī)律,提示HaHsfA5功能可能與梭梭幼苗的高溫脅迫記憶有關(guān)。本研究為進(jìn)一步分析Ha Hsf A5在梭梭幼苗高溫脅迫記憶中的功能提供研究基礎(chǔ),對(duì)梭梭耐高溫品系選育和耐逆機(jī)制研究可能具有推動(dòng)作用。 

【文章來(lái)源】:分子植物育種. 2020,18(03)北大核心CSCD

【文章頁(yè)數(shù)】:8 頁(yè)

【部分圖文】:

梭梭熱激因子家族基因HaHsfA5的鑒定及其在高溫脅迫記憶中的表達(dá)


Ha Hsf A5基因編碼區(qū)全長(zhǎng)的克隆

序列,蛋白,序列,甜菜


利用NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)的Blastp進(jìn)行比對(duì),結(jié)果顯示HaHsfA5蛋白與藜麥(Chenopodium quinoa)、甜菜(Beta vulgaris)、菠菜(Spinacia oleracea)、橡膠樹(shù)(Hevea brasiliensis)、木薯(Manihot esculenta)、胡楊(Populus euphratica)、大豆(Glycine max)、鷹嘴豆(Cicer arietinum)、葡萄(Vitis vinifera)等植物的Hsf A5蛋白有較高序列相似度。為探究HaHsfA5和其它植物HSFs之間的進(jìn)化關(guān)系,選取上述植物的Hsf A5蛋白全長(zhǎng)序列,并加上擬南芥HSF家族的21個(gè)HSFs蛋白的全長(zhǎng)序列,以及水稻(Oryza sativa Japonica)、玉米(Zea mays)、松樹(shù)(Picea sitchensis)、苔蘚(Physcomitrella patens)等植物中的Hsf A5蛋白的全長(zhǎng)序列與HaHsfA5一起構(gòu)建進(jìn)化樹(shù)。HaHsfA5與甜菜Hsf A5(BvHsfA5)、菠菜Hsf A5(SoHsfA5)、藜麥Hsf A5(CqHsfA5)在進(jìn)化樹(shù)中的距離最近,與橡膠樹(shù)Hsf A5(HbHsfA5)、木薯Hsf A5(MeHsfA5)、胡楊Hsf A5(PeHsfA5)、大豆Hsf A5(GmHsf A5)、鷹嘴豆Hsf A5(CaHsfA5)、葡萄Hsf A5(VvH-sf A5)、水稻Hsf A5(OsHsfA5)、玉米Hsf A5(ZmHsf A5)、松樹(shù)Hsf A5(PsHsfA5)、苔蘚Hsf A5(PpHsfA5)的距離較遠(yuǎn);與HaHsfA5距離最近的擬南芥HSFs是AtHsfA5。這些結(jié)果表明,Ha Hsf A5與藜麥、菠菜、甜菜的Hsf A5有較近親緣關(guān)系,與HaHsfA5親緣關(guān)系最近的擬南芥HSFs是AtHsfA5,HaHsfA5與水稻、玉米、苔蘚、松樹(shù)的Hsf A5親緣關(guān)系比較遠(yuǎn)(圖3)。

相關(guān)蛋白,進(jìn)化樹(shù),梭梭,幼苗


qRT-PCR結(jié)果顯示,對(duì)照組梭梭幼苗在L2"和R2"處理后HaHsfA5表達(dá)上調(diào)不顯著(圖4B)。梭梭在L1和R1處理的過(guò)程中,HaHsfA5表達(dá)也沒(méi)有明顯上調(diào),但在經(jīng)過(guò)L1和R1處理后,HaHsfA5在L2處理下表達(dá)顯著上調(diào),相對(duì)表達(dá)水平達(dá)到CK的2倍,之后的R2處理下HaHsfA5表達(dá)水平與CK相當(dāng)(圖4B)。這些結(jié)果表明,L1處理可看作一次高溫脅迫鍛煉,經(jīng)過(guò)高溫脅迫鍛煉,HaHsfA5在高溫脅迫(L2處理)下的表達(dá)水平顯著升高,而未經(jīng)高溫鍛煉的梭梭幼苗在高溫脅迫(L2"處理)和常溫復(fù)原(R2"處理)下HaHsfA5表達(dá)并未顯著上調(diào),提示HaHsfA5功能可能與梭梭高溫脅迫記憶有關(guān)。2 討論

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]梭梭14-3-3蛋白基因HaFT-5、HaFT-6克隆及表達(dá)分析[J]. 王嬌,王波,姜夢(mèng)輝,李亞婕,王澤,任燕萍,張樺.  基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2018(05)
[2]無(wú)灌溉管件防護(hù)梭梭荒漠造林新技術(shù)及其示范推廣[J]. 麻浩,張樺,馬林,任財(cái),王澤,高新,方輝,何小玲.  中國(guó)科學(xué):生命科學(xué). 2014(03)



本文編號(hào):3567041

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