瑞士乳桿菌是廣泛應(yīng)用于發(fā)酵乳制品生產(chǎn)的一種乳酸菌。在眾多的乳酸菌中,瑞士乳桿菌因其優(yōu)良的蛋白水解能力而受到關(guān)注。研究表明瑞士乳桿菌的蛋白水解特性存在差異性,但是瑞士乳桿菌的基因型與表型之間的相關(guān)性仍有待進(jìn)一步研究。本文以中國四川、云南、青海等地區(qū)采集的曲拉、發(fā)酵牦牛乳、乳扇、泡菜等傳統(tǒng)發(fā)酵食品及糞便樣品為對象,對樣品中的瑞士乳桿菌進(jìn)行分離、純化、鑒定和保藏。對分離出的38株瑞士乳桿菌進(jìn)行基因草圖測序,同時結(jié)合NCBI公布全基因組測序的12株瑞士乳桿菌基因序列進(jìn)行包括核心基因與泛基因分析、功能注釋等比較基因組學(xué)的研究,結(jié)果表明瑞士乳桿菌的基因組具有差異性,菌株具有794個同源基因,各自含有6¹96個特有基因。基于同源基因的系統(tǒng)發(fā)育樹構(gòu)建,發(fā)現(xiàn)瑞士乳桿菌存在地區(qū)聚類的趨勢,青海西寧與四川阿壩的菌株明顯聚集在不同的進(jìn)化分支。此外,瑞士乳桿菌的泛基因呈現(xiàn)開放型,仍存在基因水平轉(zhuǎn)移的可能。同源蛋白簇（COG）功能注釋結(jié)果表明不同瑞士乳桿菌的氨基酸轉(zhuǎn)運與代謝的基因數(shù)量存在較大差異。對瑞士乳桿菌蛋白水解基因的預(yù)測結(jié)果表明菌株編碼胞壁蛋白酶（CEP）的基因存在很大差異,而編碼肽酶... 

【文章來源】：江南大學(xué)江蘇省 211工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】：66 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

瑞士乳桿菌的蛋白水解系統(tǒng)

這些酶由 7 個功能結(jié)構(gòu)域組成（圖1-2）。從蛋白質(zhì) N 末端開始，CEP 包括前體結(jié)構(gòu)域（PP）、催化結(jié)構(gòu)域（PR）、插入結(jié)構(gòu)域（I）、結(jié)構(gòu)域 A、結(jié)構(gòu)域 B、螺旋結(jié)構(gòu)域（H）和親水結(jié)構(gòu)域（W）[39]。而瑞士乳桿菌和保加利亞乳桿菌在蛋白質(zhì)的 C 末端不存在錨定結(jié)構(gòu)域（AN）[41]。迄今已對多種乳酸菌的 CEP 進(jìn)行了表征，包括保加利亞乳桿菌的 PrtB[45]，干酪乳桿菌和乳酸乳球菌的 PrtP[46-48]，嗜熱鏈球菌的 PrtS[49]，鼠李糖和植物乳桿菌的 PrtR[50]以及瑞士乳桿菌的 PrtH[41]。大多數(shù)乳酸菌僅有一個 CEP，但在瑞士乳桿菌中已發(fā)現(xiàn)了四種不同的 PrtH 旁系同源基因（PrtH1，PrtH2

江南大學(xué)碩士學(xué)位論文基因組學(xué)分析統(tǒng)發(fā)育樹分析 50 株瑞士乳桿菌的直系同源構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹，結(jié)果如圖 3-1 所示。由圖 株瑞士乳桿菌可分為四個進(jìn)化分支，其中，V-GZTR-132-M1 獨占一個分6-6 和 R0052 為一個進(jìn)化分支，其余的 47 株瑞士乳桿菌共分為兩個進(jìn)化分離的菌株中，DYNDL25-2 與分離自瑞士干酪、常用作奶酪發(fā)酵劑的 DPC更為接近[10, 105]，而M2-10-R2M10、DYNDL68M7等12株瑞士乳桿菌與CN更接近，該菌株常用作商用發(fā)酵劑，能在牛乳發(fā)酵過程中產(chǎn)生生物活性肽

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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碩士論文
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本文編號：3329372