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功能化DNA納米結構在生物分析和生物模擬中的研究

發(fā)布時間:2021-07-15 07:12
  DNA納米技術以DNA的理化特性為基礎,結合現(xiàn)代納米技術和分子生物學技術,構建可操控、智能化的新型納米結構或納米機器。結構DNA納米技術以其精確的操控手段和多樣化的裝配方式,成為DNA納米技術領域中一個研究熱點,已在材料定向組裝、生物分析、生物催化、DNA計算機、疾病診斷和藥物運輸?shù)确矫娴玫綉。本論文開展了 DNA納米結構在生物分析和生物模擬中的研究。DNA四面體是一種剛性強度高和生物相容性好的DNA納米結構。結合DNA四面體結構和催化發(fā)夾組裝放大策略,構建CTDN探針并將其用于胞內(nèi)miR-21成像。CTDN探針可以在不需要轉(zhuǎn)染試劑的幫助下通過胞吞作用進入細胞,具有良好的生物相容性和酶抗性。同時,基于催化發(fā)夾組裝的信號放大策略,CTDN探針具有高度的靈敏性、選擇性。DNA-AuNPs納米結構是DNA與AuNPs基于金硫鍵或者非共價鍵作用結合形成的DNA納米結構。通過DNA與AuNPs的組裝成功構建五種不同的DNA分子機器(M1、M2、M3、M4、M5),每個機器由熵驅(qū)動的鏈置換反應提供動力;贒NA分子機器之間的相互通訊,構建三種不同化學反應網(wǎng)絡—級聯(lián)調(diào)節(jié)網(wǎng)絡、正反饋調(diào)節(jié)網(wǎng)絡和負反... 

【文章來源】:華東理工大學上海市 211工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】:85 頁

【學位級別】:碩士

【部分圖文】:

功能化DNA納米結構在生物分析和生物模擬中的研究


圖1.1同源雙鏈DNA自組裝

序列,納米結構,對稱性,工具


藥物遞送和生物模擬[I25]等方??面。這些不同形式的DNA納米結構主要分為靜態(tài)DNA納米結構和動態(tài)DNA納米結??構。??1.2.1靜態(tài)DNA納米結構??過去的30多年,結構DNA納米技術以驚人的速度發(fā)展。最重要的概念是將不可移??動的分支DNA連接通過粘性末端連接在一起,自組裝成具有不同性質(zhì)和功能的結構。??基于這種理念,研宄人員構建多種多樣的DNA納米結構。??Seeman課題組在兩股雙螺旋結構引入交叉結構,成功構建稱為Double?Crossover的??結構(DX)?如圖1.2所示。這種結構具有很好的穩(wěn)定性,可以通過粘性末端自組裝??成更復雜的結構。通過對結構單元進行功能化修飾,可以構建具有不同功能的結構。這??一研宄為后期DNA納米結構的發(fā)展奠定了基矗??八?X??/^5v/\?+4?+4?'?坤f:—r?V0〇3(>0Cv^????J?pi??X??圖1.2?(A)?DNA序列對稱性作為設計DNA納米結構的工具。??Fig.?1.2?(A)?DNA?sequence?symmetry?is?explored?as?a?tool?for?designing?DNA?nanostructures.??基于DX的結構,Winfree課題組構建了二維平面網(wǎng)格結構[27],如圖1.3.A所示,并??通過原子力顯微鏡對其成像。Mao課題組基于4x4基元的C4對稱性,結合序列對稱性??自組裝成大小為1mm的二維排列[28】。如圖1.3所示,這一工作證明大的二維陣列是可??

網(wǎng)格圖,納米,瓷磚,自組裝


華東理工大學碩士學位論文?第3頁??行的。序列對稱性是設計DNA納米結構的有力工具,可以顯著減小序列的大小和DNA??鏈的數(shù)量。這種簡化對于復雜結構的設計是非常重要的;诰框框架結構,Mao課題??組開發(fā)出一種通用的、不依賴于骨架鏈的構建方法,并成功組裝成平面晶格和多面體結??構[29]。如圖1.4所示,所得到的結構的邊緣由兩個兩端交叉的平行雙工組成。??:繼??議鬱■?^層■??圖1.3不同尺寸的DNA四面體結構。??Fig.?1.3?DNA?tetrahedron?with?different?sizes.??Yan課題組設計并構建一種由4x4瓷磚連接組成的DNA納米結構[3G]。如圖1.4所??示,4x4瓷磚的可編程自組裝形成兩種不同的晶格形態(tài):均勻?qū)挾鹊募{米帶和二維納米??網(wǎng)格,它們都顯示出具有周期性的方形空腔。周期性蛋白質(zhì)陣列是通過鏈霉親和素模板??自組裝到含有生物素化寡核苷酸的DNA納米網(wǎng)格上實現(xiàn)。在兩步金屬化工藝的基礎上,??4x4納米帶成為制備高導電、均勻?qū)挾鹊你y納米線的良好支架。??s?__腳國||||||11??c?i?ittf?+???—*??IIIIZEIL??_??500x500??sm?!5(hi50nm??圖1.4?DNA瓷磚自組裝DNA納米帶和納米網(wǎng)格。??Fig.?1.4?Self-assembly?of?DNA?nanoribbons?and?nanogrids?using?4X4?DNA?tile.??


本文編號:3285260

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