內(nèi)含子序列通過與相應(yīng)mRNA序列的匹配參與基因表達(dá)調(diào)控。采用Smith-Waterman局部比對方法,以擬南芥全基因組基因序列為基礎(chǔ),獲得了內(nèi)含子序列與其對應(yīng)的外顯子連接序列的最佳匹配片段。為了揭示兩者之間的序列匹配特征,給出匹配頻率在外顯子序列上的分布。研究發(fā)現(xiàn),匹配頻率分布在外顯子的邊界存在顯著差異,長內(nèi)含子序列和第一個(gè)內(nèi)含子序列對外顯子連接序列的分布偏好明顯區(qū)別于其他內(nèi)含子序列。對于長片段、低GC含量以及高配對率的最佳匹配片段在外顯子連接序列上游EJC（exon-exon junction complex）結(jié)合區(qū)域分布有明顯的最小值。結(jié)果顯示內(nèi)含子序列和編碼序列存在共同進(jìn)化關(guān)系。 

【文章來源】：內(nèi)蒙古大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2020,51(02)北大核心

【文章頁數(shù)】：6 頁

【文章目錄】：
1 數(shù)據(jù)與方法
2 結(jié)果與分析
    2.1 內(nèi)含子位置和長度對EJC的影響
    2.2 最佳匹配區(qū)域的GC含量對F值的影響
    2.3 最佳匹配片段的長度對F值的影響
    2.4 最佳匹配區(qū)域配對率對F值的影響
3 討論


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]果蠅成熟mRNA序列與其相應(yīng)內(nèi)含子序列的匹配特征分析[J]. 薄素玲,李宏,張強(qiáng),楊振華,包通嘎拉,應(yīng)智強(qiáng),趙小慶.  內(nèi)蒙古大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2018(06)
[2]基因外顯子連接序列與相應(yīng)內(nèi)含子序列的相互作用[J]. 張強(qiáng),李宏,趙小慶,許士華.  生物信息學(xué). 2013(03)
[3]線蟲核糖核蛋白基因內(nèi)含子與相應(yīng)編碼序列的相互作用[J]. 趙小慶,李宏,包通拉嘎.  生物化學(xué)與生物物理進(jìn)展. 2010(09)



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