發(fā)布時間：2021-06-05 12:13

　　喜馬拉雅雪雞屬國家二級保護動物,是生存海拔最高的雞類,同時在維持生態(tài)平衡和鳥類高海拔適應性研究中具有重要的科研價值。本研究以東帕米爾高原喜馬拉雅雪雞為研究對象,采用直接測序法,拼接組裝獲得該物種線粒體（mtDNA）全基因組序列,對mtDNA全序列進行注釋和結構分析,并選擇GenBank已提交的雞形目鳥類mtDNA序列,利用鄰接法構建系統(tǒng)發(fā)育樹,為該物種的有效保護和開發(fā)利用提供分子水平的依據(jù)。結果表明:喜馬拉雅雪雞的mtDNA全長為16 691 bp,基因種類、數(shù)量及排列順序與鳥類線粒體基因典型排列順序一致�；蚪M核苷酸含量為A:30.2%;T:23.9%;C:32.2%;G:13.8%;（A+T）含量（54%）略高于G+C （46%）含量,AT-skew為0.116 7,有一定的堿基偏好。在本研究中,東帕米爾高原喜馬拉雅雪雞起始密碼子以ATG為主,終止密碼子以TAA為主。預測了22個tRNA的二級結構,均能形成典型的三葉草結構,共有錯配25處,以GU錯配為主,喜馬拉雅雪雞tRNASer （UCN）基因比藏雪雞的tRNASer （UCN）基因多出3個堿基;系統(tǒng)發(fā)育樹構建表明雪雞與鵪鶉關系... 

【文章來源】：基因組學與應用生物學. 2020,39(05)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：11 頁

【部分圖文】：

相關基因蛋白網(wǎng)絡

CK-vs-T24 DEGs GO注釋

CK-vs-T48DEGs GO注釋

【參考文獻】：
期刊論文
[1]基于高通量測序技術分析番鴨呼腸孤病毒感染雛番鴨腸道轉錄組學的變化[J]. 李鴻文,黃詩杭,駱鈺,吳曉平,王全溪,李健,黃一帆,吳異健.  病毒學報. 2019(02)
[2]番鴨呼腸孤病毒感染對雛番鴨腸黏膜組織結構及腸道免疫細胞的影響[J]. 吳異健,姜慧慧,黃麗娜,朱二鵬,周五朵,王全溪,吳曉平,李健,吳寶成,黃一帆.  中國預防獸醫(yī)學報. 2018(05)
[3]東帕米爾高原喜馬拉雅雪雞遺傳多樣性及系統(tǒng)發(fā)育地位[J]. 王玉濤,潘建飛,黃翠翠,胡平,韓建林.  生態(tài)學報. 2018(01)
[4]鴨腸炎病毒感染鴨脾臟的轉錄組分析[J]. 吳良濤,鄭敏,華敏,萬潤,程振濤,周碧君,文明.  病毒學報. 2017(03)
[5]猴頭菇多糖對呼腸孤病毒感染番鴨腸道黏膜免疫及抗氧化能力的影響[J]. 黃麗娜,姜慧慧,王潔,高婷,張葉飛,吳寶成,吳異健,黃一帆.  畜牧獸醫(yī)學報. 2015(09)
[6]家禽的黏膜免疫研究及功能[J]. 李春松,戴晉軍,李彪.  國外畜牧學(豬與禽). 2012(07)
[7]新一代測序技術在植物轉錄組研究中的應用[J]. 梁燁,陳雙燕,劉公社.  遺傳. 2011(12)
[8]雞形目鳥類系統(tǒng)發(fā)生研究現(xiàn)狀[J]. 包新康,劉迺發(fā),顧海軍,周曉雯.  動物分類學報. 2008(04)
[9]暗腹雪雞染色體的核型分析[J]. 李紅燕,王金富,劉凱.  石河子大學學報(自然科學版). 2006(03)
[10]暗腹雪雞細胞色素b基因的克隆及其在雉科中親緣關系的分析[J]. 劉強,吳敏,張琳麟,李悅.  浙江大學學報(理學版). 2006(01)

博士論文
[1]番鴨呼腸孤病毒感染的分子致病機制的轉錄組學研究[D]. 王全溪.福建師范大學 2015
[2]喜馬拉雅雪雞的分子系統(tǒng)地理學研究[D]. 王小立.蘭州大學 2012

碩士論文
[1]鴨應對DEV感染的主要免疫基因篩選[D]. 吳良濤.貴州大學 2017



本文編號：3212145