為探究轉(zhuǎn)錄因子GbTCP27在棉花纖維發(fā)育中的作用,使用RT-PCR技術(shù)從海島棉‘新海21號(hào)’中克隆GbTCP27,并對(duì)其進(jìn)行生物信息學(xué)和表達(dá)特性分析。結(jié)果表明,該基因有1個(gè)1 017 bp的開(kāi)放閱讀框,編碼338個(gè)氨基酸,預(yù)測(cè)分子量約為35.37 ku,等電點(diǎn)為9.08,分子式為C₁₅₄₉H₂₅₁₁N₄₃₉O₄₈₃S₁₁,序列中含有一個(gè)高度保守的TCP結(jié)構(gòu)域;氨基酸序列對(duì)比表明,海島棉GbTCP27基因在進(jìn)化過(guò)程中是相當(dāng)保守的,蛋白序列與其他植物中的TCP蛋白序列有較高的一致性;亞細(xì)胞定位結(jié)果顯示,GbTCP27屬于核定位基因,推測(cè)GbTCP27可能在復(fù)制和轉(zhuǎn)錄的過(guò)程中發(fā)揮作用;進(jìn)化樹(shù)分析表明,海島棉GbTCP27基因與亞洲棉GaTCP9基因分布在同一分支上;實(shí)時(shí)熒光定量PCR表明,GbTCP27基因在開(kāi)花當(dāng)天的花瓣和開(kāi)花當(dāng)天的胚珠中表達(dá)量最高;綜上所述,GbTCP27轉(zhuǎn)錄因子可能參與棉花纖維起始期胚珠表皮細(xì)胞的發(fā)育。 

【文章來(lái)源】：中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2020,25(02)北大核心CSCD

【文章頁(yè)數(shù)】：10 頁(yè)

【部分圖文】：

棉花GbTCP27基因PCR產(chǎn)物電泳分析

海島棉GbTCP27與雷蒙德氏棉GrTCP9(XP_012489844.1)之間進(jìn)行氨基酸序列比對(duì),其相似性為98.22%。與亞洲棉GaTCP9(XP_017630785.1)氨基酸序列的相似性為100%,與陸地棉GhTCP9(XP_016695435.1)的相似性為97.63%,結(jié)果顯示海島棉中的GbTCP27基因與亞洲棉的GaTCP9的相似性最高,說(shuō)明GbTCP27基因可能來(lái)源于亞洲棉基因組,進(jìn)一步表明TCP基因從二倍體棉花進(jìn)化成四倍體棉花時(shí)序列的保守性非常高。圖3 GbTCP27蛋白磷酸化位點(diǎn)預(yù)測(cè)

GbTCP27蛋白磷酸化位點(diǎn)預(yù)測(cè)

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]棉花纖維品質(zhì)改良相關(guān)基因研究進(jìn)展[J]. 楊君,馬峙英,王省芬.  中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué). 2016(22)
[2]我國(guó)棉花生產(chǎn)現(xiàn)狀與發(fā)展趨勢(shì)[J]. 喻樹(shù)迅.  中國(guó)工程科學(xué). 2013(04)
[3]陸地棉干旱脅迫響應(yīng)基因GhGR的克隆及特征分析[J]. 宋貴方,樊偉麗,王俊娟,王德龍,王帥,周凱,葉武威.  中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué). 2012(08)



本文編號(hào)：3209373