PGC7與其互作的RBBP4、HDAC1蛋白在Dlk1-Dio3印記區(qū)調(diào)控中的作用
發(fā)布時(shí)間:2021-05-25 12:09
PGC7又稱Dppa3或Stella,是一個(gè)在早期胚胎發(fā)育過(guò)程中維持印記的母源效應(yīng)因子,還是一個(gè)能通過(guò)調(diào)節(jié)印記基因表達(dá)促進(jìn)細(xì)胞多能性維持及重編程過(guò)程發(fā)生的小蛋白。該蛋白在小鼠中只有150個(gè)氨基酸而且是一個(gè)非折疊結(jié)構(gòu)的蛋白,能與多種具有功能的蛋白質(zhì)結(jié)合來(lái)發(fā)揮功能。HDAC1/2-RBBP4/7復(fù)合物由去乙;窰DAC1/2和組蛋白伴侶RBBP4/7組成,該復(fù)合物能與其他蛋白結(jié)合組成更大的蛋白復(fù)合物發(fā)揮功能。Dlk1-Dio3印記區(qū)是研究哺乳動(dòng)物印記調(diào)控的理想模型,且參與干細(xì)胞水平以及多種疾病發(fā)病機(jī)理的細(xì)胞生物學(xué)過(guò)程,甚至該區(qū)域長(zhǎng)非編碼RNA是否正確表達(dá)可以判定誘導(dǎo)多能干細(xì)胞的全分化潛能。本研究分析PGC7蛋白質(zhì)譜數(shù)據(jù)發(fā)現(xiàn)RBBP4為潛在的PGC7相互作用蛋白,首先確定了兩者的互作及細(xì)胞內(nèi)定位并通過(guò)ChIP-qPCR檢測(cè)兩者在Dlk1-Dio3基因簇主要甲基化調(diào)控區(qū)域IG-DMR的結(jié)合情況。進(jìn)一步構(gòu)建了穩(wěn)定敲降RBBP4的小鼠F9細(xì)胞系,通過(guò)實(shí)時(shí)熒光定量PCR發(fā)現(xiàn)RBBP4敲降后會(huì)導(dǎo)致印記基因Dlk1、Meg3、Peg10和Rasgrf的mRNA水平表達(dá)顯著下降。亞硫酸氫鹽DNA甲基化測(cè)...
【文章來(lái)源】:西北農(nóng)林科技大學(xué)陜西省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:88 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
第一章 文獻(xiàn)綜述
1.1 PGC7蛋白研究進(jìn)展
1.1.1 PGC7的基本生物特性
1.1.2 PGC7保護(hù)母源基因組和印記位點(diǎn)
1.1.3 PGC7促進(jìn)細(xì)胞多能性維持
1.1.4 PGC7促進(jìn)體細(xì)胞重編程
1.2 Dlk1-Dio3印記調(diào)控區(qū)
1.3 印記調(diào)控與細(xì)胞多能性
1.4 RBBP4蛋白研究進(jìn)展
1.5 HDAC1/2-RBBP4/7蛋白復(fù)合物
1.6 組蛋白去乙;cDNA甲基化
第二章 RBBP4與PGC7互作驗(yàn)證及共定位分析
2.1 材料與方法
2.1.1 材料
2.1.2 主要儀器、試劑及溶液配制
2.1.3 方法
2.2 試驗(yàn)結(jié)果
2.2.1 目的片段擴(kuò)增結(jié)果
2.2.2 PGC7與RBBP4互作驗(yàn)證結(jié)果
2.2.4 PGC7與RBBP4蛋白共定位分析
2.3 討論
2.4 小結(jié)
第三章 PGC7與RBBP4對(duì)Dlk1-Dio3印記區(qū)的調(diào)控
3.1 材料與試劑
3.1.1 材料
3.1.2 主要儀器、試劑及溶液配制
3.2 試驗(yàn)方法
3.2.1 染色質(zhì)免疫共沉淀(Chromatin Immunoprecipitation,Ch IP)
