一、研究背景乳腺癌是全世界女性中最常見的惡性腫瘤,也是女性癌癥相關(guān)死亡的主要原因。盡管乳腺癌的篩查、診斷和治療有所改善,但預后仍然很差。發(fā)生在癌變早期的基因特異性甲基化的改變有助于癌癥的早期檢測和預防。雖然有研究報道某些基因在乳腺癌中存在異常的DNA甲基化修飾,但這種基于基因表達譜芯片和甲基化芯片的綜合網(wǎng)絡圖譜及其功能通路仍然尚未揭示。全球乳腺癌發(fā)病率的持續(xù)上升,迫切需要尋找更敏感、更特異的乳腺癌發(fā)生發(fā)展相關(guān)的生物標記物,用于早期準確診斷和患者的預后分層。二、研究目的本研究旨在通過綜合的生物信息學分析鑒定乳腺癌發(fā)病相關(guān)的異常甲基化差異表達的生物標志物并探討相關(guān)的功能作用。三、研究方法首先,在GEO數(shù)據(jù)庫下載基因表達譜芯片GSE45827和DNA甲基化芯片GSE32393的數(shù)據(jù)。GSE45827數(shù)據(jù)中包含了 130例乳腺癌組織樣本和11個正常乳腺組織。甲基化芯片GSE32393數(shù)據(jù)中共有137例樣本,其中包括114例乳腺癌組織樣本和23個癌旁的正常組織。使用GE02R在線工具篩選GSE45827的差異表達基因（P-value<0.05且|log FC≥2.0）。對于甲基化芯片GSE... 

【文章來源】：南方醫(yī)科大學廣東省

【文章頁數(shù)】：65 頁

【學位級別】：碩士

【部分圖文】：

基因表達譜芯片05麟5827的數(shù)據(jù)信息.Fi創(chuàng).2一1Th.d.I面Isofge”.

一基因甲基化芯片GSE32393的數(shù)據(jù)信息.Fi即拍2一Thedetailsof郎nemotkylationprOfilingdataofGSE32393

Ｏｎｃｏｇｅｎｅ?ＴＳＧ??圖３－２確定異常甲基化修飾下差異表達的癌基因和抑癌基因。（Ａ）１８９個低甲基化修飾并且??表達上調(diào)的基因，其中１８個為癌基因。（Ｂ）２６３個高甲基化修飾并且表達下調(diào)的基因，其中??２１個抑癌基因。??Ｆｉｇｕｒｅ?３－２?Ｉｄｅｎｔｉｆｉｃａｔｉｏｎ?ｏｆ?ａｂｃｒｒａｎｔＫ?ｍｃｔｌｎ?ｌａｔｅｄ?ｄｉｆｆｅｒｅｎｔｉａｌｌｙ?ｅｘｐｒｅｓｓｅｄ?ｏｎｃｏｇｅｎｅｓ?ａｎｄ?ｔｕｍｏｒ??ｓｕｐｐｒｅｓｓｏｒ?ｇｅｎｅｓ?（ＴＳＧｓ）．?（Ａ）?Ａ?ｔｏｔａｌ?ｏｆ?１８９?ｈ＼ｐｏｍｅｔｌｎ?ｌａｔｅｄ?ｕｐｒｅｇｕｌａｔｃｄ?ｇｅｎｅｓ?ｗｅｒｅ?ｉｄｅｎｔｉｆｉｅｄ，??１８?ｏｆ?ｗｈｉｃｈ?ｗｅｒｅ?ｏｎｃｏｇｅｎｅｓ．?（Ｂ）?Ａ?ｔｏｔａｌ?ｏｆ?２６３?ｈ＼ｐｃｎｎｅｔ］ｎ?ｌａｔｅｄ?ｄｏｗｎｒｃｇｕｌａｔｅｄ?ｇｅｎｅｓ?ｗｅｒｅ??ｉｄｅｎｔｉｆｉｅｄ．?２１?ｏｆ?ｗｈｉｃｈ?ｗｅｒｅ?ＴＳＧｓ．??１６??


本文編號：3564414