廣義爵床屬隸屬于爵床科爵床亞族,是爵床科的第一大屬,廣泛分布于熱帶、亞熱帶地區(qū),亞洲為其主要分布中心之一。由于爵床屬分布廣,種間形態(tài)差異大,在屬的范圍上存在爭議,其系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系迄今為止仍未得到有效解決。葉綠體基因組為母系遺傳,在被子植物中高度保守,其基因組序列簡單易比較,因此非常適用于植物系統(tǒng)發(fā)育研究。本研究旨在通過基因組淺層測序技術(shù),對亞洲79種爵床屬植物的葉綠體全基因組序列進行組裝,比較爵床屬不同基因組間的差異,重建亞洲廣義爵床屬系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系,最終解決亞洲廣義爵床屬在屬的界定上存在的問題。主要的研究結(jié)果如下:（1）79種廣義爵床屬葉綠體基因組均為閉合環(huán)狀,總長度在148,218-156,819 bp之間,表現(xiàn)為一個典型的四分體結(jié)構(gòu):由一個大單拷貝區(qū)（large single copy region,LSC）,一個小單拷貝區(qū)（small single copy region,SSC）以及一對反向重復(fù)區(qū)（inverted repeat,IR）組成。LSC區(qū)長度在81,434-84,088 bp之間,SSC區(qū)長度在984-17,533 bp之間,IR區(qū)長度在24,791-36,935 b... 

【文章來源】：南京林業(yè)大學(xué)江蘇省

【文章頁數(shù)】：152 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【文章目錄】：
致謝
摘要
abstract
前言
第一章 爵床屬的研究概況
    1.1 爵床屬研究背景
        1.1.1 爵床屬基本特征及分布
        1.1.2 爵床屬分類簡史
        1.1.3 爵床屬的系統(tǒng)位置
    1.2 葉綠體基因組研究概況
        1.2.1 葉綠體起源及基本特征
        1.2.2 葉綠體基因組測序技術(shù)發(fā)展現(xiàn)狀
        1.2.3 葉綠體系統(tǒng)發(fā)育基因組學(xué)研究概況
        1.2.4 爵床屬葉綠體基因組研究進展
    1.3 本研究的目的及意義
第二章 爵床屬葉綠體基因組基本特征
    2.1 實驗材料與方法
        2.1.1 實驗材料
        2.1.2 實驗方法
        2.1.3 葉綠體基因組組裝
        2.1.4 分析方法
    2.2 研究結(jié)果
        2.2.1 亞洲廣義爵床屬葉綠體基因組基本特征
        2.2.2 亞洲廣義爵床屬葉綠體基因組結(jié)構(gòu)比較
        2.2.3 葉綠體基因組重復(fù)序列比較分析
        2.2.4 選擇壓力分析
    2.3 討論
        2.3.1 葉綠體基因組成
        2.3.2 葉綠體基因組基本結(jié)構(gòu)與差異
        2.3.3 葉綠體基因組重復(fù)序列比較
        2.3.4 編碼基因核苷酸替代率
第三章 亞洲廣義爵床屬系統(tǒng)發(fā)育分析
    3.1 實驗材料與方法
        3.1.1 實驗材料
        3.1.2 核基因序列拼接
        3.1.3 亞洲廣義爵床屬系統(tǒng)發(fā)育研究
    3.2 研究結(jié)果
        3.2.1 葉綠體全基因組系統(tǒng)發(fā)育分析
        3.2.2 形態(tài)性狀祖先狀態(tài)重建
        3.2.3 基于五個片段的亞洲廣義爵床屬系統(tǒng)發(fā)育重建
    3.3 討論
        3.3.1 爵床族各亞族間系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系
        3.3.2 亞洲廣義爵床屬系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系
        3.3.3 亞洲廣義爵床屬分類處理
第四章 總結(jié)與展望
    4.1 總結(jié)
    4.2 展望
攻讀學(xué)位期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文
參考文獻


【參考文獻】：
期刊論文
[1]Wuacanthus（Acanthaceae）,a new Chinese endemic genus segregated from Justicia（Acanthaceae）[J]. Yunfei Deng,Chunming Gao,Nianhe Xia,Hua Peng.  Plant Diversity. 2016(06)
[2]基于葉綠體DNA ndhA和nrDNA ITS序列變異分析栽培柿及其近緣種親緣關(guān)系[J]. 傅建敏,梁晉軍,烏云塔娜,梁玉琴,孫鵬,李芳東.  植物研究. 2015(04)
[3]爵床屬植物的化學(xué)成分和藥理活性研究進展[J]. 劉文坤,陳思強,邵明國,羅永明,楊美華.  天然產(chǎn)物研究與開發(fā). 2012(04)



本文編號：3171457