3.2.2 RBBP4穩(wěn)定敲降小鼠F9細(xì)胞系獲得
3.2.3 實(shí)時(shí)定量PCR(quantitative real-time PCR)
3.2.4 DNA甲基化檢測(cè)(亞硫酸氫鹽修飾后測(cè)序法)
3.2.5 堿性磷酸酶染色(Alkaline Phosphatase,AP染色)
3.2.6 CCK細(xì)胞增殖實(shí)驗(yàn)
3.3 試驗(yàn)結(jié)果
3.3.1 PGC7與RBBP4蛋白在Dlk1-Dio3印記區(qū)IG-DMR結(jié)合驗(yàn)證
3.3.2 RBBP4單等位基因敲除小鼠F9 細(xì)胞系鑒定
3.3.3 RBBP4敲降對(duì)印記基因表達(dá)影響
3.3.4 RBBP4敲降對(duì)Dlk1-DMR和Meg3-DMR甲基化影響
3.3.5 RBBP4敲降對(duì)整體DNA甲基化水平影響
3.3.6 RBBP4敲降對(duì)組蛋白H4乙;绊
3.3.7 RBBP4對(duì)細(xì)胞多能性的影響
3.3.8 RBBP4與PGC7對(duì)細(xì)胞增殖的影響
3.4 討論
3.5 小結(jié)
第四章 PGC7對(duì)HDAC1/2-RBBP4/7復(fù)合物互作影響
4.1 材料與方法
4.1.1 材料
4.1.2 主要儀器、試劑及溶液配制
4.1.3 方法
4.2 試驗(yàn)結(jié)果
4.2.1 Hdac1、Hdac2、Rbbp7 基因PCR擴(kuò)增
4.2.2 Hdac1、Hdac2、Rbbp7 真核表達(dá)載體雙酶切驗(yàn)證
4.2.3 PGC7分別與HDAC1、HDAC2、RBBP7互作驗(yàn)證
4.2.4 PGC7加入對(duì)HDAC1/2-RBBP4/7復(fù)合物自身相互作用的影響
4.3 討論
4.4 小結(jié)
第五章 PGC7與HDAC1對(duì)Dlk1-Dio3印記區(qū)的調(diào)控
5.1 材料與方法
5.1.1 材料
5.1.2 主要儀器、試劑及溶液配制
5.1.3 方法
5.2 結(jié)果
5.2.1 PGC7與HDAC1在小鼠F9 細(xì)胞中的定位
5.2.2 HDAC1在Dlk1-Dio3印記調(diào)控區(qū)IG-DMR結(jié)合情況
5.2.3 PGC7干擾對(duì)HDAC1在Dlk1-Dio3調(diào)控區(qū)IG-DMR結(jié)合影響
5.2.4 PGC7和HDAC1對(duì)Dlk1、Meg3表達(dá)影響
5.3 討論
5.4 小結(jié)
全文總結(jié)
參考文獻(xiàn)
附錄A 引物序列
附錄B 真核表達(dá)質(zhì)粒載體骨架圖譜
致謝
作者簡(jiǎn)介
本文編號(hào):3205317
【文章來(lái)源】:西北農(nóng)林科技大學(xué)陜西省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:88 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
第一章 文獻(xiàn)綜述
1.1 PGC7蛋白研究進(jìn)展
1.1.1 PGC7的基本生物特性
1.1.2 PGC7保護(hù)母源基因組和印記位點(diǎn)
1.1.3 PGC7促進(jìn)細(xì)胞多能性維持
1.1.4 PGC7促進(jìn)體細(xì)胞重編程
1.2 Dlk1-Dio3印記調(diào)控區(qū)
1.3 印記調(diào)控與細(xì)胞多能性
1.4 RBBP4蛋白研究進(jìn)展
1.5 HDAC1/2-RBBP4/7蛋白復(fù)合物
