二倍體水稻基因組上存在大量的轉(zhuǎn)座元件序列,本研究利用生物信息學(xué)方法,將已獲得的日本晴、93-11水稻的三組水稻全基因組序列進(jìn)行比對(duì),利用RESite方法在三組數(shù)據(jù)的差異性片段中篩選出具有微小倒置重復(fù)序列元件（miniature inverted-repeat transposable element,MITE）序列結(jié)構(gòu)的 334 候選序列,選用水稻花藥培養(yǎng)的手段應(yīng)用轉(zhuǎn)座子顯示技術(shù)證明了單拷貝序列UC23、UC30、UC35單拷貝序列具有潛在的轉(zhuǎn)座活性。又通過(guò)放寬篩選生物信息學(xué)的方法,重計(jì)算了存在于三組水稻全基因組序列中基因區(qū)內(nèi)的差異MITE序列群,得到了一個(gè)大容量的候選MITE序列集合;在秈稻、粳稻和野生稻中比較了同源基因座位上同一轉(zhuǎn)座元件的序列組成結(jié)構(gòu)的多態(tài)性,獲取了轉(zhuǎn)座后發(fā)生重組事件的時(shí)空特征信息,證明了轉(zhuǎn)座事件引發(fā)的重組可以在不同的時(shí)空發(fā)生。 

【文章來(lái)源】：浙江大學(xué)浙江省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁(yè)數(shù)】：82 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

圖２轉(zhuǎn)座后重組的示意圖??Ｆｉｇｕｒｅ?２?Ｔｈｅ?ｒｅａｒｒａｎｇｅｍｅｎｔ?ａｆｔｅｒ?ｔｒａｎｓｐｐｏｓｉｔｉｏｎ??

但是在不同的物種的基因組上含量并不相同，甚至有較大的區(qū)別，隨著許多植物??基因組測(cè)序的完成，研究發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)座元件在基因組上的含量與其基因組的大小有一??定的正相關(guān)性，目前在已經(jīng)完成基因組測(cè)序的物種（圖１．２）擬南芥ＱｒａｈＷｏ／ｗｂ??短花藥野生稻桃（／Ｖｗｍ／ｓ／ｊｅｎ＇／ｃｆｌ）白菜??ｒａ／ｗ）、栽培水稻（＾〇如（７）、香蕉（Ｍｗ如?Ｇｃｗ／ｗ＞？ａ／ａ）、高粱（５ｂ巧／ｗｗ?６／ｃｏ／ｏｒ）、??玉米（及＜３肌於）、烏拉爾圖小麥（７Ｗ＂ｃｗ／ｗｗｒａｍ／）、挪威云杉（尸／ｃｅａａ＾／ｅｓ）、和??大麥（ｖｚ也ａ作）等，基因組大小分別為丨２５Ｍｂ、２６丨Ｍｂ、２６５Ｍｂ、２８３．８Ｍｂ、??４３０Ｍｂ、５３２Ｍｂ、８００Ｍｂ、２３００Ｍｂ、４９４０Ｍｂ、１９６００Ｍｂ、５１０００Ｍｂ１７４１，具有相??對(duì)較小的基因組的擬南芥、白菜和水稻轉(zhuǎn)座元件所占的比例分別為丨〇％、３９．５％、??和４６％，而在玉米、挪威云杉和大麥基因組較大的植物中轉(zhuǎn)座元件所占的比例分??別為８５％、７２％和８２％［１ＭＧ１，并且在不同的物種中各類轉(zhuǎn)座元件所占的相對(duì)含量??也不同［２１］。數(shù)量如此巨大的轉(zhuǎn)座元件，并不是都有轉(zhuǎn)座活性，轉(zhuǎn)座元件又分為??自主元件和非自主元件。自主轉(zhuǎn)座元件，也就是可以利用自身編碼的轉(zhuǎn)座酶進(jìn)行??轉(zhuǎn)座的元件，該類元件結(jié)構(gòu)完整，具有編碼完整轉(zhuǎn)座酶的開放閱讀框，所編碼的??轉(zhuǎn)座酶可以促使自身發(fā)生轉(zhuǎn)座

轉(zhuǎn)座元件的括入對(duì)羞因緒構(gòu)和功能的影響七Figurel.3St}ncumalandfanctitsnal曲s

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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