為探究轉(zhuǎn)錄因子GbTCP27在棉花纖維發(fā)育中的作用,使用RT-PCR技術(shù)從海島棉‘新海21號’中克隆GbTCP27,并對其進行生物信息學和表達特性分析。結(jié)果表明,該基因有1個1 017 bp的開放閱讀框,編碼338個氨基酸,預(yù)測分子量約為35.37 ku,等電點為9.08,分子式為C₁₅₄₉H₂₅₁₁N₄₃₉O₄₈₃S₁₁,序列中含有一個高度保守的TCP結(jié)構(gòu)域;氨基酸序列對比表明,海島棉GbTCP27基因在進化過程中是相當保守的,蛋白序列與其他植物中的TCP蛋白序列有較高的一致性;亞細胞定位結(jié)果顯示,GbTCP27屬于核定位基因,推測GbTCP27可能在復(fù)制和轉(zhuǎn)錄的過程中發(fā)揮作用;進化樹分析表明,海島棉GbTCP27基因與亞洲棉GaTCP9基因分布在同一分支上;實時熒光定量PCR表明,GbTCP27基因在開花當天的花瓣和開花當天的胚珠中表達量最高;綜上所述,GbTCP27轉(zhuǎn)錄因子可能參與棉花纖維起始期胚珠表皮細胞的發(fā)育。 

【文章來源】：中國農(nóng)業(yè)大學學報. 2020,25(02)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：10 頁

【部分圖文】：

棉花GbTCP27基因PCR產(chǎn)物電泳分析

海島棉GbTCP27與雷蒙德氏棉GrTCP9(XP_012489844.1)之間進行氨基酸序列比對,其相似性為98.22%。與亞洲棉GaTCP9(XP_017630785.1)氨基酸序列的相似性為100%,與陸地棉GhTCP9(XP_016695435.1)的相似性為97.63%,結(jié)果顯示海島棉中的GbTCP27基因與亞洲棉的GaTCP9的相似性最高,說明GbTCP27基因可能來源于亞洲棉基因組,進一步表明TCP基因從二倍體棉花進化成四倍體棉花時序列的保守性非常高。圖3 GbTCP27蛋白磷酸化位點預(yù)測

GbTCP27蛋白磷酸化位點預(yù)測

【參考文獻】：
期刊論文
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本文編號：3209373