1.6 組蛋白去乙;cDNA甲基化
第二章 RBBP4與PGC7互作驗(yàn)證及共定位分析
2.1 材料與方法
2.1.1 材料
2.1.2 主要儀器、試劑及溶液配制
2.1.3 方法
2.2 試驗(yàn)結(jié)果
2.2.1 目的片段擴(kuò)增結(jié)果
2.2.2 PGC7與RBBP4互作驗(yàn)證結(jié)果
2.2.4 PGC7與RBBP4蛋白共定位分析
2.3 討論
2.4 小結(jié)
第三章 PGC7與RBBP4對(duì)Dlk1-Dio3印記區(qū)的調(diào)控
3.1 材料與試劑
3.1.1 材料
3.1.2 主要儀器、試劑及溶液配制
3.2 試驗(yàn)方法
3.2.1 染色質(zhì)免疫共沉淀(Chromatin Immunoprecipitation,Ch IP)
3.2.2 RBBP4穩(wěn)定敲降小鼠F9細(xì)胞系獲得
3.2.3 實(shí)時(shí)定量PCR(quantitative real-time PCR)
3.2.4 DNA甲基化檢測(cè)(亞硫酸氫鹽修飾后測(cè)序法)
3.2.5 堿性磷酸酶染色(Alkaline Phosphatase,AP染色)
3.2.6 CCK細(xì)胞增殖實(shí)驗(yàn)
3.3 試驗(yàn)結(jié)果
3.3.1 PGC7與RBBP4蛋白在Dlk1-Dio3印記區(qū)IG-DMR結(jié)合驗(yàn)證
3.3.2 RBBP4單等位基因敲除小鼠F9 細(xì)胞系鑒定
3.3.3 RBBP4敲降對(duì)印記基因表達(dá)影響
3.3.4 RBBP4敲降對(duì)Dlk1-DMR和Meg3-DMR甲基化影響
3.3.5 RBBP4敲降對(duì)整體DNA甲基化水平影響
3.3.6 RBBP4敲降對(duì)組蛋白H4乙;绊
3.3.7 RBBP4對(duì)細(xì)胞多能性的影響
3.3.8 RBBP4與PGC7對(duì)細(xì)胞增殖的影響
3.4 討論
3.5 小結(jié)
第四章 PGC7對(duì)HDAC1/2-RBBP4/7復(fù)合物互作影響
4.1 材料與方法
4.1.1 材料
4.1.2 主要儀器、試劑及溶液配制
4.1.3 方法
4.2 試驗(yàn)結(jié)果
4.2.1 Hdac1、Hdac2、Rbbp7 基因PCR擴(kuò)增
4.2.2 Hdac1、Hdac2、Rbbp7 真核表達(dá)載體雙酶切驗(yàn)證
4.2.3 PGC7分別與HDAC1、HDAC2、RBBP7互作驗(yàn)證
4.2.4 PGC7加入對(duì)HDAC1/2-RBBP4/7復(fù)合物自身相互作用的影響
4.3 討論
4.4 小結(jié)
第五章 PGC7與HDAC1對(duì)Dlk1-Dio3印記區(qū)的調(diào)控
5.1 材料與方法
5.1.1 材料
5.1.2 主要儀器、試劑及溶液配制
5.1.3 方法
5.2 結(jié)果
5.2.1 PGC7與HDAC1在小鼠F9 細(xì)胞中的定位
5.2.2 HDAC1在Dlk1-Dio3印記調(diào)控區(qū)IG-DMR結(jié)合情況
5.2.3 PGC7干擾對(duì)HDAC1在Dlk1-Dio3調(diào)控區(qū)IG-DMR結(jié)合影響
5.2.4 PGC7和HDAC1對(duì)Dlk1、Meg3表達(dá)影響
5.3 討論
5.4 小結(jié)
全文總結(jié)
參考文獻(xiàn)
附錄A 引物序列
附錄B 真核表達(dá)質(zhì)粒載體骨架圖譜
致謝
作者簡(jiǎn)介
本文編號(hào):3205317
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