蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能的探索是生命科學(xué)最重要的研究領(lǐng)域之一,對蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)的精確測定有助于在分子水平上深入了解生命過程,同時也將極大地推進(jìn)藥理學(xué)和藥物設(shè)計(jì)的發(fā)展。在蛋白質(zhì)晶體學(xué)中,直接法最初被應(yīng)用于確定重原子坐標(biāo)以及從頭測定原子分辨率的蛋白結(jié)構(gòu)。而通過將直接法與其他結(jié)構(gòu)分析方法相結(jié)合,可以在蛋白質(zhì)晶體學(xué)中開創(chuàng)出更多新的應(yīng)用�；诖它c(diǎn),本研究論文系統(tǒng)探索了直接法在低分辨蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)解析方面的幾項(xiàng)新應(yīng)用。在雙空間迭代的計(jì)算框架下,通過將直接法同多種解析方法結(jié)合,作者相繼完成了:（1）多套弱信號的單波長反常散射（SAD）數(shù)據(jù)的自動化解析;（2）提出直接法輔助的MAD/MIR相位推演雙空間迭代方法,并利用直接法成功實(shí)現(xiàn)了低分辨相位向高分辨母體數(shù)據(jù)的自動化擴(kuò)展和優(yōu)化（6.9埃到2.8埃和6.8埃到3.0埃）;（3）實(shí)現(xiàn)了低分辨膜蛋白晶體結(jié)構(gòu)的從頭測定和自動化建模,并提出一套完整的結(jié)構(gòu)解析方案。本論文分為6個章節(jié)的內(nèi)容,其中第一、二章是對蛋白質(zhì)晶體學(xué)和直接法相關(guān)的基礎(chǔ)知識的闡述。第三、四、五章則依次介紹了直接法在弱反常散射信號、低分辨蛋白質(zhì)晶體結(jié)構(gòu)解析方面的相關(guān)研究及重要應(yīng)用。第一章:引言。主要介紹了蛋... 

【文章來源】：中國科學(xué)院大學(xué)(中國科學(xué)院物理研究所)北京市

【文章頁數(shù)】：125 頁

【學(xué)位級別】：博士

【部分圖文】：

單對同晶置換法（SIR）中的相位雙解示意

圖 1.2 多對同晶置換法測定相位原理圖igure 1.2 Phase ambiguity in multi-isomorphous replacement method散射法riedel 定律晶體的 X 射線衍射時，一般可以不考慮非相干散射，而只關(guān)姆森散射（Thomson scattering）。當(dāng) X 射線照射晶體時，電場里，晶體內(nèi)部的電子將在原子核周圍進(jìn)行受迫振動，形源，并以球面波形式向不同方向散射。原子中的電子都處于波的頻率遠(yuǎn)大于電子的固有頻率時，經(jīng)典理論認(rèn)為，電子因振將與入射波有相同的頻率。情況下，假定電子的束縛能比 X 射線的光子能量小，每個

子多是由 C、H、O 等輕原子組成，對 X 射線的吸收效應(yīng)忽略 和 f ，但當(dāng)晶體中其中含有硒、鐵等重原子時，視。此時，對于指標(biāo)為hkl的衍射矢量hklH ，其結(jié)構(gòu)因子可( ) ( )( ) ( ) ( HHjNjjjNjjjojjNjjjojFFfiHrfiHrifiHrffifiHr === exp2exp2exp2exp2111為非中心對稱結(jié)構(gòu)，帶有反常散射效應(yīng)的晶體衍射數(shù)據(jù) 1.5 硒原子的反常散射實(shí)部及虛部貢獻(xiàn)隨 X 射線波長的變化Figure 1.5 The real and imaginary parts of abnormal scattering forselenium atom, plotted as a function of X-ray wavelength

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]結(jié)構(gòu)基因組學(xué)中的衍射相位問題[J]. 范海福,梁棟材.  生命科學(xué). 2003(02)
[2]符號關(guān)系式在測定含重原子晶體結(jié)構(gòu)中的應(yīng)用 Ⅰ.一個符號修正方案[J]. 范海福.  物理學(xué)報. 1965(06)
[3]符號關(guān)系式在測定含重原子晶體結(jié)構(gòu)中的應(yīng)用 Ⅱ.分量關(guān)系式及其應(yīng)用[J]. 范海福.  物理學(xué)報. 1965(06)



本文編號：3343148