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擬南芥鈣依賴蛋白激酶(CPKs)的結(jié)構(gòu)與活力調(diào)控機(jī)制研究

發(fā)布時間:2022-01-02 15:44
  在真核生物中,蛋白激酶參與調(diào)節(jié)細(xì)胞功能的許多關(guān)鍵方面,包括細(xì)胞分裂、細(xì)胞代謝和對外界信號的反應(yīng)等。鈣依賴蛋白激酶CPKs/CDPKs(Ca2+-dependent protein kinases)是一類依賴Ca2+的蛋白激酶,是植物和某些原生動物Ca2+信號轉(zhuǎn)導(dǎo)過程中主要的傳遞者,能識別發(fā)育和環(huán)境刺激引發(fā)的Ca2+信號,將其轉(zhuǎn)化為蛋白質(zhì)磷酸化事件。在植物中,CPKs/CDPKs是一個多基因家族,其調(diào)控機(jī)制非常復(fù)雜。近年來,對植物CPKs/CDPKs在免疫和應(yīng)激信號網(wǎng)絡(luò)中觸發(fā)多樣的下游反應(yīng)的功能有很多研究,但其活力調(diào)控機(jī)制仍不清楚。本論文對擬南芥鈣依賴蛋白激酶(AtCPKs)和原生動物弓形蟲CDPK1(TgCDPK1)的活力調(diào)控機(jī)制進(jìn)行了初步研究。CPKs/CDPKs大多由N端可變區(qū)域、絲/蘇氨酸激酶結(jié)構(gòu)域KD(Kinase Domain)、連接區(qū)域J(Junction)以及C端的類鈣調(diào)蛋白結(jié)構(gòu)域CLD(Calmodulin-like Domain)構(gòu)成。不同亞組的AtCPKs基因由擬南芥cDNA文庫克隆獲得,TgCDPK1基因經(jīng)密碼子優(yōu)化后合成。在此基礎(chǔ)上,我們克隆了多個AtCPKs及... 

【文章來源】:蘇州大學(xué)江蘇省 211工程院校

【文章頁數(shù)】:74 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【部分圖文】:

擬南芥鈣依賴蛋白激酶(CPKs)的結(jié)構(gòu)與活力調(diào)控機(jī)制研究


圖1.1經(jīng)典蛋白激酶結(jié)構(gòu)??圖A為PKA的晶體結(jié)構(gòu)⑴:圖B為磷酸化和非磷酸化的IRK的晶體結(jié)構(gòu)[2],??活化環(huán)為紅,aC螺旋為色,Gl-richloo為桔紅色,化環(huán)綠,??

細(xì)胞分布,家族,植物,蛋白


?Sensor?relays??廣、、??CDPK?t?\?"?CaM??(i?rm?▼?(i?i?i?n??Ca2+?cml??'?CBL?1?^??CIPK?,?LI?1?I?I?J?(?1?i?I?i)??(‘iUi?J?n?i?11?i?i?i??PhosphoryiatoN---^??Target?proteins?M一*??潑?Kinase?domain?■?EF-hand?■?Autoinhibitory?domain?■?NAF?domain??圖1.2植物里Ca2‘感應(yīng)蛋白分類W??1.3?CDPKs?家族??1J.1?CDPKs的分類與定位??CDPKs足?個多基因家族,要存弁:于各種植物和原生動物里,在動物和??真菌中沒有發(fā)現(xiàn)。目前水稻里鑒定出31種,玉米里鑒定出35種,小麥里鑒定出??至少20種,擬南芥基因組里鑒定出34種%擬南芥CDPKs簡稱為AtCPKs。擬??南芥電所冇CPKs和原生動物里TgCDPK丨根據(jù)其全長鉍袖酸丨十:列同源性劃分的??進(jìn)化樹表明,擬南芥里AtCPKs劃分為四個亞組,從結(jié)果上看,相比其他三個亞??組,GroupIV更靠近原生動物這一分支(圖1.3)。??CDPKs在植物中分布廣泛,在根、葉、花等不同組織中均有表達(dá)。CDPKs??具有獨(dú)特的亞細(xì)胞分布,包括細(xì)胞質(zhì)、細(xì)胞核、質(zhì)膜、葉綠體、線粒體等。這使??它們能夠感知局部Ca2+濃度,并與它們的靶標(biāo)特異性地相互作川定位CDPKs??在植物中的廣泛分布表明其具有激活不同底物的巨大潛力,并保多種倍號轉(zhuǎn)導(dǎo)途??徑中發(fā)揮重要作用。大多數(shù)CDPKs的N端被預(yù)測冇肉豆蔻;稽c(diǎn),對?其、Ik:??細(xì)胞定位至關(guān)

示意圖,結(jié)構(gòu)域,示意圖,信號通路


擬南芥鈣依賴蛋白激酶(CPKs)的結(jié)構(gòu)與活力調(diào)控機(jī)制研宄?第一章引H??為50%-98%)。此外只有N端可變區(qū)域是最不保守的,序列長短不一,且序列??相似性很低17]。??Inhibitory?region?CaM-LD(CLD)??y?I?\?I?\??variable?domain?Kinase?domain?—?Junction?-?ef?EF???EF?Ef??N-EF?lobe?C-EF?lobe??圖1.4CDPKS的結(jié)構(gòu)域示意圖??1.4?CDPKs蛋白在信號通路中的功能??植物在生長發(fā)育過程中,應(yīng)對各種環(huán)境刺激,Ca2+是植物免疫和應(yīng)激反應(yīng)中??保守的第:信使和主要的調(diào)節(jié)因子。CDPKs作為植物里一類重要的Ca2+感應(yīng)蛋??白,是許多信號通路的關(guān)鍵調(diào)控因子,CDPKs具有不同的表達(dá)模式、亞細(xì)胞定??位、CV+敏感性和底物特異性,因此在復(fù)雜的免疫和應(yīng)激信號網(wǎng)絡(luò)中起著多種M??要作州,其中包括對酶、通道蛋白和轉(zhuǎn)珙因子的激活與抑制等?谇皩M南芥??CPKsfr:信號通路方面的研宂冇很多,卍氣孔運(yùn)動、激素倍號傳導(dǎo)和袪因調(diào)控等??多方面有了新的進(jìn)展(圖1.5)。??Drogght?A^A?Salt??pm?、?.?<??CPK3/6?CPK4/H/12?/■)'?、?\?CPK21??£痛.f?胸,-0?\?=忒??CPK8*?/?\.?T?\?CPK23????/,?\?CPK^?■??/?CPK4^?5?^??-£PK1〇?/1〇m?4?;?CPK21/23??_?一一一一_-.'??(?Vacuoi*?V????、二一^??Ca:*?CPK


本文編號:3564446

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